19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1427 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_1427  hypothetical protein  100 
 
 
339 aa  618  1e-176  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.351861  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2676  hypothetical protein  36.2 
 
 
344 aa  154  2e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.213372  normal  0.2716 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0640  hypothetical protein  40.58 
 
 
337 aa  152  8e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.21578 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6229  hypothetical protein  37.59 
 
 
367 aa  146  5e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.540475  normal  0.839871 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1024  hypothetical protein  36.99 
 
 
336 aa  142  9.999999999999999e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.379337  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0458  hypothetical protein  39.07 
 
 
333 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1091  hypothetical protein  39.08 
 
 
343 aa  132  9e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.214975  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0471  hypothetical protein  38.35 
 
 
333 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.462076  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0482  hypothetical protein  38.35 
 
 
333 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0462  hypothetical protein  39.43 
 
 
335 aa  125  1e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1013  hypothetical protein  43.37 
 
 
337 aa  123  4e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4875  hypothetical protein  39.46 
 
 
388 aa  119  7e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.401748 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0254  hypothetical protein  39.07 
 
 
337 aa  112  7.000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2613  hypothetical protein  37.9 
 
 
399 aa  106  6e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00181742  normal  0.271812 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00340  hypothetical protein  31.38 
 
 
366 aa  95.1  2e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2250  hypothetical protein  35.33 
 
 
313 aa  90.9  3e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.052071  normal  0.051956 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7772  putative integral membrane protein  29.93 
 
 
344 aa  56.2  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3056  integral membrane protein  28.62 
 
 
353 aa  53.1  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.388265  normal  0.251034 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3330  integral membrane protein  25.5 
 
 
356 aa  43.5  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0177609 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>