20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4940 on replicon NC_008697
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008697  Noca_4940  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 275 aa  527  1e-149  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0438009 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2611  ABC-2 type transporter  32.94 
 
 		 271 aa  117  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.463283 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4338  hypothetical protein  30.71 
 
 		 256 aa  109  5e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0140069  normal  0.856697 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2610  ABC-2 type transporter  31.6 
 
 		 273 aa  70.5  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.331867 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4337  hypothetical protein  31.6 
 
 		 265 aa  68.6  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.100167  normal  0.636855 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0902  ABC-2 type transporter  37.33 
 
 		 254 aa  47.4  0.0002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0406  ABC-2 type transporter  23.37 
 
 		 279 aa  46.2  0.0006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0129272  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0811  ABC-2 type transporter  20.99 
 
 		 377 aa  45.1  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1889  ABC-2 type transporter  23.93 
 
 		 413 aa  44.7  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.387622  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1899  hypothetical protein  22.92 
 
 		 379 aa  44.3  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2321  ABC-2 type transporter  25.49 
 
 		 245 aa  43.9  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5640  ABC-2 type transporter  25.13 
 
 		 368 aa  43.9  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.332161 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2479  ABC-2 type transporter  22.92 
 
 		 376 aa  43.9  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.664004  normal  0.270232 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2906  ABC-2 type transporter  25.33 
 
 		 378 aa  43.9  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25220  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  30.92 
 
 		 266 aa  43.5  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1657  ABC-2 type transporter  29.63 
 
 		 258 aa  43.1  0.005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0203159  decreased coverage  0.000243184 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0919  ABC-2 type transporter  28.43 
 
 		 405 aa  43.1  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.81116 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0457  ABC-2 type transporter  27.78 
 
 		 267 aa  42.7  0.006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0553  ABC-2 type transporter  26.57 
 
 		 361 aa  42.4  0.008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0810  ABC-2 type transporter  28.19 
 
 		 366 aa  42.4  0.009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>