24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2676 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_2676  hypothetical protein  100 
 
 
344 aa  669    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.213372  normal  0.2716 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1024  hypothetical protein  41.67 
 
 
336 aa  231  1e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.379337  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0640  hypothetical protein  41.01 
 
 
337 aa  216  5.9999999999999996e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.21578 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0471  hypothetical protein  46.52 
 
 
333 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.462076  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0482  hypothetical protein  46.52 
 
 
333 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0458  hypothetical protein  46.52 
 
 
333 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1013  hypothetical protein  45.9 
 
 
337 aa  186  4e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0254  hypothetical protein  46.13 
 
 
337 aa  181  1e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1091  hypothetical protein  37.35 
 
 
343 aa  171  1e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.214975  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6229  hypothetical protein  37.41 
 
 
367 aa  164  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.540475  normal  0.839871 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0462  hypothetical protein  35.76 
 
 
335 aa  153  4e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1427  hypothetical protein  38.59 
 
 
339 aa  139  8.999999999999999e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.351861  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4875  hypothetical protein  33.02 
 
 
388 aa  125  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.401748 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2613  hypothetical protein  35.05 
 
 
399 aa  124  2e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00181742  normal  0.271812 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00340  hypothetical protein  26.57 
 
 
366 aa  100  5e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2250  hypothetical protein  30.29 
 
 
313 aa  79.7  0.00000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.052071  normal  0.051956 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7772  putative integral membrane protein  24.62 
 
 
344 aa  77.4  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2795  integral membrane protein  28.25 
 
 
339 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.820737  normal  0.940856 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2812  integral membrane protein  28.25 
 
 
339 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.382635  normal  0.173588 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2768  integral membrane protein  28.25 
 
 
339 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3056  integral membrane protein  26.33 
 
 
353 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.388265  normal  0.251034 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3330  integral membrane protein  27.48 
 
 
356 aa  60.5  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0177609 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0109  hypothetical protein  29.2 
 
 
797 aa  53.5  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.410499  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5364  hypothetical protein  26.47 
 
 
352 aa  51.2  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>