More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6787 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_6787  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 268 aa  524  1e-148  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000212784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1683  ABC-2 type transporter  56.54 
 
 		 274 aa  278  7e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000181652  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2716  ABC-2 type transporter  57.03 
 
 		 254 aa  276  2e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1352  ABC-2 type transporter  55.47 
 
 		 254 aa  261  1e-68  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.137638  normal  0.090478 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5259  ABC-2 type transporter  47.51 
 
 		 277 aa  248  1e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30730  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  49.02 
 
 		 277 aa  242  3.9999999999999997e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.364162  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1384  ABC-2 type transporter  48.99 
 
 		 269 aa  232  4.0000000000000004e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.78336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23570  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  43.98 
 
 		 267 aa  228  6e-59  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.24456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4056  ABC-2 type transporter  46.92 
 
 		 267 aa  225  7e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4023  ABC-2 type transporter  46.92 
 
 		 267 aa  225  7e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.293949  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3916  ABC transporter, inner membrane subunit  46.92 
 
 		 267 aa  224  1e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1622  ABC-2 type transporter  44.26 
 
 		 278 aa  223  2e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0042  ABC-2 type transporter  43.75 
 
 		 266 aa  224  2e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1122  ABC-2 type transporter  42.45 
 
 		 285 aa  215  8e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.408605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35420  ABC-type multidrug transport system, permease component  43.07 
 
 		 257 aa  214  9.999999999999999e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2897  ABC-2 type transporter  46.36 
 
 		 274 aa  213  1.9999999999999998e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.643507  normal  0.323486 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3328  ABC-2 type transporter  44.36 
 
 		 281 aa  212  5.999999999999999e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.45338  normal  0.334159 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1351  ABC-2 type transporter  42.74 
 
 		 272 aa  211  9e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0414359  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1236  ABC-2 type transporter  46.46 
 
 		 281 aa  211  1e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1697  ABC-2 type transporter  40.62 
 
 		 271 aa  211  1e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0746  ABC-2 type transporter  42.75 
 
 		 280 aa  209  4e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3253  ABC transporter related  41.02 
 
 		 265 aa  209  5e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00665342  normal  0.245763 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4551  ABC-2 type transporter  43.55 
 
 		 264 aa  207  1e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.442888  normal  0.0220595 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0918  ABC-2 type transporter  43.27 
 
 		 254 aa  207  2e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1966  ABC-2 type transporter  43.8 
 
 		 318 aa  206  4e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.115517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2939  ABC-2 type transporter  42.35 
 
 		 286 aa  202  5e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.27677 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2294  ABC-2 type transporter  44.86 
 
 		 277 aa  202  5e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.911135  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0340  ABC-2 type transporter  43.13 
 
 		 273 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.171685  hitchhiker  0.00234396 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2775  ABC-2 type transporter  40.08 
 
 		 278 aa  198  6e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00783625  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1473  hypothetical protein  41.15 
 
 		 269 aa  196  3e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.377134  normal  0.24112 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0393  ABC-2 type transporter  39.85 
 
 		 274 aa  196  5.000000000000001e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4992  ABC-2 type transporter  41.31 
 
 		 270 aa  195  8.000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.402209  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3103  ABC transporter protein  41.02 
 
 		 280 aa  193  2e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00849207 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2100  ABC-2 type transporter  41.11 
 
 		 267 aa  192  6e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22030  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  43.23 
 
 		 281 aa  190  2e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4656  ABC-2 type transporter  41.83 
 
 		 285 aa  190  2.9999999999999997e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.890125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2021  hypothetical protein  41.2 
 
 		 289 aa  189  5e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.290119  normal  0.988573 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4936  ABC-2 type transporter  39.53 
 
 		 280 aa  186  5e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.707728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6250  ABC-2 type transporter  40.4 
 
 		 285 aa  185  6e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.243116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1937  ABC-2 type transporter  37.27 
 
 		 284 aa  177  1e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.008119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0666  ABC-2 type transporter  38.91 
 
 		 285 aa  177  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1504  ABC-2 type transporter  35.66 
 
 		 272 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.457097  normal  0.179064 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3893  ABC-2 type transporter  39.75 
 
 		 242 aa  171  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0012751  normal  0.0102027 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1839  ABC-2 type transporter  41.77 
 
 		 266 aa  171  1e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4795  ABC-2 type transporter  37.64 
 
 		 284 aa  169  5e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597944 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4512  ABC-2 type transporter  38.82 
 
 		 281 aa  169  6e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4259  ABC-2 type transporter  37.74 
 
 		 282 aa  165  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.573247  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4345  ABC-2 type transporter  37.74 
 
 		 282 aa  165  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0911686 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4638  ABC-2 type transporter  37.74 
 
 		 282 aa  165  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.619797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0937  ABC-2 type transporter  34.33 
 
 		 269 aa  165  5.9999999999999996e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4092  ABC-2 type transporter  35.61 
 
 		 290 aa  165  6.9999999999999995e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0130357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4183  ABC-2 type transporter  38.38 
 
 		 269 aa  163  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.013923  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0674  ABC-2 type transporter  36.92 
 
 		 272 aa  161  1e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.890968  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0538  ABC-2 type transporter  36.4 
 
 		 267 aa  156  3e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.690834  hitchhiker  0.000010786 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39010  ABC-type multidrug transport system, permease component  36.36 
 
 		 271 aa  156  4e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.436846 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2043  ABC-2 type transporter  40.68 
 
 		 279 aa  154  1e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.167343  hitchhiker  0.00685853 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3922  ABC-2 type transporter  36.99 
 
 		 266 aa  152  7e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0348636  normal  0.0335688 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0451  ABC-type multidrug transport system, permease component  33.33 
 
 		 269 aa  152  8e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0034336  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1476  ABC-2 type transporter  38.87 
 
 		 267 aa  150  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7215  ABC transporter (permease)  36.73 
 
 		 247 aa  148  9e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.284415 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2016  ABC-2 type transporter  36.84 
 
 		 268 aa  148  9e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1878  ABC-2 type transporter  39.08 
 
 		 273 aa  146  3e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0058  ABC-2 type transporter  34.1 
 
 		 271 aa  144  1e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4383  ABC-2 type transporter  33.06 
 
 		 253 aa  144  1e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.557459 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0895  ABC-2 type transporter  39.27 
 
 		 266 aa  144  2e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24940  ABC-type multidrug transport system, permease component  35.79 
 
 		 284 aa  144  2e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.484855 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8158  ABC-2 type transporter  36.47 
 
 		 272 aa  143  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.880228 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07250  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  36.61 
 
 		 265 aa  141  9.999999999999999e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.307058 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1034  ABC-2 type transporter  33.74 
 
 		 254 aa  140  1.9999999999999998e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.489208  normal  0.0976555 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3467  ABC transporter, efflux permease protein  30.86 
 
 		 249 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000810233  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3239  ABC transporter efflux permease  31.28 
 
 		 249 aa  138  7e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3492  ABC transporter permease  31.28 
 
 		 249 aa  138  7e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.799548  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3453  ABC transporter, efflux permease protein  31.28 
 
 		 249 aa  138  7e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0618  ABC-2 type transporter  35.06 
 
 		 267 aa  137  2e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.099686  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3149  ABC transporter efflux permease; daunorubicin resistance transmembrane protein  30.45 
 
 		 249 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0286068  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1483  ABC-2 type transporter  35.45 
 
 		 269 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00140227  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8859  ABC transporter permease  33.88 
 
 		 253 aa  135  5e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4874  ABC-2 type transporter  32.79 
 
 		 253 aa  135  9e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0328295 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3212  ABC transporter efflux permease; daunorubicin resistance transmembrane protein  30.86 
 
 		 249 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1808  ABC transporter, efflux permease protein  30.86 
 
 		 249 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0542  ABC-2 type transporter  31.51 
 
 		 253 aa  134  9.999999999999999e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3438  ABC transporter, efflux permease protein  30.86 
 
 		 249 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3986  ABC-2 type transporter  32.86 
 
 		 280 aa  134  1.9999999999999998e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3718  ABC-2 type transporter  35.62 
 
 		 260 aa  133  3e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.282288  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3101  ABC-2 type transporter  35.5 
 
 		 266 aa  132  3.9999999999999996e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3446  ABC transporter, efflux permease protein  30.04 
 
 		 249 aa  132  6e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00692281  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1258  ABC-2 type transporter  35.36 
 
 		 300 aa  132  7.999999999999999e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0375  ABC-2 type transporter  35.27 
 
 		 264 aa  132  7.999999999999999e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.133292  hitchhiker  0.00534901 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0959  ABC-2 type transporter  31.6 
 
 		 256 aa  132  7.999999999999999e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00197586  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3016  ABC-2 type transporter  34.94 
 
 		 254 aa  131  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.021308 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3147  ABC-2 type transporter  30.45 
 
 		 249 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.145802  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3132  ABC-2 type transporter  34.48 
 
 		 248 aa  128  8.000000000000001e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.571081  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1684  ABC-2 type transporter  32.13 
 
 		 251 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1755  ABC-2 type transporter  34.73 
 
 		 264 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.586856  decreased coverage  0.00328589 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2065  ABC-2 type transporter  34.71 
 
 		 254 aa  127  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4106  ABC-2 type transporter  35.89 
 
 		 293 aa  125  5e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0039  ABC-2 type transporter  33.85 
 
 		 267 aa  125  6e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.953662 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4081  ABC-2 type transporter  30.29 
 
 		 274 aa  125  8.000000000000001e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.431533 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19160  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  33.05 
 
 		 319 aa  125  1e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.338631 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0014  ABC-2 type transporter  32.3 
 
 		 304 aa  121  9.999999999999999e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>