96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0553 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0553  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 361 aa  721    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0539  ABC-2 type transporter  99.17 
 
 		 361 aa  717    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0150  ABC-2 type transporter  31.69 
 
 		 338 aa  166  4e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0712  ABC-2 type transporter  27.52 
 
 		 374 aa  150  3e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0277  ABC-2 type transporter  28.26 
 
 		 380 aa  142  9e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0094  ABC-2 type transporter  28.04 
 
 		 388 aa  126  5e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00282283  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4230  ABC-2 type transporter  25.73 
 
 		 375 aa  94.4  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_701  ABC transporter, permease protein  27.61 
 
 		 360 aa  89.4  9e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.222918  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0721  ABC-2 type transporter  26.99 
 
 		 360 aa  87  5e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00179914  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0795  ABC transporter, permease protein  27.07 
 
 		 339 aa  83.6  0.000000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0125503  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0552  ABC-2 type transporter  27.69 
 
 		 336 aa  83.2  0.000000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2148  putative ABC transporter, permease protein  24.13 
 
 		 327 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.249033  normal  0.497773 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2769  ABC-2 type transporter  20.45 
 
 		 413 aa  70.9  0.00000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.160651  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0285  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  24.09 
 
 		 356 aa  68.9  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1548  ABC-2 type transporter  21.79 
 
 		 366 aa  61.6  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.299648  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7430  ABC efflux pump, inner membrane subunit  22.43 
 
 		 359 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.104702  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0276  ABC-2 type transporter  23.81 
 
 		 348 aa  55.1  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0516  ABC-2 type transporter, permease protein  21.85 
 
 		 363 aa  55.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.948898  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0534  ABC-2 type transporter, permease protein  21.85 
 
 		 363 aa  55.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.359277  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1067  putative ABC transporter, permease protein  23.84 
 
 		 341 aa  55.1  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0699  hypothetical protein  21.85 
 
 		 363 aa  55.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.201685  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6131  ABC-2 type transporter  21.88 
 
 		 358 aa  54.3  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.862302  normal  0.0100987 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2903  ABC-2 type transporter  26.11 
 
 		 368 aa  53.9  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.751562  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6512  ABC-2 type transporter  21.36 
 
 		 359 aa  53.9  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.102415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2815  ABC transporter, permease protein  26.11 
 
 		 368 aa  53.9  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6021  ABC-2 type transporter  21.36 
 
 		 359 aa  53.9  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.679719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5656  ABC-2 type transporter  21.36 
 
 		 359 aa  53.9  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.78729  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0121  ABC-2 type transporter, permease protein  21.85 
 
 		 363 aa  53.5  0.000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2895  ABC-2 type transporter, permease protein  21.85 
 
 		 363 aa  53.5  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1467  putative ABC transporter, permease protein  21.85 
 
 		 363 aa  53.5  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3151  ABC transporter, permease protein, putative  21.85 
 
 		 363 aa  53.5  0.000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0093  ABC-2 type transporter  23.06 
 
 		 356 aa  53.1  0.000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.154072  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0714  ABC-2 type transporter  22.49 
 
 		 332 aa  52.8  0.000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0810  ABC-2 type transporter  21.61 
 
 		 366 aa  52.4  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5641  ABC-2 type transporter  27.98 
 
 		 372 aa  52.4  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.350445 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1326  ABC-2 type transporter  27.31 
 
 		 368 aa  51.6  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0112  ABC-type Na+ efflux pump permease component-like protein  28.21 
 
 		 403 aa  51.6  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0112  ABC-2 type transporter  22.25 
 
 		 372 aa  49.3  0.00009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0225544  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3574  ABC transporter, permease protein  24.07 
 
 		 254 aa  48.9  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.426841  normal  0.115682 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0608  ABC-2 type transporter  26.52 
 
 		 281 aa  49.3  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2920  ABC-2 type transporter  23.89 
 
 		 371 aa  48.5  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.827824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0131  ABC-2 type transporter  23.14 
 
 		 378 aa  48.5  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.110874  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4560  ABC-2 type transporter  21.51 
 
 		 257 aa  47.8  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0152  ABC-2 type transporter  25.14 
 
 		 325 aa  46.6  0.0007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4695  ABC-2 type transporter  24.75 
 
 		 370 aa  46.6  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.595113 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1518  ABC-2 type transporter  26.14 
 
 		 378 aa  46.6  0.0007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1407  ABC-2 type transporter  21.26 
 
 		 390 aa  46.6  0.0008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0722893 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1283  ABC-2 type transporter  27.23 
 
 		 368 aa  46.2  0.0008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1380  ABC-2 type transporter  23.13 
 
 		 368 aa  46.6  0.0008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.607954  hitchhiker  0.00000190775 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3548  ABC transporter protein  27.48 
 
 		 251 aa  45.4  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.705683  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2514  ABC-2 type transporter  29.09 
 
 		 374 aa  45.8  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.936785  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2399  ABC-2 type transporter  27.04 
 
 		 241 aa  46.2  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.00000000000992199  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1078  putative ABC transport system, membrane protein  21.91 
 
 		 373 aa  45.8  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0349  putative ABC transporter, permease protein  24.32 
 
 		 364 aa  45.4  0.001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1654  hypothetical protein  25.39 
 
 		 261 aa  45.4  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2945  ABC-2 type transporter  25.57 
 
 		 378 aa  45.1  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.485374  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2368  hypothetical protein  25.12 
 
 		 379 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.305787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1284  ABC-2 type transporter  22.04 
 
 		 377 aa  45.4  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0378  ABC-2 type transporter  23.88 
 
 		 261 aa  44.7  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.572571  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0132  ABC-2 type transporter  22.57 
 
 		 370 aa  45.4  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.223413  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3252  ABC-2 type transporter  21.45 
 
 		 375 aa  44.7  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.432582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4686  ABC-2 type transporter  23.15 
 
 		 253 aa  44.7  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.731572  normal  0.106911 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2850  ABC-2 type transporter  25.11 
 
 		 368 aa  43.9  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.146675  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1420  hypothetical protein  26.63 
 
 		 387 aa  44.3  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0223  hypothetical protein  26.06 
 
 		 251 aa  43.9  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.587044  normal  0.793487 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0939  ABC-2 type transporter, permease protein  25.11 
 
 		 368 aa  43.9  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2561  ABC-2 type transporter, permease protein  25.11 
 
 		 368 aa  43.9  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0814  ABC-2 type transporter, permease protein  25.11 
 
 		 368 aa  43.9  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.547864  normal  0.91145 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0275  ABC-2 type transporter  33.33 
 
 		 231 aa  43.9  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2851  ABC-2 type transporter  25.11 
 
 		 368 aa  43.9  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00579888 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00776  hypothetical protein  25.11 
 
 		 368 aa  43.9  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0613  ABC-2 type transporter  22.49 
 
 		 369 aa  43.9  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0846  ABC-2 type transporter, permease protein  25.11 
 
 		 368 aa  43.9  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00759  predicted transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  25.11 
 
 		 368 aa  43.9  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4396  ABC-2 type transporter  24.55 
 
 		 272 aa  43.5  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.368093  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0856  ABC-2 type transporter, permease protein  25.11 
 
 		 368 aa  43.9  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2276  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25.62 
 
 		 253 aa  43.9  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0123592  normal  0.410533 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3132  ABC-2 type transporter  25.93 
 
 		 248 aa  43.5  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.571081  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4063  ABC-2 type transporter  27.18 
 
 		 375 aa  43.5  0.006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0847  ABC-2 type transporter, permease protein  21.86 
 
 		 377 aa  43.1  0.006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00777  hypothetical protein  21.86 
 
 		 377 aa  43.1  0.006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2156  ABC transporter related  24.24 
 
 		 1106 aa  43.5  0.006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0941  ABC-2 type transporter, permease protein  21.86 
 
 		 377 aa  43.1  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.858923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2850  ABC-2 type transporter  21.86 
 
 		 377 aa  43.1  0.006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0149412 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0858  ABC-2 type transporter, permease protein  21.86 
 
 		 377 aa  43.1  0.006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2849  ABC-2 type transporter  21.86 
 
 		 377 aa  43.1  0.006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.478201  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00760  predicted transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  21.86 
 
 		 377 aa  43.1  0.006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2559  ABC-2 type transporter, permease protein  21.56 
 
 		 377 aa  43.1  0.007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0816  ABC-2 type transporter, permease protein  21.86 
 
 		 377 aa  43.1  0.007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.658285 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0567  ABC-2 type transporter  25.43 
 
 		 331 aa  43.1  0.007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2902  ABC-2 type transporter  24.04 
 
 		 391 aa  43.1  0.008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.194373  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2814  ABC transporter, permease protein  24.46 
 
 		 391 aa  43.1  0.008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2367  hypothetical protein  27.65 
 
 		 370 aa  43.1  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.175245  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2423  ABC-2 type transporter  25.64 
 
 		 366 aa  42.7  0.009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0514426  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0861  ABC-2 type transporter  21.47 
 
 		 255 aa  42.7  0.01  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0630993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6150  putative ABC-2 type transporter (permease protein)  23.6 
 
 		 253 aa  42.7  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00809538  normal  0.0938496 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>