239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0406 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0406  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 279 aa  543  1e-153  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0129272  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1438  ABC-2 type transporter  49.26 
 
 		 273 aa  271  9e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2356  ABC-2 type transporter  52.48 
 
 		 286 aa  269  5e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.328671  normal  0.119199 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2477  ABC-2 type transporter  53.55 
 
 		 286 aa  268  5.9999999999999995e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.299444 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3266  ABC-2 type transporter  50.71 
 
 		 281 aa  265  4e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1954  ABC-2 type transporter  45.99 
 
 		 275 aa  222  6e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00280004  normal  0.727691 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1792  ABC-2 type transporter  45.26 
 
 		 275 aa  219  3.9999999999999997e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1805  ABC-2 type transporter  44.69 
 
 		 290 aa  202  7e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1513  ABC-2 type transporter  33.17 
 
 		 270 aa  94  2e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0666  ABC-2 type transporter  33.65 
 
 		 270 aa  93.6  3e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.521006  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0407  ABC-2 type transporter  26.92 
 
 		 308 aa  90.9  2e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0378  ABC-2 type transporter  28.47 
 
 		 261 aa  84  0.000000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.572571  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3320  ABC-2 type transporter  24.32 
 
 		 269 aa  79  0.00000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0457  ABC-2 type transporter  23.51 
 
 		 267 aa  74.3  0.000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1500  ABC-2 type transporter  23.44 
 
 		 270 aa  68.2  0.0000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0870  ABC-2 type transporter  27.62 
 
 		 267 aa  67.8  0.0000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.329831 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1455  ABC-2 type transporter  23.44 
 
 		 270 aa  68.2  0.0000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2879  ABC-2 type transporter  29.44 
 
 		 286 aa  66.2  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1593  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  29.24 
 
 		 255 aa  64.7  0.000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.327285  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0525  ABC-2 type transporter  26.9 
 
 		 312 aa  62.4  0.000000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000127264 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0786  ABC-2 type transporter  33.7 
 
 		 254 aa  59.7  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.585621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3318  ABC-2 type transporter  32.46 
 
 		 271 aa  59.3  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.561179  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4150  hypothetical protein  25.45 
 
 		 261 aa  58.5  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000233601  normal  0.0693377 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3976  ABC-2 type transporter  28.7 
 
 		 289 aa  58.5  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1170  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  25.29 
 
 		 253 aa  57.8  0.0000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.780816  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29920  ABC-type multidrug transport system, permease component  27.92 
 
 		 285 aa  58.2  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.207401  normal  0.6858 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4106  ABC-2 type transporter  30.64 
 
 		 293 aa  57  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1686  hypothetical protein  25.54 
 
 		 280 aa  56.2  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4560  ABC-2 type transporter  26.16 
 
 		 257 aa  56.2  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1517  ABC-2 type transporter  22.94 
 
 		 268 aa  55.8  0.0000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1477  ABC-2 type transporter  22.94 
 
 		 268 aa  55.8  0.0000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3172  ABC-2 type transporter  30.32 
 
 		 279 aa  55.1  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0443281 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1510  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  27.07 
 
 		 253 aa  55.1  0.000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.525568  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0608  ABC-2 type transporter  27.57 
 
 		 281 aa  54.3  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0300  ABC-2 type transporter  25.86 
 
 		 270 aa  54.3  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2611  ABC-2 type transporter  30.95 
 
 		 271 aa  53.9  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.463283 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0909  ABC transporter protein  25.79 
 
 		 276 aa  53.9  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.982909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3224  ABC-2 type transporter  29.94 
 
 		 383 aa  53.1  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.13853  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3168  ABC transporter, inner membrane subunit  27.73 
 
 		 270 aa  53.1  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2924  putative ABC transporter inner membrane subunit  27.59 
 
 		 253 aa  53.1  0.000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3083  ABC transporter permease  27.22 
 
 		 253 aa  52.8  0.000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.646009  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3115  ABC transporter, inner membrane subunit  29.94 
 
 		 383 aa  52.8  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1477  ABC-2 type transporter  22.84 
 
 		 371 aa  52.8  0.000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3309  ABC-2 type transporter  29.94 
 
 		 383 aa  52.8  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0014  ABC-2 type transporter  26.43 
 
 		 304 aa  52.4  0.000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_460  ABC-type transport system, permease component  22.16 
 
 		 365 aa  52.4  0.000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.185192  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2298  daunorubicin resistance ABC transporter membrane protein  28.48 
 
 		 264 aa  52.4  0.000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.207913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1473  hypothetical protein  27.74 
 
 		 269 aa  52.4  0.000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.377134  normal  0.24112 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4686  ABC-2 type transporter  28.92 
 
 		 253 aa  52.4  0.000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.731572  normal  0.106911 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0357  hypothetical protein  27.42 
 
 		 271 aa  52.4  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0814  ABC transporter, permease protein  26.84 
 
 		 241 aa  52  0.00001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1654  hypothetical protein  31.07 
 
 		 261 aa  52  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3359  ABC-2 type transporter  27.27 
 
 		 270 aa  51.6  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0577  ABC-2 type transporter  32.31 
 
 		 276 aa  51.6  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.228177  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0734  ABC-2 type transporter  25.14 
 
 		 241 aa  52  0.00001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00105629  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1797  ABC-2 type transporter  30 
 
 		 368 aa  52  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_718  ABC transporter, permease protein  26.29 
 
 		 260 aa  52  0.00001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000115983  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0785  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  26.7 
 
 		 253 aa  51.6  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0217  ABC-2 type transporter  23.68 
 
 		 380 aa  51.2  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.623242  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3040  hypothetical protein  24.52 
 
 		 371 aa  51.2  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1491  ABC-2 type transporter  27.59 
 
 		 375 aa  50.8  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0704  ABC-2 type transporter  26.75 
 
 		 259 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0516518 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2449  ABC-type multidrug transport system permease component  30.23 
 
 		 369 aa  51.2  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2681  ABC-2 type transporter  26.19 
 
 		 285 aa  51.2  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.75118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4064  ABC-2 type transporter  22.35 
 
 		 371 aa  51.2  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0495  ABC-2 type transporter  23.2 
 
 		 365 aa  51.6  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0465  ABC transporter, permease protein  28.49 
 
 		 377 aa  50.8  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0811  ABC-2 type transporter  25.95 
 
 		 377 aa  50.4  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03360  ABC-2 type transport system permease component  26.97 
 
 		 253 aa  50.4  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.163605  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4162  ABC-2 type transporter  26.78 
 
 		 384 aa  50.4  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.80712  normal  0.28462 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1528  hypothetical protein  28.66 
 
 		 249 aa  50.4  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.102699 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1426  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  28.87 
 
 		 256 aa  50.4  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0562869  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2741  hypothetical protein  26.73 
 
 		 253 aa  50.1  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.919871  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1165  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  27.07 
 
 		 253 aa  50.1  0.00004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3689  ABC-2 type transporter  26.78 
 
 		 384 aa  50.1  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.093618  normal  0.708678 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6150  putative ABC-2 type transporter (permease protein)  26.24 
 
 		 253 aa  50.1  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00809538  normal  0.0938496 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0009  ABC-2 type transporter  24.02 
 
 		 232 aa  49.7  0.00005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1576  hypothetical protein  29.29 
 
 		 256 aa  49.7  0.00005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0243  hypothetical protein  27.32 
 
 		 251 aa  49.7  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.021198  normal  0.905832 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6044  ABC-2 type transporter  27.16 
 
 		 253 aa  49.7  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0380391  normal  0.233876 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1889  ABC-2 type transporter  26.79 
 
 		 413 aa  49.7  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.387622  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1380  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  28.87 
 
 		 256 aa  50.1  0.00005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000932687  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0425  ABC-2 type transporter  25.62 
 
 		 366 aa  49.7  0.00006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0764  ABC-2 type transporter  23.08 
 
 		 269 aa  49.3  0.00007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4005  ABC-2 type transporter  24.16 
 
 		 280 aa  49.3  0.00007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.101832  hitchhiker  0.000201414 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2276  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.16 
 
 		 253 aa  49.3  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0123592  normal  0.410533 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0426  ABC-2 type transporter  28.19 
 
 		 256 aa  49.3  0.00007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4338  hypothetical protein  30.56 
 
 		 256 aa  48.9  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0140069  normal  0.856697 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1912  ABC-2 type transporter  27.06 
 
 		 253 aa  49.3  0.00008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.846791  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0585  ABC-2 type transporter  25.73 
 
 		 371 aa  48.9  0.00009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000556211 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0216  ABC-2 type transporter  33.7 
 
 		 257 aa  48.5  0.0001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.692272 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0097  ABC type transport system, integral membrane protein  25.71 
 
 		 264 aa  48.5  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1746  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.33 
 
 		 384 aa  48.5  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0249268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4992  ABC-2 type transporter  26.46 
 
 		 270 aa  48.1  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.402209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0639  ABC-2 type transporter  26.62 
 
 		 253 aa  48.5  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2561  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  30.28 
 
 		 249 aa  48.5  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.760407 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5055  ABC-2 type transporter  27.47 
 
 		 371 aa  48.1  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.863659 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0703  ABC-2 type transporter  23.71 
 
 		 363 aa  48.9  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.422501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2945  ABC-2 type transporter  28.48 
 
 		 378 aa  48.5  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.485374  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1006  ABC-2 type transporter  23.81 
 
 		 260 aa  47.4  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0898829  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>