238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_4327 on replicon NC_014159
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014159  Tpau_4327  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 272 aa  510  1e-143  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0655  ABC-2 type transporter  47.73 
 
 		 273 aa  219  3e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.121363  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3737  ABC-2 type transporter  42 
 
 		 294 aa  166  4e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3387  multidrug ABC transporter inner membrane protein  40.87 
 
 		 281 aa  156  3e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.169242 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2829  daunorubicin resistance protein C  38.1 
 
 		 287 aa  156  4e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.212712  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2873  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit C  38.1 
 
 		 287 aa  156  4e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.716211  normal  0.118774 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2858  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit C  38.1 
 
 		 287 aa  156  4e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.375686  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3120  multidrug ABC transporter inner membrane protein  41.67 
 
 		 284 aa  155  9e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.561291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12952  daunorubicin-dim-transport integral membrane protein ABC transporter drrC  37.24 
 
 		 276 aa  138  7.999999999999999e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23570  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  27 
 
 		 267 aa  99.8  4e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.24456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3107  ABC-2 type transporter  33.47 
 
 		 264 aa  99  8e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3167  ABC-2 type transporter  33.47 
 
 		 264 aa  99  8e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.804555 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5259  ABC-2 type transporter  30.83 
 
 		 277 aa  97.4  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4992  ABC-2 type transporter  29.41 
 
 		 270 aa  95.5  8e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.402209  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0340  ABC-2 type transporter  30 
 
 		 273 aa  95.5  9e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.171685  hitchhiker  0.00234396 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1754  ABC-2 type transporter  35.29 
 
 		 250 aa  95.1  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00326384 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1473  hypothetical protein  28.36 
 
 		 269 aa  90.9  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.377134  normal  0.24112 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1384  ABC-2 type transporter  31 
 
 		 269 aa  91.3  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.78336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4551  ABC-2 type transporter  28.57 
 
 		 264 aa  89  8e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.442888  normal  0.0220595 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6787  ABC-2 type transporter  30.08 
 
 		 268 aa  88.6  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000212784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8873  ABC-2 type transporter  29.3 
 
 		 270 aa  86.7  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.53633  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0674  ABC-2 type transporter  29.44 
 
 		 272 aa  83.6  0.000000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.890968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0937  ABC-2 type transporter  26.76 
 
 		 269 aa  83.2  0.000000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2864  ABC-2 type transporter  25.58 
 
 		 290 aa  82.8  0.000000000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2716  ABC-2 type transporter  31.53 
 
 		 254 aa  81.3  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6375  ABC-2 type transporter  29.28 
 
 		 247 aa  79  0.00000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4092  ABC-2 type transporter  28.81 
 
 		 290 aa  79  0.00000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0130357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1697  ABC-2 type transporter  29.24 
 
 		 271 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1258  ABC-2 type transporter  32.53 
 
 		 300 aa  78.6  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0918  ABC-2 type transporter  26.98 
 
 		 254 aa  77.8  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4761  ABC-2 type transporter  29.3 
 
 		 261 aa  77.8  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000109025  hitchhiker  0.000621886 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4328  ABC-2 type transporter  34.02 
 
 		 259 aa  76.6  0.0000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2775  ABC-2 type transporter  28.14 
 
 		 278 aa  76.6  0.0000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00783625  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1755  ABC-2 type transporter  35.03 
 
 		 264 aa  76.3  0.0000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.586856  decreased coverage  0.00328589 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3132  ABC-2 type transporter  28.46 
 
 		 248 aa  75.9  0.0000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.571081  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4190  ABC-2 type transporter  28.57 
 
 		 257 aa  75.5  0.0000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0654  ABC-2 type transporter  33.06 
 
 		 270 aa  75.5  0.0000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.122619  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4106  ABC-2 type transporter  27.91 
 
 		 293 aa  74.7  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4081  ABC-2 type transporter  26.48 
 
 		 274 aa  75.1  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.431533 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1122  ABC-2 type transporter  28.28 
 
 		 285 aa  74.7  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.408605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2065  ABC-2 type transporter  29.51 
 
 		 254 aa  73.9  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0363  ABC-2 type transporter  26.07 
 
 		 289 aa  73.6  0.000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35420  ABC-type multidrug transport system, permease component  27.57 
 
 		 257 aa  73.2  0.000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7215  ABC transporter (permease)  29.96 
 
 		 247 aa  72.8  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.284415 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5588  ABC-2 type transporter  27.08 
 
 		 261 aa  72.8  0.000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4656  ABC-2 type transporter  27.09 
 
 		 285 aa  71.6  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.890125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1839  ABC-2 type transporter  25.19 
 
 		 266 aa  71.6  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0542  ABC-2 type transporter  28.86 
 
 		 253 aa  70.9  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3103  ABC transporter protein  25.9 
 
 		 280 aa  70.1  0.00000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00849207 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2897  ABC-2 type transporter  26.61 
 
 		 274 aa  70.1  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.643507  normal  0.323486 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0058  ABC-2 type transporter  26.89 
 
 		 271 aa  70.1  0.00000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0375  ABC-2 type transporter  28.76 
 
 		 264 aa  70.1  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.133292  hitchhiker  0.00534901 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1352  ABC-2 type transporter  30.88 
 
 		 254 aa  70.1  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.137638  normal  0.090478 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0213  ABC transporter permease  30.67 
 
 		 257 aa  68.9  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1203  ABC-2 type transporter  30.3 
 
 		 251 aa  68.9  0.00000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0595438 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1351  ABC-2 type transporter  29.66 
 
 		 272 aa  68.2  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0414359  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1476  ABC-2 type transporter  27.8 
 
 		 267 aa  67.4  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1622  ABC-2 type transporter  30.39 
 
 		 278 aa  67  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2939  ABC-2 type transporter  26.84 
 
 		 286 aa  66.6  0.0000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.27677 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1937  ABC-2 type transporter  22.68 
 
 		 284 aa  66.6  0.0000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.008119  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0393  ABC-2 type transporter  27.16 
 
 		 274 aa  66.2  0.0000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2016  ABC-2 type transporter  27.92 
 
 		 268 aa  66.2  0.0000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3922  ABC-2 type transporter  26.04 
 
 		 266 aa  66.2  0.0000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0348636  normal  0.0335688 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0538  ABC-2 type transporter  25.7 
 
 		 267 aa  66.2  0.0000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.690834  hitchhiker  0.000010786 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2250  ABC-2 type transporter  27.6 
 
 		 256 aa  65.9  0.0000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.239998  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24940  ABC-type multidrug transport system, permease component  26.32 
 
 		 284 aa  65.9  0.0000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.484855 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1189  ABC-2 type transporter  27.03 
 
 		 263 aa  65.1  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000916915 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1020  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  29.28 
 
 		 249 aa  65.5  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0552463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8158  ABC-2 type transporter  25.83 
 
 		 272 aa  64.3  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.880228 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39010  ABC-type multidrug transport system, permease component  26 
 
 		 271 aa  63.9  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.436846 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2830  ABC transporter, DrrB efflux protein  28.43 
 
 		 269 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.578929  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2874  multidrug ABC transporter inner membrane protein  28.43 
 
 		 269 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.189586 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2859  multidrug ABC transporter inner membrane protein  28.43 
 
 		 269 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.464408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4259  ABC-2 type transporter  24.29 
 
 		 282 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.573247  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4345  ABC-2 type transporter  24.29 
 
 		 282 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0911686 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4638  ABC-2 type transporter  24.29 
 
 		 282 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.619797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1683  ABC-2 type transporter  26.81 
 
 		 274 aa  63.5  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000181652  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0959  ABC-2 type transporter  25.93 
 
 		 256 aa  63.2  0.000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00197586  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4795  ABC-2 type transporter  23.84 
 
 		 284 aa  63.5  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597944 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4170  ABC-2 type transporter  29.72 
 
 		 270 aa  63.2  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2021  hypothetical protein  26.7 
 
 		 289 aa  63.2  0.000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.290119  normal  0.988573 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0966  ABC-2 type transporter  28.22 
 
 		 259 aa  62.8  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07250  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  27.63 
 
 		 265 aa  62.8  0.000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.307058 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0666  ABC-2 type transporter  25.59 
 
 		 285 aa  61.6  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0497  ABC-2 type transporter  27.15 
 
 		 286 aa  62  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.779296  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0042  ABC-2 type transporter  28.75 
 
 		 266 aa  61.2  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1966  ABC-2 type transporter  29.12 
 
 		 318 aa  60.8  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.115517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1684  ABC-2 type transporter  25.49 
 
 		 251 aa  60.5  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4150  hypothetical protein  25.23 
 
 		 261 aa  60.5  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000233601  normal  0.0693377 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1808  ABC transporter, efflux permease protein  23.62 
 
 		 249 aa  60.1  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0062  ABC-2 type transporter  24.41 
 
 		 260 aa  60.1  0.00000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000566487  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3147  ABC-2 type transporter  24.52 
 
 		 249 aa  60.1  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.145802  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1766  multidrug ABC transporter, permease protein  26.21 
 
 		 242 aa  59.3  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4383  ABC-2 type transporter  24.26 
 
 		 253 aa  59.3  0.00000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.557459 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3893  ABC-2 type transporter  25.85 
 
 		 242 aa  59.3  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0012751  normal  0.0102027 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3467  ABC transporter, efflux permease protein  23.23 
 
 		 249 aa  58.9  0.00000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000810233  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1654  hypothetical protein  31.87 
 
 		 261 aa  58.5  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4183  ABC-2 type transporter  26.72 
 
 		 269 aa  58.5  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.013923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3438  ABC transporter, efflux permease protein  23.62 
 
 		 249 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3492  ABC transporter permease  23.23 
 
 		 249 aa  57.4  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.799548  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>