23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2613 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2613  hypothetical protein  100 
 
 		 399 aa  733    Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00181742  normal  0.271812 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4875  hypothetical protein  60.13 
 
 		 388 aa  285  8e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.401748 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2676  hypothetical protein  35.37 
 
 		 344 aa  132  7.999999999999999e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.213372  normal  0.2716 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6229  hypothetical protein  34.71 
 
 		 367 aa  121  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.540475  normal  0.839871 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1024  hypothetical protein  33.55 
 
 		 336 aa  117  5e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.379337  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0458  hypothetical protein  39.26 
 
 		 333 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0471  hypothetical protein  38.89 
 
 		 333 aa  114  3e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.462076  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0482  hypothetical protein  38.89 
 
 		 333 aa  114  3e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0640  hypothetical protein  36.69 
 
 		 337 aa  113  6e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.21578 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1091  hypothetical protein  36.84 
 
 		 343 aa  107  3e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.214975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1013  hypothetical protein  42.22 
 
 		 337 aa  107  3e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1427  hypothetical protein  37.29 
 
 		 339 aa  99  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.351861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0254  hypothetical protein  35.12 
 
 		 337 aa  94  4e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0462  hypothetical protein  31.27 
 
 		 335 aa  87  5e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2250  hypothetical protein  33.12 
 
 		 313 aa  80.9  0.00000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.052071  normal  0.051956 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00340  hypothetical protein  32.8 
 
 		 366 aa  64.7  0.000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2795  integral membrane protein  28.95 
 
 		 339 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.820737  normal  0.940856 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2812  integral membrane protein  28.95 
 
 		 339 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.382635  normal  0.173588 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2768  integral membrane protein  28.95 
 
 		 339 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5364  hypothetical protein  29.03 
 
 		 352 aa  51.6  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0109  hypothetical protein  30.38 
 
 		 797 aa  49.7  0.00008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.410499  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7772  putative integral membrane protein  26.37 
 
 		 344 aa  48.1  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3330  integral membrane protein  29.96 
 
 		 356 aa  45.1  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0177609 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>