24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1091 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_1091  hypothetical protein  100 
 
 
343 aa  620  1e-176  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.214975  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2676  hypothetical protein  37.84 
 
 
344 aa  186  4e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.213372  normal  0.2716 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6229  hypothetical protein  40.42 
 
 
367 aa  169  6e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.540475  normal  0.839871 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0640  hypothetical protein  39.16 
 
 
337 aa  168  1e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.21578 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1013  hypothetical protein  45.78 
 
 
337 aa  160  3e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0458  hypothetical protein  40.42 
 
 
333 aa  159  5e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0471  hypothetical protein  39.72 
 
 
333 aa  158  1e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.462076  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0482  hypothetical protein  39.72 
 
 
333 aa  158  1e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1024  hypothetical protein  35.96 
 
 
336 aa  142  9.999999999999999e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.379337  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0254  hypothetical protein  38.86 
 
 
337 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0462  hypothetical protein  36.16 
 
 
335 aa  122  8e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4875  hypothetical protein  34.55 
 
 
388 aa  115  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.401748 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2613  hypothetical protein  36.53 
 
 
399 aa  109  6e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00181742  normal  0.271812 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1427  hypothetical protein  40.13 
 
 
339 aa  109  8.000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.351861  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00340  hypothetical protein  31.79 
 
 
366 aa  105  2e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2250  hypothetical protein  32.59 
 
 
313 aa  98.2  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.052071  normal  0.051956 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7772  putative integral membrane protein  30.43 
 
 
344 aa  90.9  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3056  integral membrane protein  32.54 
 
 
353 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.388265  normal  0.251034 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3330  integral membrane protein  29.07 
 
 
356 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0177609 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2795  integral membrane protein  28.39 
 
 
339 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.820737  normal  0.940856 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5364  hypothetical protein  28.17 
 
 
352 aa  67.8  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2812  integral membrane protein  28.39 
 
 
339 aa  67.8  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.382635  normal  0.173588 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2768  integral membrane protein  28.39 
 
 
339 aa  67.8  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0109  hypothetical protein  37.97 
 
 
797 aa  45.1  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.410499  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>