23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_0458 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_0458  hypothetical protein  100 
 
 
333 aa  639    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0471  hypothetical protein  98.2 
 
 
333 aa  627  1e-178  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.462076  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0482  hypothetical protein  98.2 
 
 
333 aa  627  1e-178  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0640  hypothetical protein  64.76 
 
 
337 aa  392  1e-108  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.21578 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0254  hypothetical protein  67.2 
 
 
337 aa  313  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2676  hypothetical protein  42.39 
 
 
344 aa  221  9.999999999999999e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.213372  normal  0.2716 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1024  hypothetical protein  42.11 
 
 
336 aa  210  3e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.379337  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6229  hypothetical protein  37.88 
 
 
367 aa  181  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.540475  normal  0.839871 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0462  hypothetical protein  37.7 
 
 
335 aa  158  1e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1091  hypothetical protein  37.84 
 
 
343 aa  157  3e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.214975  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1013  hypothetical protein  41.11 
 
 
337 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1427  hypothetical protein  38.93 
 
 
339 aa  135  7.000000000000001e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.351861  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4875  hypothetical protein  35.33 
 
 
388 aa  106  7e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.401748 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2613  hypothetical protein  35.79 
 
 
399 aa  104  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00181742  normal  0.271812 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2250  hypothetical protein  32.8 
 
 
313 aa  93.6  4e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.052071  normal  0.051956 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3330  integral membrane protein  29.85 
 
 
356 aa  89.4  9e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0177609 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2795  integral membrane protein  30.04 
 
 
339 aa  87  4e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.820737  normal  0.940856 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2812  integral membrane protein  30.04 
 
 
339 aa  86.3  7e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.382635  normal  0.173588 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2768  integral membrane protein  30.04 
 
 
339 aa  86.3  7e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00340  hypothetical protein  30.88 
 
 
366 aa  79.7  0.00000000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3056  integral membrane protein  29.63 
 
 
353 aa  73.2  0.000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.388265  normal  0.251034 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7772  putative integral membrane protein  26.28 
 
 
344 aa  65.9  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5364  hypothetical protein  26.11 
 
 
352 aa  57.8  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>