18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_2812 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_2768  integral membrane protein  100 
 
 
339 aa  646    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2812  integral membrane protein  100 
 
 
339 aa  646    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.382635  normal  0.173588 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2795  integral membrane protein  99.71 
 
 
339 aa  644    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.820737  normal  0.940856 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3056  integral membrane protein  65.68 
 
 
353 aa  387  1e-106  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.388265  normal  0.251034 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3330  integral membrane protein  66.25 
 
 
356 aa  375  1e-103  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0177609 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7772  putative integral membrane protein  31.05 
 
 
344 aa  84.7  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2676  hypothetical protein  28.39 
 
 
344 aa  74.7  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.213372  normal  0.2716 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0482  hypothetical protein  30.42 
 
 
333 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0471  hypothetical protein  30.42 
 
 
333 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.462076  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0458  hypothetical protein  30.04 
 
 
333 aa  72.4  0.000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0640  hypothetical protein  26.88 
 
 
337 aa  67  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.21578 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1024  hypothetical protein  25.42 
 
 
336 aa  63.9  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.379337  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1013  hypothetical protein  32.96 
 
 
337 aa  62  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2250  hypothetical protein  27.3 
 
 
313 aa  60.1  0.00000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.052071  normal  0.051956 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6229  hypothetical protein  26.06 
 
 
367 aa  52  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.540475  normal  0.839871 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4875  hypothetical protein  29.54 
 
 
388 aa  49.7  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.401748 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5364  hypothetical protein  28.2 
 
 
352 aa  47.4  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1091  hypothetical protein  29.15 
 
 
343 aa  47  0.0005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.214975  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>