25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4338 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4338  hypothetical protein  100 
 
 		 256 aa  491  9.999999999999999e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0140069  normal  0.856697 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2611  ABC-2 type transporter  65.75 
 
 		 271 aa  326  2.0000000000000001e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.463283 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4940  ABC-2 type transporter  30.71 
 
 		 275 aa  92.8  5e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0438009 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2610  ABC-2 type transporter  27.03 
 
 		 273 aa  78.2  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.331867 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4337  hypothetical protein  29.41 
 
 		 265 aa  71.6  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.100167  normal  0.636855 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0786  ABC-2 type transporter  30.68 
 
 		 254 aa  51.6  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.585621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2920  ABC-2 type transporter  27.27 
 
 		 371 aa  51.2  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.827824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0655  ABC-2 type transporter  31.89 
 
 		 273 aa  50.1  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.121363  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0406  ABC-2 type transporter  30.56 
 
 		 279 aa  48.9  0.00007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0129272  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2321  ABC-2 type transporter  31.91 
 
 		 245 aa  47  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3408  ABC-2 type transporter, permease protein  29.48 
 
 		 243 aa  46.6  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.184246  normal  0.618546 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4230  ABC-2 type transporter  26.28 
 
 		 375 aa  46.2  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3976  ABC-2 type transporter  24.44 
 
 		 289 aa  43.9  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0271  ABC-2 type transporter  30.34 
 
 		 245 aa  43.9  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0843829  hitchhiker  0.000145713 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2816  putative ABC transporter, permease protein  24.06 
 
 		 339 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000326896 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2477  ABC-2 type transporter  28.22 
 
 		 286 aa  43.5  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.299444 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2858  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit C  31.71 
 
 		 287 aa  43.1  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.375686  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2873  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit C  31.71 
 
 		 287 aa  43.1  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.716211  normal  0.118774 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2829  daunorubicin resistance protein C  31.71 
 
 		 287 aa  43.1  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.212712  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5641  ABC-2 type transporter  27.56 
 
 		 372 aa  42.7  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.350445 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0112  ABC-2 type transporter  26.71 
 
 		 372 aa  42.4  0.008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0225544  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1500  ABC-2 type transporter  25.12 
 
 		 270 aa  42  0.009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1455  ABC-2 type transporter  25.12 
 
 		 270 aa  42  0.009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1593  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  28.35 
 
 		 255 aa  42  0.009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.327285  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2551  ABC-2 type transporter  26.09 
 
 		 508 aa  42  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.644772  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>