23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_0482 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0471  hypothetical protein  100 
 
 
333 aa  640    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.462076  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0482  hypothetical protein  100 
 
 
333 aa  640    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0458  hypothetical protein  98.2 
 
 
333 aa  627  1e-178  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0640  hypothetical protein  64.46 
 
 
337 aa  390  1e-107  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.21578 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0254  hypothetical protein  67.1 
 
 
337 aa  310  2e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2676  hypothetical protein  42.69 
 
 
344 aa  224  2e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.213372  normal  0.2716 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1024  hypothetical protein  42.11 
 
 
336 aa  208  8e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.379337  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6229  hypothetical protein  37.54 
 
 
367 aa  181  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.540475  normal  0.839871 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1091  hypothetical protein  37.54 
 
 
343 aa  158  1e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.214975  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0462  hypothetical protein  38.18 
 
 
335 aa  157  3e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1013  hypothetical protein  41.46 
 
 
337 aa  143  4e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1427  hypothetical protein  38.26 
 
 
339 aa  129  7.000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.351861  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4875  hypothetical protein  34.7 
 
 
388 aa  104  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.401748 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2613  hypothetical protein  35.12 
 
 
399 aa  102  1e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00181742  normal  0.271812 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2250  hypothetical protein  31.85 
 
 
313 aa  91.7  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.052071  normal  0.051956 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2795  integral membrane protein  30.42 
 
 
339 aa  89.7  7e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.820737  normal  0.940856 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3330  integral membrane protein  29.55 
 
 
356 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0177609 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2812  integral membrane protein  30.42 
 
 
339 aa  89  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.382635  normal  0.173588 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2768  integral membrane protein  30.42 
 
 
339 aa  89  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00340  hypothetical protein  30.28 
 
 
366 aa  76.3  0.0000000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3056  integral membrane protein  29.63 
 
 
353 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.388265  normal  0.251034 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7772  putative integral membrane protein  25.48 
 
 
344 aa  62  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5364  hypothetical protein  25.82 
 
 
352 aa  57.4  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>