184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0654 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0654  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 270 aa  530  1e-149  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.122619  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4328  ABC-2 type transporter  48.82 
 
 		 259 aa  210  2e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2830  ABC transporter, DrrB efflux protein  37.09 
 
 		 269 aa  163  3e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.578929  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2874  multidrug ABC transporter inner membrane protein  37.09 
 
 		 269 aa  163  3e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.189586 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2859  multidrug ABC transporter inner membrane protein  37.09 
 
 		 269 aa  163  3e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.464408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3121  multidrug ABC transporter inner membrane protein  32.45 
 
 		 274 aa  133  3e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.656441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3736  ABC-2 type transporter  34.57 
 
 		 263 aa  130  2.0000000000000002e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3388  ABC-2 type transporter  32.14 
 
 		 282 aa  129  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.264053 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12951  daunorubicin-dim-transport integral membrane protein ABC transporter drrB  32.69 
 
 		 289 aa  112  7.000000000000001e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1755  ABC-2 type transporter  35.75 
 
 		 264 aa  108  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.586856  decreased coverage  0.00328589 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0340  ABC-2 type transporter  26.72 
 
 		 273 aa  90.5  3e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.171685  hitchhiker  0.00234396 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2716  ABC-2 type transporter  30.49 
 
 		 254 aa  90.1  4e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3166  ABC-2 type transporter  39.04 
 
 		 245 aa  89.4  5e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.591825 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3106  ABC-2 type transporter  39.04 
 
 		 229 aa  89  7e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1384  ABC-2 type transporter  30.18 
 
 		 269 aa  83.6  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.78336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1352  ABC-2 type transporter  28.69 
 
 		 254 aa  80.9  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.137638  normal  0.090478 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23570  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  28.96 
 
 		 267 aa  79  0.00000000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.24456  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4081  ABC-2 type transporter  28.36 
 
 		 274 aa  77.8  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.431533 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6787  ABC-2 type transporter  32.08 
 
 		 268 aa  76.3  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000212784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1473  hypothetical protein  28.81 
 
 		 269 aa  75.5  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.377134  normal  0.24112 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0655  ABC-2 type transporter  26.55 
 
 		 273 aa  75.5  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.121363  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0918  ABC-2 type transporter  27.8 
 
 		 254 aa  74.7  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0538  ABC-2 type transporter  28.63 
 
 		 267 aa  74.3  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.690834  hitchhiker  0.000010786 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3737  ABC-2 type transporter  29.95 
 
 		 294 aa  74.3  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4183  ABC-2 type transporter  29.41 
 
 		 269 aa  73.2  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.013923  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2897  ABC-2 type transporter  28.7 
 
 		 274 aa  72.8  0.000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.643507  normal  0.323486 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7215  ABC transporter (permease)  27.09 
 
 		 247 aa  72.4  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.284415 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1966  ABC-2 type transporter  30.93 
 
 		 318 aa  72.4  0.000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.115517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4023  ABC-2 type transporter  27.89 
 
 		 267 aa  72.4  0.000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.293949  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4056  ABC-2 type transporter  27.89 
 
 		 267 aa  72.4  0.000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1683  ABC-2 type transporter  28.57 
 
 		 274 aa  72  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000181652  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4327  ABC-2 type transporter  33.06 
 
 		 272 aa  70.9  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3916  ABC transporter, inner membrane subunit  27.37 
 
 		 267 aa  71.2  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3922  ABC-2 type transporter  25.43 
 
 		 266 aa  70.9  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0348636  normal  0.0335688 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4551  ABC-2 type transporter  27.69 
 
 		 264 aa  70.9  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.442888  normal  0.0220595 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1622  ABC-2 type transporter  26.09 
 
 		 278 aa  70.5  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4259  ABC-2 type transporter  26.42 
 
 		 282 aa  70.1  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.573247  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4345  ABC-2 type transporter  26.42 
 
 		 282 aa  70.1  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0911686 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4638  ABC-2 type transporter  26.42 
 
 		 282 aa  70.1  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.619797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2016  ABC-2 type transporter  27.9 
 
 		 268 aa  70.1  0.00000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12952  daunorubicin-dim-transport integral membrane protein ABC transporter drrC  30.49 
 
 		 276 aa  69.3  0.00000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2775  ABC-2 type transporter  29.85 
 
 		 278 aa  69.3  0.00000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00783625  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4992  ABC-2 type transporter  27.31 
 
 		 270 aa  69.3  0.00000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.402209  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3986  ABC-2 type transporter  28.65 
 
 		 280 aa  68.2  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0393  ABC-2 type transporter  31.68 
 
 		 274 aa  67.4  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4795  ABC-2 type transporter  25.51 
 
 		 284 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597944 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1937  ABC-2 type transporter  24.02 
 
 		 284 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.008119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2294  ABC-2 type transporter  28.28 
 
 		 277 aa  67  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.911135  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1697  ABC-2 type transporter  31.61 
 
 		 271 aa  67.4  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2829  daunorubicin resistance protein C  24.64 
 
 		 287 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.212712  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2873  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit C  24.64 
 
 		 287 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.716211  normal  0.118774 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2858  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit C  24.64 
 
 		 287 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.375686  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0042  ABC-2 type transporter  26.82 
 
 		 266 aa  65.9  0.0000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3103  ABC transporter protein  28.57 
 
 		 280 aa  65.9  0.0000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00849207 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0497  ABC-2 type transporter  25.63 
 
 		 286 aa  65.1  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.779296  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0937  ABC-2 type transporter  27.69 
 
 		 269 aa  65.5  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1122  ABC-2 type transporter  29.79 
 
 		 285 aa  64.7  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.408605  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0959  ABC-2 type transporter  27.2 
 
 		 256 aa  65.5  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00197586  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1236  ABC-2 type transporter  28.25 
 
 		 281 aa  64.7  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0014  ABC-2 type transporter  23.85 
 
 		 304 aa  64.7  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5259  ABC-2 type transporter  26.99 
 
 		 277 aa  63.5  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3467  ABC transporter, efflux permease protein  28.02 
 
 		 249 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000810233  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3718  ABC-2 type transporter  27.57 
 
 		 260 aa  63.5  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.282288  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4761  ABC-2 type transporter  23.27 
 
 		 261 aa  63.9  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000109025  hitchhiker  0.000621886 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2043  ABC-2 type transporter  25.21 
 
 		 279 aa  63.2  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.167343  hitchhiker  0.00685853 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0746  ABC-2 type transporter  27.98 
 
 		 280 aa  63.2  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07250  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  23.15 
 
 		 265 aa  63.2  0.000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.307058 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1483  ABC-2 type transporter  27.94 
 
 		 269 aa  63.2  0.000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00140227  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1034  ABC-2 type transporter  27.67 
 
 		 254 aa  62.8  0.000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.489208  normal  0.0976555 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2021  hypothetical protein  28.96 
 
 		 289 aa  62.4  0.000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.290119  normal  0.988573 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4106  ABC-2 type transporter  25.73 
 
 		 293 aa  62.4  0.000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1123  ABC-2 type transporter  22.88 
 
 		 257 aa  62.4  0.000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1878  ABC-2 type transporter  31.89 
 
 		 273 aa  62.4  0.000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3239  ABC transporter efflux permease  27.54 
 
 		 249 aa  62.4  0.000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3492  ABC transporter permease  27.54 
 
 		 249 aa  62.4  0.000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.799548  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6375  ABC-2 type transporter  25.11 
 
 		 247 aa  62.4  0.000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3453  ABC transporter, efflux permease protein  27.54 
 
 		 249 aa  62.4  0.000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3149  ABC transporter efflux permease; daunorubicin resistance transmembrane protein  27.05 
 
 		 249 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0286068  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3132  ABC-2 type transporter  26.89 
 
 		 248 aa  61.6  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.571081  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4656  ABC-2 type transporter  29.29 
 
 		 285 aa  60.8  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.890125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0542  ABC-2 type transporter  28.02 
 
 		 253 aa  60.5  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3328  ABC-2 type transporter  28.52 
 
 		 281 aa  60.5  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.45338  normal  0.334159 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4383  ABC-2 type transporter  27.73 
 
 		 253 aa  60.8  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.557459 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4092  ABC-2 type transporter  26.19 
 
 		 290 aa  60.5  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0130357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4874  ABC-2 type transporter  27.78 
 
 		 253 aa  60.5  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0328295 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0451  ABC-type multidrug transport system, permease component  27.12 
 
 		 269 aa  60.1  0.00000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0034336  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0598  ABC-2 type transporter  28.73 
 
 		 277 aa  60.1  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4190  ABC-2 type transporter  25.62 
 
 		 257 aa  59.7  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1808  ABC transporter, efflux permease protein  27.36 
 
 		 249 aa  59.7  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3253  ABC transporter related  25.85 
 
 		 265 aa  59.7  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00665342  normal  0.245763 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4512  ABC-2 type transporter  22.65 
 
 		 281 aa  58.9  0.00000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30730  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  26.18 
 
 		 277 aa  58.9  0.00000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.364162  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0039  ABC-2 type transporter  23.71 
 
 		 267 aa  58.2  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.953662 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3147  ABC-2 type transporter  27.83 
 
 		 249 aa  57.8  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.145802  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0674  ABC-2 type transporter  23.89 
 
 		 272 aa  57.4  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.890968  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3212  ABC transporter efflux permease; daunorubicin resistance transmembrane protein  27.05 
 
 		 249 aa  57  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2939  ABC-2 type transporter  25.44 
 
 		 286 aa  57  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.27677 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0058  ABC-2 type transporter  26.84 
 
 		 271 aa  56.6  0.0000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22030  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  25.95 
 
 		 281 aa  56.6  0.0000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1476  ABC-2 type transporter  26.18 
 
 		 267 aa  56.6  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>