25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7772 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_7772  putative integral membrane protein  100 
 
 		 344 aa  681    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5364  hypothetical protein  31.79 
 
 		 352 aa  90.1  4e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1024  hypothetical protein  29.47 
 
 		 336 aa  88.6  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.379337  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2768  integral membrane protein  31.02 
 
 		 339 aa  84  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2812  integral membrane protein  31.02 
 
 		 339 aa  84  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.382635  normal  0.173588 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2795  integral membrane protein  31.02 
 
 		 339 aa  84  0.000000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.820737  normal  0.940856 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3056  integral membrane protein  29.68 
 
 		 353 aa  83.2  0.000000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.388265  normal  0.251034 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6229  hypothetical protein  27.37 
 
 		 367 aa  80.9  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.540475  normal  0.839871 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3330  integral membrane protein  30.9 
 
 		 356 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0177609 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2676  hypothetical protein  23.56 
 
 		 344 aa  73.6  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.213372  normal  0.2716 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0640  hypothetical protein  27.55 
 
 		 337 aa  73.6  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.21578 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1091  hypothetical protein  29.43 
 
 		 343 aa  72.4  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.214975  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2250  hypothetical protein  27.88 
 
 		 313 aa  69.7  0.00000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.052071  normal  0.051956 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0462  hypothetical protein  27.76 
 
 		 335 aa  62.4  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0458  hypothetical protein  25.72 
 
 		 333 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0959  hypothetical protein  26.61 
 
 		 623 aa  52.4  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00543894  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0471  hypothetical protein  24.09 
 
 		 333 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.462076  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0482  hypothetical protein  24.09 
 
 		 333 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1501  hypothetical protein  29.45 
 
 		 887 aa  48.5  0.0002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1246  hypothetical protein  32.45 
 
 		 876 aa  48.1  0.0002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1013  hypothetical protein  29.64 
 
 		 337 aa  45.8  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0109  hypothetical protein  22.91 
 
 		 797 aa  45.8  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.410499  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10181  transmembrane protein  35.87 
 
 		 452 aa  44.7  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0499  YhgE/Pip N-terminal domain protein  42.11 
 
 		 876 aa  43.5  0.006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2262  phage infection protein  25 
 
 		 954 aa  42.7  0.009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>