31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2611 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_2611  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 271 aa  524  1e-148  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.463283 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4338  hypothetical protein  65.75 
 
 		 256 aa  342  2.9999999999999997e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0140069  normal  0.856697 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4940  ABC-2 type transporter  32.94 
 
 		 275 aa  99.8  5e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0438009 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2610  ABC-2 type transporter  29.3 
 
 		 273 aa  94.7  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.331867 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4337  hypothetical protein  28.96 
 
 		 265 aa  89.7  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.100167  normal  0.636855 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1500  ABC-2 type transporter  27.91 
 
 		 270 aa  55.5  0.0000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1455  ABC-2 type transporter  27.91 
 
 		 270 aa  55.5  0.0000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0406  ABC-2 type transporter  30.95 
 
 		 279 aa  53.5  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0129272  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0112  ABC-2 type transporter  25.17 
 
 		 372 aa  49.7  0.00005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0225544  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2477  ABC-2 type transporter  29.7 
 
 		 286 aa  48.9  0.00009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.299444 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2356  ABC-2 type transporter  29.7 
 
 		 286 aa  47.4  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.328671  normal  0.119199 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3408  ABC-2 type transporter, permease protein  29.71 
 
 		 243 aa  47.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.184246  normal  0.618546 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0407  ABC-2 type transporter  21.8 
 
 		 308 aa  47.4  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4106  ABC-2 type transporter  31 
 
 		 293 aa  46.2  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2920  ABC-2 type transporter  24.83 
 
 		 371 aa  46.2  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.827824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0559  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  34.19 
 
 		 264 aa  46.2  0.0005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1618  ABC-2 type transporter  38.71 
 
 		 269 aa  46.2  0.0006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.794446 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0330  ABC-2 type transporter  24.72 
 
 		 259 aa  45.4  0.0009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0811  ABC-2 type transporter  25.41 
 
 		 377 aa  45.4  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1548  ABC-2 type transporter  28.57 
 
 		 366 aa  45.1  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.299648  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0230  ABC-2 type transporter  28.99 
 
 		 262 aa  43.5  0.003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0145585  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0457  ABC-2 type transporter  26.36 
 
 		 267 aa  43.9  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4230  ABC-2 type transporter  21.53 
 
 		 375 aa  43.5  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0666  ABC-2 type transporter  28.97 
 
 		 270 aa  43.1  0.005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.521006  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0196  ABC-2 type transporter  35 
 
 		 247 aa  42.7  0.006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.168445  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1438  ABC-2 type transporter  28.57 
 
 		 273 aa  42.7  0.006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0734  ABC-2 type transporter  34.92 
 
 		 241 aa  42.7  0.006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00105629  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1513  ABC-2 type transporter  28.97 
 
 		 270 aa  42.7  0.006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2321  ABC-2 type transporter  28.68 
 
 		 245 aa  42.7  0.007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3101  ABC-2 type transporter  35.44 
 
 		 344 aa  42.4  0.008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000558169  hitchhiker  0.0000121126 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2250  ABC-2 type transporter  26.24 
 
 		 256 aa  42.4  0.008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.239998  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>