24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_0254 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_0254  hypothetical protein  100 
 
 
337 aa  636    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0640  hypothetical protein  71.69 
 
 
337 aa  449  1e-125  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.21578 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0458  hypothetical protein  67.71 
 
 
333 aa  344  2e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0471  hypothetical protein  67.08 
 
 
333 aa  343  2.9999999999999997e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.462076  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0482  hypothetical protein  67.08 
 
 
333 aa  343  2.9999999999999997e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2676  hypothetical protein  45.54 
 
 
344 aa  207  3e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.213372  normal  0.2716 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1024  hypothetical protein  41.67 
 
 
336 aa  199  6e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.379337  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1091  hypothetical protein  39.53 
 
 
343 aa  153  4e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.214975  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1013  hypothetical protein  44.98 
 
 
337 aa  152  7e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0462  hypothetical protein  37.31 
 
 
335 aa  152  8.999999999999999e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6229  hypothetical protein  35.57 
 
 
367 aa  150  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.540475  normal  0.839871 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1427  hypothetical protein  39.93 
 
 
339 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.351861  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4875  hypothetical protein  33.33 
 
 
388 aa  98.2  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.401748 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2613  hypothetical protein  35.76 
 
 
399 aa  97.8  3e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00181742  normal  0.271812 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5364  hypothetical protein  28.12 
 
 
352 aa  75.5  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00340  hypothetical protein  34.44 
 
 
366 aa  75.5  0.000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2250  hypothetical protein  30.69 
 
 
313 aa  73.9  0.000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.052071  normal  0.051956 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7772  putative integral membrane protein  26.8 
 
 
344 aa  73.2  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2795  integral membrane protein  29.06 
 
 
339 aa  63.2  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.820737  normal  0.940856 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2812  integral membrane protein  29.06 
 
 
339 aa  62.8  0.000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.382635  normal  0.173588 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2768  integral membrane protein  29.06 
 
 
339 aa  62.8  0.000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3330  integral membrane protein  29.06 
 
 
356 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0177609 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3056  integral membrane protein  27.76 
 
 
353 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.388265  normal  0.251034 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0109  hypothetical protein  28.63 
 
 
797 aa  46.2  0.0007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.410499  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>