23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1013 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1013  hypothetical protein  100 
 
 		 337 aa  604  9.999999999999999e-173  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2676  hypothetical protein  45.9 
 
 		 344 aa  215  9.999999999999999e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.213372  normal  0.2716 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0640  hypothetical protein  42.44 
 
 		 337 aa  186  5e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.21578 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1091  hypothetical protein  45.85 
 
 		 343 aa  183  4.0000000000000006e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.214975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0471  hypothetical protein  41.97 
 
 		 333 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.462076  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0482  hypothetical protein  41.97 
 
 		 333 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0458  hypothetical protein  41.61 
 
 		 333 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1024  hypothetical protein  41.85 
 
 		 336 aa  164  2.0000000000000002e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.379337  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0254  hypothetical protein  44.93 
 
 		 337 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6229  hypothetical protein  38.94 
 
 		 367 aa  154  2.9999999999999998e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.540475  normal  0.839871 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0462  hypothetical protein  39.1 
 
 		 335 aa  137  4e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1427  hypothetical protein  44.06 
 
 		 339 aa  129  8.000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.351861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4875  hypothetical protein  35.76 
 
 		 388 aa  119  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.401748 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2613  hypothetical protein  39.32 
 
 		 399 aa  114  3e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00181742  normal  0.271812 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2250  hypothetical protein  36.3 
 
 		 313 aa  98.6  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.052071  normal  0.051956 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2795  integral membrane protein  32 
 
 		 339 aa  73.9  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.820737  normal  0.940856 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2812  integral membrane protein  32 
 
 		 339 aa  73.6  0.000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.382635  normal  0.173588 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2768  integral membrane protein  32 
 
 		 339 aa  73.6  0.000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3330  integral membrane protein  33.33 
 
 		 356 aa  69.7  0.00000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0177609 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7772  putative integral membrane protein  28.57 
 
 		 344 aa  68.6  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5364  hypothetical protein  30.1 
 
 		 352 aa  65.9  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00340  hypothetical protein  25.71 
 
 		 366 aa  64.7  0.000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3056  integral membrane protein  30.89 
 
 		 353 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.388265  normal  0.251034 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>