19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0462 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0462  hypothetical protein  100 
 
 		 335 aa  631  1e-180  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0640  hypothetical protein  38.08 
 
 		 337 aa  166  4e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.21578 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2676  hypothetical protein  37.28 
 
 		 344 aa  155  7e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.213372  normal  0.2716 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0471  hypothetical protein  38.51 
 
 		 333 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.462076  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0482  hypothetical protein  38.51 
 
 		 333 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0458  hypothetical protein  38.85 
 
 		 333 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6229  hypothetical protein  37.68 
 
 		 367 aa  147  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.540475  normal  0.839871 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1024  hypothetical protein  38.7 
 
 		 336 aa  144  2e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.379337  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0254  hypothetical protein  38.14 
 
 		 337 aa  126  7e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1091  hypothetical protein  36.33 
 
 		 343 aa  121  1.9999999999999998e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.214975  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2250  hypothetical protein  35.59 
 
 		 313 aa  107  3e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.052071  normal  0.051956 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1013  hypothetical protein  39.93 
 
 		 337 aa  107  4e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1427  hypothetical protein  39.52 
 
 		 339 aa  103  3e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.351861  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00340  hypothetical protein  29.62 
 
 		 366 aa  82.8  0.000000000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2613  hypothetical protein  31.27 
 
 		 399 aa  82.4  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00181742  normal  0.271812 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4875  hypothetical protein  29.55 
 
 		 388 aa  73.6  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.401748 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7772  putative integral membrane protein  27.62 
 
 		 344 aa  67  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5364  hypothetical protein  26.86 
 
 		 352 aa  65.5  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0109  hypothetical protein  31.1 
 
 		 797 aa  42.4  0.01  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.410499  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>