15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0109 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0109  hypothetical protein  100 
 
 		 797 aa  1532    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.410499  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2676  hypothetical protein  29.26 
 
 		 344 aa  72.4  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.213372  normal  0.2716 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0759  hypothetical protein  27.53 
 
 		 406 aa  62.8  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0329253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1024  hypothetical protein  28.66 
 
 		 336 aa  63.2  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.379337  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2613  hypothetical protein  29.6 
 
 		 399 aa  62  0.00000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00181742  normal  0.271812 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2997  hypothetical protein  26.47 
 
 		 390 aa  61.2  0.00000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.929467  hitchhiker  0.0000428453 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7772  putative integral membrane protein  23.44 
 
 		 344 aa  58.9  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0640  hypothetical protein  26.76 
 
 		 337 aa  55.8  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.21578 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2260  hypothetical protein  25.91 
 
 		 368 aa  55.1  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.39109  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2704  hypothetical protein  25.73 
 
 		 390 aa  54.3  0.000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.732051 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0462  hypothetical protein  26.78 
 
 		 335 aa  52  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1091  hypothetical protein  38.82 
 
 		 343 aa  49.3  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.214975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5364  hypothetical protein  25.07 
 
 		 352 aa  45.8  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4575  hypothetical protein  29.41 
 
 		 429 aa  45.8  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0910  hypothetical protein  23.67 
 
 		 391 aa  45.4  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.247214  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>