More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4656 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4656  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 285 aa  569  1e-161  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.890125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3893  ABC-2 type transporter  93.39 
 
 		 242 aa  433  1e-120  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0012751  normal  0.0102027 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1122  ABC-2 type transporter  78.8 
 
 		 285 aa  418  1e-116  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.408605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2021  hypothetical protein  71.72 
 
 		 289 aa  389  1e-107  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.290119  normal  0.988573 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0393  ABC-2 type transporter  70.68 
 
 		 274 aa  382  1e-105  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3103  ABC transporter protein  68.33 
 
 		 280 aa  379  1e-104  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00849207 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6250  ABC-2 type transporter  71.58 
 
 		 285 aa  380  1e-104  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.243116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0042  ABC-2 type transporter  56.59 
 
 		 266 aa  311  7.999999999999999e-84  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1351  ABC-2 type transporter  60.41 
 
 		 272 aa  306  2.0000000000000002e-82  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0414359  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1622  ABC-2 type transporter  52.75 
 
 		 278 aa  302  4.0000000000000003e-81  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1697  ABC-2 type transporter  54.12 
 
 		 271 aa  298  6e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22030  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  63.92 
 
 		 281 aa  294  1e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30730  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  51.85 
 
 		 277 aa  251  8.000000000000001e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.364162  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0746  ABC-2 type transporter  44.01 
 
 		 280 aa  237  2e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1504  ABC-2 type transporter  42.23 
 
 		 272 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.457097  normal  0.179064 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3328  ABC-2 type transporter  44.53 
 
 		 281 aa  226  3e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.45338  normal  0.334159 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1236  ABC-2 type transporter  46.96 
 
 		 281 aa  223  4e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3916  ABC transporter, inner membrane subunit  42.47 
 
 		 267 aa  219  5e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4023  ABC-2 type transporter  42.47 
 
 		 267 aa  218  7e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.293949  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4056  ABC-2 type transporter  42.47 
 
 		 267 aa  218  7e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1966  ABC-2 type transporter  45.45 
 
 		 318 aa  215  5e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.115517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4936  ABC-2 type transporter  41.2 
 
 		 280 aa  213  1.9999999999999998e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.707728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0451  ABC-type multidrug transport system, permease component  42.39 
 
 		 269 aa  206  2e-52  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0034336  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5259  ABC-2 type transporter  40.94 
 
 		 277 aa  204  2e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2294  ABC-2 type transporter  42.96 
 
 		 277 aa  203  3e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.911135  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1384  ABC-2 type transporter  41.74 
 
 		 269 aa  202  4e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.78336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2775  ABC-2 type transporter  39.35 
 
 		 278 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00783625  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2897  ABC-2 type transporter  40.56 
 
 		 274 aa  199  5e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.643507  normal  0.323486 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3253  ABC transporter related  40 
 
 		 265 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00665342  normal  0.245763 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2939  ABC-2 type transporter  39.38 
 
 		 286 aa  193  2e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.27677 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2716  ABC-2 type transporter  41.06 
 
 		 254 aa  193  3e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6787  ABC-2 type transporter  41.41 
 
 		 268 aa  187  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000212784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1352  ABC-2 type transporter  39.2 
 
 		 254 aa  186  4e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.137638  normal  0.090478 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35420  ABC-type multidrug transport system, permease component  37.83 
 
 		 257 aa  186  4e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1683  ABC-2 type transporter  38.91 
 
 		 274 aa  185  8e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000181652  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2100  ABC-2 type transporter  40.82 
 
 		 267 aa  181  1e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0918  ABC-2 type transporter  40.57 
 
 		 254 aa  174  1.9999999999999998e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23570  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  35.77 
 
 		 267 aa  170  2e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.24456  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0538  ABC-2 type transporter  37.4 
 
 		 267 aa  163  3e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.690834  hitchhiker  0.000010786 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0937  ABC-2 type transporter  36.29 
 
 		 269 aa  160  2e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1839  ABC-2 type transporter  38.19 
 
 		 266 aa  158  9e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4992  ABC-2 type transporter  36.48 
 
 		 270 aa  158  1e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.402209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4551  ABC-2 type transporter  36.99 
 
 		 264 aa  158  1e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.442888  normal  0.0220595 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0666  ABC-2 type transporter  36.51 
 
 		 285 aa  157  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1937  ABC-2 type transporter  34.36 
 
 		 284 aa  156  3e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.008119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0340  ABC-2 type transporter  34.81 
 
 		 273 aa  155  5.0000000000000005e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.171685  hitchhiker  0.00234396 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2043  ABC-2 type transporter  34.85 
 
 		 279 aa  154  1e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.167343  hitchhiker  0.00685853 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1473  hypothetical protein  38.11 
 
 		 269 aa  153  2.9999999999999998e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.377134  normal  0.24112 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39010  ABC-type multidrug transport system, permease component  33.97 
 
 		 271 aa  152  5.9999999999999996e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.436846 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4795  ABC-2 type transporter  33.98 
 
 		 284 aa  149  5e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597944 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1476  ABC-2 type transporter  34.75 
 
 		 267 aa  149  6e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4512  ABC-2 type transporter  34.7 
 
 		 281 aa  145  7.0000000000000006e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4259  ABC-2 type transporter  32.25 
 
 		 282 aa  145  9e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.573247  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4345  ABC-2 type transporter  32.25 
 
 		 282 aa  145  9e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0911686 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4638  ABC-2 type transporter  32.25 
 
 		 282 aa  145  9e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.619797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3922  ABC-2 type transporter  34.4 
 
 		 266 aa  143  3e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0348636  normal  0.0335688 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8158  ABC-2 type transporter  34.78 
 
 		 272 aa  142  7e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.880228 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1878  ABC-2 type transporter  37.13 
 
 		 273 aa  142  9e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07250  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  35.34 
 
 		 265 aa  139  4.999999999999999e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.307058 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1483  ABC-2 type transporter  34.1 
 
 		 269 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00140227  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4092  ABC-2 type transporter  32.43 
 
 		 290 aa  134  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0130357  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3986  ABC-2 type transporter  29.89 
 
 		 280 aa  129  4.0000000000000003e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4183  ABC-2 type transporter  33.58 
 
 		 269 aa  126  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.013923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3718  ABC-2 type transporter  32.31 
 
 		 260 aa  126  4.0000000000000003e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.282288  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4383  ABC-2 type transporter  33.59 
 
 		 253 aa  123  3e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.557459 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19160  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  33.91 
 
 		 319 aa  123  4e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.338631 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2016  ABC-2 type transporter  32.41 
 
 		 268 aa  122  7e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3101  ABC-2 type transporter  31.87 
 
 		 266 aa  122  8e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0542  ABC-2 type transporter  29.57 
 
 		 253 aa  121  9.999999999999999e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24940  ABC-type multidrug transport system, permease component  33.33 
 
 		 284 aa  121  9.999999999999999e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.484855 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0039  ABC-2 type transporter  32.79 
 
 		 267 aa  119  7e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.953662 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0618  ABC-2 type transporter  29.66 
 
 		 267 aa  118  9.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.099686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4874  ABC-2 type transporter  33.86 
 
 		 253 aa  116  3e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0328295 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8859  ABC transporter permease  31.2 
 
 		 253 aa  116  5e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0058  ABC-2 type transporter  30.77 
 
 		 271 aa  115  6.9999999999999995e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3149  ABC transporter efflux permease; daunorubicin resistance transmembrane protein  28.12 
 
 		 249 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0286068  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18340  ABC-type multidrug transport system, permease component  32.11 
 
 		 282 aa  114  1.0000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.823039 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3467  ABC transporter, efflux permease protein  28.12 
 
 		 249 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000810233  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1123  ABC-2 type transporter  35.71 
 
 		 275 aa  114  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3239  ABC transporter efflux permease  27.73 
 
 		 249 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3492  ABC transporter permease  27.73 
 
 		 249 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.799548  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3453  ABC transporter, efflux permease protein  27.73 
 
 		 249 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7215  ABC transporter (permease)  29.96 
 
 		 247 aa  113  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.284415 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0895  ABC-2 type transporter  32.66 
 
 		 266 aa  113  4.0000000000000004e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1034  ABC-2 type transporter  31.64 
 
 		 254 aa  112  5e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.489208  normal  0.0976555 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3212  ABC transporter efflux permease; daunorubicin resistance transmembrane protein  27.73 
 
 		 249 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1808  ABC transporter, efflux permease protein  26.95 
 
 		 249 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3147  ABC-2 type transporter  27.24 
 
 		 249 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.145802  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0014  ABC-2 type transporter  30.25 
 
 		 304 aa  111  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4106  ABC-2 type transporter  31.55 
 
 		 293 aa  110  2.0000000000000002e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3438  ABC transporter, efflux permease protein  26.95 
 
 		 249 aa  110  3e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3446  ABC transporter, efflux permease protein  27.53 
 
 		 249 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00692281  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1684  ABC-2 type transporter  30.31 
 
 		 251 aa  109  5e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0674  ABC-2 type transporter  29.13 
 
 		 272 aa  109  6e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.890968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5654  ABC-2 type transporter  32.93 
 
 		 267 aa  108  8.000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1743  ABC-2 type transporter  32.08 
 
 		 271 aa  108  1e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000246748 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3016  ABC-2 type transporter  31.75 
 
 		 254 aa  108  1e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.021308 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3132  ABC-2 type transporter  33.33 
 
 		 248 aa  106  3e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.571081  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0375  ABC-2 type transporter  27.76 
 
 		 264 aa  106  4e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.133292  hitchhiker  0.00534901 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1755  ABC-2 type transporter  32.32 
 
 		 264 aa  103  3e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.586856  decreased coverage  0.00328589 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>