24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2250 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_2250  hypothetical protein  100 
 
 		 313 aa  573  1.0000000000000001e-162  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.052071  normal  0.051956 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5364  hypothetical protein  33.01 
 
 		 352 aa  103  4e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0462  hypothetical protein  36.43 
 
 		 335 aa  99.4  7e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1024  hypothetical protein  30.55 
 
 		 336 aa  92.4  8e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.379337  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6229  hypothetical protein  31.97 
 
 		 367 aa  89.4  7e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.540475  normal  0.839871 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0458  hypothetical protein  33.68 
 
 		 333 aa  87.4  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0482  hypothetical protein  32.64 
 
 		 333 aa  86.7  4e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0471  hypothetical protein  32.64 
 
 		 333 aa  86.7  4e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.462076  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2676  hypothetical protein  29.94 
 
 		 344 aa  86.7  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.213372  normal  0.2716 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1091  hypothetical protein  31.99 
 
 		 343 aa  80.5  0.00000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.214975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0640  hypothetical protein  31.13 
 
 		 337 aa  80.5  0.00000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.21578 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7772  putative integral membrane protein  27.88 
 
 		 344 aa  73.6  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2613  hypothetical protein  31.75 
 
 		 399 aa  72  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00181742  normal  0.271812 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1013  hypothetical protein  39.35 
 
 		 337 aa  71.6  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3056  integral membrane protein  29.49 
 
 		 353 aa  69.7  0.00000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.388265  normal  0.251034 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4875  hypothetical protein  31.8 
 
 		 388 aa  67  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.401748 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0254  hypothetical protein  31.23 
 
 		 337 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2795  integral membrane protein  28.04 
 
 		 339 aa  63.2  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.820737  normal  0.940856 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2812  integral membrane protein  28.04 
 
 		 339 aa  63.5  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.382635  normal  0.173588 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2768  integral membrane protein  28.04 
 
 		 339 aa  63.5  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3330  integral membrane protein  30.56 
 
 		 356 aa  60.1  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0177609 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1427  hypothetical protein  32.2 
 
 		 339 aa  51.2  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.351861  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00340  hypothetical protein  29.57 
 
 		 366 aa  47.4  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2611  ABC-2 type transporter  41.67 
 
 		 271 aa  43.5  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.463283 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>