19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2610 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_2610  ABC-2 type transporter  100 
 
 
273 aa  530  1e-150  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.331867 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4337  hypothetical protein  75 
 
 
265 aa  378  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.100167  normal  0.636855 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2611  ABC-2 type transporter  28.12 
 
 
271 aa  89.4  6e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.463283 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4941  putative ABC-2 type transporter, permease protein  30.25 
 
 
289 aa  88.2  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.396913  normal  0.0438009 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4338  hypothetical protein  27.03 
 
 
256 aa  78.2  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0140069  normal  0.856697 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2330  ABC-2 type transporter  33.18 
 
 
256 aa  70.5  0.00000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.813054 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4940  ABC-2 type transporter  31.23 
 
 
275 aa  54.3  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.0438009 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1410  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export system, permease component  23.83 
 
 
256 aa  53.5  0.000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000143094  unclonable  2.44279e-28 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1438  ABC-2 type transporter  25.1 
 
 
273 aa  51.2  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0790  hypothetical protein  28.35 
 
 
276 aa  46.6  0.0004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.883996 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0406  ABC-2 type transporter  27.6 
 
 
279 aa  45.8  0.0009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0129272  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0698  ABC-2 type transporter  28.38 
 
 
276 aa  45.1  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1654  hypothetical protein  33.1 
 
 
261 aa  44.3  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1500  ABC-2 type transporter  27.34 
 
 
270 aa  43.5  0.004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1455  ABC-2 type transporter  27.34 
 
 
270 aa  43.5  0.004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5840  ABC-2 type transporter  22.45 
 
 
367 aa  43.1  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.564028 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0811  ABC-2 type transporter  26.97 
 
 
377 aa  42.7  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0457  ABC-2 type transporter  21.58 
 
 
267 aa  42.4  0.008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0869  ABC-2 type transporter  24.88 
 
 
260 aa  42.4  0.009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.201874  normal  0.150559 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>