21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4875 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4875  hypothetical protein  100 
 
 		 388 aa  714    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.401748 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2613  hypothetical protein  60.13 
 
 		 399 aa  274  2.0000000000000002e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00181742  normal  0.271812 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6229  hypothetical protein  35.76 
 
 		 367 aa  133  6e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.540475  normal  0.839871 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1024  hypothetical protein  33.23 
 
 		 336 aa  125  1e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.379337  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2676  hypothetical protein  33.65 
 
 		 344 aa  119  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.213372  normal  0.2716 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0640  hypothetical protein  34.84 
 
 		 337 aa  103  4e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.21578 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1091  hypothetical protein  34.98 
 
 		 343 aa  100  5e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.214975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0471  hypothetical protein  34.34 
 
 		 333 aa  95.9  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.462076  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0482  hypothetical protein  34.34 
 
 		 333 aa  95.9  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1013  hypothetical protein  37.5 
 
 		 337 aa  95.9  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0458  hypothetical protein  34.72 
 
 		 333 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1427  hypothetical protein  38.69 
 
 		 339 aa  87  5e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.351861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0254  hypothetical protein  31.1 
 
 		 337 aa  80.9  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0462  hypothetical protein  30.77 
 
 		 335 aa  73.2  0.000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2250  hypothetical protein  32.27 
 
 		 313 aa  72.4  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.052071  normal  0.051956 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00340  hypothetical protein  35.14 
 
 		 366 aa  64.7  0.000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2795  integral membrane protein  30.18 
 
 		 339 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.820737  normal  0.940856 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2812  integral membrane protein  30.18 
 
 		 339 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.382635  normal  0.173588 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2768  integral membrane protein  30.18 
 
 		 339 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5364  hypothetical protein  26.45 
 
 		 352 aa  48.5  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7772  putative integral membrane protein  24.41 
 
 		 344 aa  45.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>