17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3056 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_3056  integral membrane protein  100 
 
 		 353 aa  684    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.388265  normal  0.251034 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3330  integral membrane protein  79.21 
 
 		 356 aa  514  1e-144  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0177609 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2768  integral membrane protein  65.68 
 
 		 339 aa  396  1e-109  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2795  integral membrane protein  65.98 
 
 		 339 aa  397  1e-109  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.820737  normal  0.940856 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2812  integral membrane protein  65.68 
 
 		 339 aa  396  1e-109  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.382635  normal  0.173588 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7772  putative integral membrane protein  31.83 
 
 		 344 aa  87  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2250  hypothetical protein  30.77 
 
 		 313 aa  72.4  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.052071  normal  0.051956 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0458  hypothetical protein  30.96 
 
 		 333 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0482  hypothetical protein  30.54 
 
 		 333 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0471  hypothetical protein  30.54 
 
 		 333 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.462076  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2676  hypothetical protein  26.33 
 
 		 344 aa  68.9  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.213372  normal  0.2716 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1091  hypothetical protein  30.86 
 
 		 343 aa  68.2  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.214975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1024  hypothetical protein  26.05 
 
 		 336 aa  68.2  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.379337  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6229  hypothetical protein  29.03 
 
 		 367 aa  66.6  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.540475  normal  0.839871 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0640  hypothetical protein  27.08 
 
 		 337 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.21578 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1013  hypothetical protein  31.69 
 
 		 337 aa  49.3  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5364  hypothetical protein  26.33 
 
 		 352 aa  46.6  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>