More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_4638 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_4259  ABC-2 type transporter  100 
 
 
282 aa  562  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.573247  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4345  ABC-2 type transporter  100 
 
 
282 aa  562  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0911686 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4638  ABC-2 type transporter  100 
 
 
282 aa  562  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.619797  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1937  ABC-2 type transporter  89.08 
 
 
284 aa  496  1e-139  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.008119  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4795  ABC-2 type transporter  89.79 
 
 
284 aa  468  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.597944 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4512  ABC-2 type transporter  74.64 
 
 
281 aa  394  1e-108  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0937  ABC-2 type transporter  49.03 
 
 
269 aa  247  2e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0538  ABC-2 type transporter  48.44 
 
 
267 aa  246  4e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.690834  hitchhiker  0.000010786 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3922  ABC-2 type transporter  49 
 
 
266 aa  242  3.9999999999999997e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0348636  normal  0.0335688 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0666  ABC-2 type transporter  46.92 
 
 
285 aa  237  2e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1839  ABC-2 type transporter  46.3 
 
 
266 aa  235  6e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1476  ABC-2 type transporter  50.39 
 
 
267 aa  230  2e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07250  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  46.15 
 
 
265 aa  228  6e-59  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.307058 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1483  ABC-2 type transporter  48.08 
 
 
269 aa  226  3e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00140227  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0918  ABC-2 type transporter  44.36 
 
 
254 aa  213  1.9999999999999998e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0618  ABC-2 type transporter  43.97 
 
 
267 aa  213  2.9999999999999995e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.099686  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4092  ABC-2 type transporter  40.7 
 
 
290 aa  204  9e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0130357  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39010  ABC-type multidrug transport system, permease component  44.19 
 
 
271 aa  202  4e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.436846 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3718  ABC-2 type transporter  41.7 
 
 
260 aa  197  2.0000000000000003e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.282288  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3986  ABC-2 type transporter  42.41 
 
 
280 aa  195  6e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24940  ABC-type multidrug transport system, permease component  40.24 
 
 
284 aa  190  2e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.484855 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1473  hypothetical protein  39.69 
 
 
269 aa  188  7e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.377134  normal  0.24112 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19160  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  40.31 
 
 
319 aa  186  3e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.338631 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4992  ABC-2 type transporter  37.13 
 
 
270 aa  186  3e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.402209  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3101  ABC-2 type transporter  44.44 
 
 
266 aa  185  6e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0039  ABC-2 type transporter  43.25 
 
 
267 aa  183  4.0000000000000006e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.953662 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5718  ABC-2 type transporter  42.13 
 
 
263 aa  179  4e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1384  ABC-2 type transporter  40.08 
 
 
269 aa  179  5.999999999999999e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.78336  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8158  ABC-2 type transporter  37.3 
 
 
272 aa  177  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.880228 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5259  ABC-2 type transporter  39.44 
 
 
277 aa  177  2e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1622  ABC-2 type transporter  35.21 
 
 
278 aa  172  6.999999999999999e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4674  ABC-2 type transporter  39.29 
 
 
276 aa  171  1e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.348942  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1258  ABC-2 type transporter  37.72 
 
 
300 aa  171  1e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1743  ABC-2 type transporter  45.18 
 
 
271 aa  171  2e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000246748 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1351  ABC-2 type transporter  36.43 
 
 
272 aa  170  3e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0414359  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2897  ABC-2 type transporter  42.11 
 
 
274 aa  169  4e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.643507  normal  0.323486 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0042  ABC-2 type transporter  34.67 
 
 
266 aa  167  1e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3103  ABC transporter protein  37.93 
 
 
280 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00849207 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4023  ABC-2 type transporter  36.07 
 
 
267 aa  162  7e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.293949  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4056  ABC-2 type transporter  36.07 
 
 
267 aa  162  7e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0895  ABC-2 type transporter  37.16 
 
 
266 aa  161  1e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2716  ABC-2 type transporter  38.52 
 
 
254 aa  160  2e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6787  ABC-2 type transporter  37.74 
 
 
268 aa  160  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000212784  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3916  ABC transporter, inner membrane subunit  35.71 
 
 
267 aa  160  3e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5081  ABC transporter related protein  35.77 
 
 
260 aa  157  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.630665  normal  0.675914 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30730  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  35.69 
 
 
277 aa  157  2e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.364162  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0746  ABC-2 type transporter  34.89 
 
 
280 aa  156  4e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1352  ABC-2 type transporter  37.07 
 
 
254 aa  155  6e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.137638  normal  0.090478 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1122  ABC-2 type transporter  35.02 
 
 
285 aa  155  7e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.408605  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1683  ABC-2 type transporter  38.38 
 
 
274 aa  154  1e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000181652  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1697  ABC-2 type transporter  34.07 
 
 
271 aa  154  1e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3253  ABC transporter related  36.13 
 
 
265 aa  154  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00665342  normal  0.245763 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3328  ABC-2 type transporter  36 
 
 
281 aa  154  2e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.45338  normal  0.334159 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2021  hypothetical protein  35.52 
 
 
289 aa  152  5e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.290119  normal  0.988573 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5654  ABC-2 type transporter  40.4 
 
 
267 aa  151  1e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0393  ABC-2 type transporter  34.48 
 
 
274 aa  148  8e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0340  ABC-2 type transporter  33.45 
 
 
273 aa  147  1.0000000000000001e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.171685  hitchhiker  0.00234396 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4656  ABC-2 type transporter  33.73 
 
 
285 aa  147  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.890125  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4551  ABC-2 type transporter  36.07 
 
 
264 aa  147  3e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.442888  normal  0.0220595 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4936  ABC-2 type transporter  35.53 
 
 
280 aa  146  4.0000000000000006e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.707728  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2294  ABC-2 type transporter  37.75 
 
 
277 aa  144  1e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.911135  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6250  ABC-2 type transporter  35.16 
 
 
285 aa  144  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.243116  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1525  ABC-2 type transporter  33.33 
 
 
290 aa  143  3e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00118323  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2939  ABC-2 type transporter  35.4 
 
 
286 aa  139  4.999999999999999e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.27677 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22030  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  36.36 
 
 
281 aa  139  6e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1236  ABC-2 type transporter  37.7 
 
 
281 aa  138  8.999999999999999e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2100  ABC-2 type transporter  33.33 
 
 
267 aa  136  3.0000000000000003e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23570  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  30.6 
 
 
267 aa  135  6.0000000000000005e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.24456  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3893  ABC-2 type transporter  33.2 
 
 
242 aa  134  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0012751  normal  0.0102027 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35420  ABC-type multidrug transport system, permease component  33.85 
 
 
257 aa  134  1.9999999999999998e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0451  ABC-type multidrug transport system, permease component  33.76 
 
 
269 aa  133  3.9999999999999996e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0034336  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1878  ABC-2 type transporter  34.47 
 
 
273 aa  132  7.999999999999999e-30  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4183  ABC-2 type transporter  33.94 
 
 
269 aa  132  7.999999999999999e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.013923  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1966  ABC-2 type transporter  32.93 
 
 
318 aa  130  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.115517  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2775  ABC-2 type transporter  30.69 
 
 
278 aa  130  3e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00783625  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2016  ABC-2 type transporter  29.78 
 
 
268 aa  125  6e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1034  ABC-2 type transporter  28.46 
 
 
254 aa  119  6e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.489208  normal  0.0976555 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0375  ABC-2 type transporter  33.19 
 
 
264 aa  115  7.999999999999999e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.133292  hitchhiker  0.00534901 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5588  ABC-2 type transporter  32.88 
 
 
261 aa  115  8.999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3239  ABC transporter efflux permease  28.68 
 
 
249 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3453  ABC transporter, efflux permease protein  28.68 
 
 
249 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3492  ABC transporter permease  28.68 
 
 
249 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.799548  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1504  ABC-2 type transporter  26.55 
 
 
272 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.457097  normal  0.179064 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1808  ABC transporter, efflux permease protein  28.68 
 
 
249 aa  113  3e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8859  ABC transporter permease  30.95 
 
 
253 aa  113  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0542  ABC-2 type transporter  29.23 
 
 
253 aa  112  7.000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3016  ABC-2 type transporter  29.12 
 
 
254 aa  112  7.000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.021308 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3467  ABC transporter, efflux permease protein  29.07 
 
 
249 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000810233  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3149  ABC transporter efflux permease; daunorubicin resistance transmembrane protein  27.91 
 
 
249 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0286068  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8873  ABC-2 type transporter  28.63 
 
 
270 aa  111  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.53633  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0674  ABC-2 type transporter  31.02 
 
 
272 aa  110  3e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.890968  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4383  ABC-2 type transporter  33.33 
 
 
253 aa  109  4.0000000000000004e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.557459 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0959  ABC-2 type transporter  31.34 
 
 
256 aa  109  5e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00197586  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1684  ABC-2 type transporter  31.68 
 
 
251 aa  109  5e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3438  ABC transporter, efflux permease protein  28.68 
 
 
249 aa  108  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3212  ABC transporter efflux permease; daunorubicin resistance transmembrane protein  28.68 
 
 
249 aa  107  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3147  ABC-2 type transporter  28.68 
 
 
249 aa  107  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.145802  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7215  ABC transporter (permease)  31.88 
 
 
247 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.284415 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3446  ABC transporter, efflux permease protein  28.29 
 
 
249 aa  105  6e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00692281  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4874  ABC-2 type transporter  29.5 
 
 
253 aa  104  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0328295 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>