227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_2829 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_2829  daunorubicin resistance protein C  100 
 
 		 287 aa  574  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.212712  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2873  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit C  100 
 
 		 287 aa  574  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.716211  normal  0.118774 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2858  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit C  100 
 
 		 287 aa  574  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.375686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3387  multidrug ABC transporter inner membrane protein  52.33 
 
 		 281 aa  256  2e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.169242 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12952  daunorubicin-dim-transport integral membrane protein ABC transporter drrC  45.22 
 
 		 276 aa  256  4e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3120  multidrug ABC transporter inner membrane protein  51.69 
 
 		 284 aa  246  4e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.561291  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3737  ABC-2 type transporter  40.23 
 
 		 294 aa  189  4e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0655  ABC-2 type transporter  39.17 
 
 		 273 aa  159  4e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.121363  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4327  ABC-2 type transporter  38.1 
 
 		 272 aa  142  5e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3107  ABC-2 type transporter  30.56 
 
 		 264 aa  103  3e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3167  ABC-2 type transporter  30.56 
 
 		 264 aa  103  3e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.804555 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4992  ABC-2 type transporter  29.91 
 
 		 270 aa  102  7e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.402209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1473  hypothetical protein  30 
 
 		 269 aa  100  4e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.377134  normal  0.24112 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0340  ABC-2 type transporter  32.4 
 
 		 273 aa  99  7e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.171685  hitchhiker  0.00234396 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0014  ABC-2 type transporter  28 
 
 		 304 aa  96.7  4e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4081  ABC-2 type transporter  29.03 
 
 		 274 aa  89  8e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.431533 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5259  ABC-2 type transporter  29.72 
 
 		 277 aa  87.4  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0497  ABC-2 type transporter  25.86 
 
 		 286 aa  86.3  5e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.779296  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1755  ABC-2 type transporter  31.21 
 
 		 264 aa  85.5  8e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.586856  decreased coverage  0.00328589 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4106  ABC-2 type transporter  27.47 
 
 		 293 aa  85.1  0.000000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23570  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  25.56 
 
 		 267 aa  85.1  0.000000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.24456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0918  ABC-2 type transporter  27.84 
 
 		 254 aa  84  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1384  ABC-2 type transporter  27.49 
 
 		 269 aa  80.9  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.78336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2065  ABC-2 type transporter  28.12 
 
 		 254 aa  79.7  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6375  ABC-2 type transporter  27.16 
 
 		 247 aa  79.3  0.00000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3132  ABC-2 type transporter  29.38 
 
 		 248 aa  77.4  0.0000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.571081  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0674  ABC-2 type transporter  26.1 
 
 		 272 aa  77  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.890968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2043  ABC-2 type transporter  27.2 
 
 		 279 aa  75.9  0.0000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.167343  hitchhiker  0.00685853 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1525  ABC-2 type transporter  30.29 
 
 		 290 aa  75.5  0.0000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00118323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4761  ABC-2 type transporter  26.48 
 
 		 261 aa  74.7  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000109025  hitchhiker  0.000621886 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1123  ABC-2 type transporter  28.24 
 
 		 257 aa  73.6  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6787  ABC-2 type transporter  28.07 
 
 		 268 aa  73.6  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000212784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2016  ABC-2 type transporter  27.59 
 
 		 268 aa  72.8  0.000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3916  ABC transporter, inner membrane subunit  25.95 
 
 		 267 aa  72.4  0.000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1754  ABC-2 type transporter  33.33 
 
 		 250 aa  71.6  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00326384 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0542  ABC-2 type transporter  28.27 
 
 		 253 aa  70.9  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3121  multidrug ABC transporter inner membrane protein  26.77 
 
 		 274 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.656441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4183  ABC-2 type transporter  26.92 
 
 		 269 aa  70.9  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.013923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1839  ABC-2 type transporter  27.48 
 
 		 266 aa  71.6  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00340  ABC-type multidrug transport system, permease component  29.13 
 
 		 259 aa  71.2  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.15345 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1937  ABC-2 type transporter  26.91 
 
 		 284 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.008119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8873  ABC-2 type transporter  28.02 
 
 		 270 aa  70.1  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.53633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3408  ABC-2 type transporter, permease protein  29.35 
 
 		 243 aa  70.1  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.184246  normal  0.618546 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1808  ABC transporter, efflux permease protein  28.63 
 
 		 249 aa  70.1  0.00000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4056  ABC-2 type transporter  25.57 
 
 		 267 aa  69.7  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18340  ABC-type multidrug transport system, permease component  26.62 
 
 		 282 aa  69.7  0.00000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.823039 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4023  ABC-2 type transporter  25.57 
 
 		 267 aa  69.7  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.293949  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0058  ABC-2 type transporter  26.73 
 
 		 271 aa  69.3  0.00000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4551  ABC-2 type transporter  25.1 
 
 		 264 aa  69.3  0.00000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.442888  normal  0.0220595 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3149  ABC transporter efflux permease; daunorubicin resistance transmembrane protein  27.82 
 
 		 249 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0286068  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3467  ABC transporter, efflux permease protein  27.82 
 
 		 249 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000810233  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1878  ABC-2 type transporter  30.09 
 
 		 273 aa  68.2  0.0000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2775  ABC-2 type transporter  26.09 
 
 		 278 aa  68.2  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00783625  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7215  ABC transporter (permease)  24.08 
 
 		 247 aa  67.4  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.284415 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0666  ABC-2 type transporter  27.75 
 
 		 285 aa  67  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0966  ABC-2 type transporter  24.64 
 
 		 259 aa  67.4  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4512  ABC-2 type transporter  26.32 
 
 		 281 aa  67.4  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1504  ABC-2 type transporter  26.21 
 
 		 272 aa  66.2  0.0000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.457097  normal  0.179064 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1079  ABC-2 type transporter  28.46 
 
 		 296 aa  66.2  0.0000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3239  ABC transporter efflux permease  27.82 
 
 		 249 aa  65.9  0.0000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3492  ABC transporter permease  27.82 
 
 		 249 aa  65.9  0.0000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.799548  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3453  ABC transporter, efflux permease protein  27.82 
 
 		 249 aa  65.9  0.0000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4936  ABC-2 type transporter  25.2 
 
 		 280 aa  65.9  0.0000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.707728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2830  ABC transporter, DrrB efflux protein  27.94 
 
 		 269 aa  65.5  0.0000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.578929  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2874  multidrug ABC transporter inner membrane protein  27.94 
 
 		 269 aa  65.5  0.0000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.189586 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2859  multidrug ABC transporter inner membrane protein  27.94 
 
 		 269 aa  65.5  0.0000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.464408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1122  ABC-2 type transporter  25.77 
 
 		 285 aa  65.1  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.408605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1684  ABC-2 type transporter  26.75 
 
 		 251 aa  65.5  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1034  ABC-2 type transporter  26.14 
 
 		 254 aa  65.1  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.489208  normal  0.0976555 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0192  hypothetical protein  27.31 
 
 		 295 aa  64.3  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.144906 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1683  ABC-2 type transporter  26.56 
 
 		 274 aa  64.7  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000181652  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3137  ABC-2 type transporter  26.56 
 
 		 277 aa  64.3  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.428202  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4795  ABC-2 type transporter  26.52 
 
 		 284 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597944 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3438  ABC transporter, efflux permease protein  28.63 
 
 		 249 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4873  ABC-2 type transporter  26.04 
 
 		 298 aa  63.9  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0042  ABC-2 type transporter  26.36 
 
 		 266 aa  63.5  0.000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1697  ABC-2 type transporter  29.17 
 
 		 271 aa  63.5  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3147  ABC-2 type transporter  28.28 
 
 		 249 aa  63.9  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.145802  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0959  ABC-2 type transporter  29.28 
 
 		 256 aa  63.5  0.000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00197586  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2939  ABC-2 type transporter  23.02 
 
 		 286 aa  63.5  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.27677 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2328  transporter, putative  29.56 
 
 		 246 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.117528  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0937  ABC-2 type transporter  26.72 
 
 		 269 aa  62.8  0.000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0895  ABC-2 type transporter  25.22 
 
 		 266 aa  62.4  0.000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0213  ABC transporter permease  28.3 
 
 		 257 aa  62.4  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0062  ABC-2 type transporter  22.62 
 
 		 260 aa  62.4  0.000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000566487  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1686  hypothetical protein  27.49 
 
 		 280 aa  62.4  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3212  ABC transporter efflux permease; daunorubicin resistance transmembrane protein  28.23 
 
 		 249 aa  62  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1483  ABC-2 type transporter  27.36 
 
 		 269 aa  62  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00140227  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3388  ABC-2 type transporter  27.55 
 
 		 282 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.264053 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4383  ABC-2 type transporter  28.97 
 
 		 253 aa  61.6  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.557459 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4092  ABC-2 type transporter  26.59 
 
 		 290 aa  61.6  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0130357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4259  ABC-2 type transporter  26.36 
 
 		 282 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.573247  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1203  ABC-2 type transporter  28.12 
 
 		 251 aa  61.2  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0595438 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4345  ABC-2 type transporter  26.36 
 
 		 282 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0911686 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4638  ABC-2 type transporter  26.36 
 
 		 282 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.619797  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0538  ABC-2 type transporter  25.96 
 
 		 267 aa  61.2  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.690834  hitchhiker  0.000010786 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0654  ABC-2 type transporter  24.28 
 
 		 270 aa  61.2  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.122619  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0363  ABC-2 type transporter  28.4 
 
 		 289 aa  60.5  0.00000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4190  ABC-2 type transporter  27.07 
 
 		 257 aa  60.5  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3446  ABC transporter, efflux permease protein  27.02 
 
 		 249 aa  60.1  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00692281  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>