More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_4081 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_4081  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 274 aa  536  1e-151  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.431533 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7215  ABC transporter (permease)  46.47 
 
 		 247 aa  209  4e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.284415 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0674  ABC-2 type transporter  45.16 
 
 		 272 aa  204  1e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.890968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4761  ABC-2 type transporter  45.97 
 
 		 261 aa  203  2e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000109025  hitchhiker  0.000621886 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0058  ABC-2 type transporter  42.21 
 
 		 271 aa  198  7.999999999999999e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3149  ABC transporter efflux permease; daunorubicin resistance transmembrane protein  41.74 
 
 		 249 aa  195  6e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0286068  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3467  ABC transporter, efflux permease protein  41.74 
 
 		 249 aa  195  7e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000810233  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2016  ABC-2 type transporter  40.62 
 
 		 268 aa  194  1e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3239  ABC transporter efflux permease  41.32 
 
 		 249 aa  192  5e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3492  ABC transporter permease  41.32 
 
 		 249 aa  192  5e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.799548  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3453  ABC transporter, efflux permease protein  41.32 
 
 		 249 aa  192  5e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1808  ABC transporter, efflux permease protein  41.32 
 
 		 249 aa  192  7e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1034  ABC-2 type transporter  44.54 
 
 		 254 aa  191  2e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.489208  normal  0.0976555 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3446  ABC transporter, efflux permease protein  41.74 
 
 		 249 aa  189  4e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00692281  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3438  ABC transporter, efflux permease protein  42.15 
 
 		 249 aa  189  4e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3147  ABC-2 type transporter  42.15 
 
 		 249 aa  188  8e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.145802  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3212  ABC transporter efflux permease; daunorubicin resistance transmembrane protein  41.74 
 
 		 249 aa  186  3e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0959  ABC-2 type transporter  42.08 
 
 		 256 aa  184  1.0000000000000001e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00197586  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2065  ABC-2 type transporter  44.4 
 
 		 254 aa  180  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0542  ABC-2 type transporter  40.08 
 
 		 253 aa  179  5.999999999999999e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4383  ABC-2 type transporter  41.67 
 
 		 253 aa  176  4e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.557459 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4190  ABC-2 type transporter  42.74 
 
 		 257 aa  175  8e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8859  ABC transporter permease  39.75 
 
 		 253 aa  175  9e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4874  ABC-2 type transporter  42.86 
 
 		 253 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0328295 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3016  ABC-2 type transporter  43.28 
 
 		 254 aa  171  7.999999999999999e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.021308 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3132  ABC-2 type transporter  40.35 
 
 		 248 aa  171  1e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.571081  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1684  ABC-2 type transporter  42.5 
 
 		 251 aa  171  1e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00340  ABC-type multidrug transport system, permease component  42.26 
 
 		 259 aa  166  5e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.15345 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0213  ABC transporter permease  41.37 
 
 		 257 aa  162  6e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6375  ABC-2 type transporter  37.5 
 
 		 247 aa  160  2e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0375  ABC-2 type transporter  36.82 
 
 		 264 aa  156  4e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.133292  hitchhiker  0.00534901 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4992  ABC-2 type transporter  37.21 
 
 		 270 aa  155  6e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.402209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5588  ABC-2 type transporter  37.11 
 
 		 261 aa  153  4e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1473  hypothetical protein  36.99 
 
 		 269 aa  146  4.0000000000000006e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.377134  normal  0.24112 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1189  ABC-2 type transporter  39.56 
 
 		 263 aa  144  1e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000916915 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8873  ABC-2 type transporter  35.32 
 
 		 270 aa  144  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.53633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0340  ABC-2 type transporter  38.78 
 
 		 273 aa  140  3e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.171685  hitchhiker  0.00234396 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2086  ABC-2 type transporter  41.84 
 
 		 267 aa  139  4.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5259  ABC-2 type transporter  32.09 
 
 		 277 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23570  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  31.42 
 
 		 267 aa  133  3e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.24456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0918  ABC-2 type transporter  38.03 
 
 		 254 aa  131  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2363  ABC-2 type transporter  41.01 
 
 		 267 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0153945  hitchhiker  0.00708379 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35420  ABC-type multidrug transport system, permease component  34.45 
 
 		 257 aa  125  1e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0598  ABC-2 type transporter  37.28 
 
 		 277 aa  124  1e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1384  ABC-2 type transporter  30.36 
 
 		 269 aa  122  7e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.78336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4183  ABC-2 type transporter  34.55 
 
 		 269 aa  122  7e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.013923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0042  ABC-2 type transporter  32.67 
 
 		 266 aa  119  6e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1878  ABC-2 type transporter  38.6 
 
 		 273 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6787  ABC-2 type transporter  30.29 
 
 		 268 aa  118  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000212784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0451  ABC-type multidrug transport system, permease component  32.72 
 
 		 269 aa  117  1.9999999999999998e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0034336  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4551  ABC-2 type transporter  31.27 
 
 		 264 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.442888  normal  0.0220595 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1622  ABC-2 type transporter  31.58 
 
 		 278 aa  115  7.999999999999999e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1697  ABC-2 type transporter  31.3 
 
 		 271 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2716  ABC-2 type transporter  33.75 
 
 		 254 aa  113  3e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0666  ABC-2 type transporter  35.24 
 
 		 285 aa  113  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4936  ABC-2 type transporter  31.86 
 
 		 280 aa  113  4.0000000000000004e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.707728  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0937  ABC-2 type transporter  34.22 
 
 		 269 aa  112  6e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22030  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  31.71 
 
 		 281 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3328  ABC-2 type transporter  32.76 
 
 		 281 aa  109  4.0000000000000004e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.45338  normal  0.334159 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1839  ABC-2 type transporter  34.29 
 
 		 266 aa  107  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2775  ABC-2 type transporter  32.16 
 
 		 278 aa  106  4e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00783625  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0287  ABC-2 type transporter  39.75 
 
 		 284 aa  106  5e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1683  ABC-2 type transporter  32.08 
 
 		 274 aa  106  5e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000181652  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0393  ABC-2 type transporter  30.13 
 
 		 274 aa  105  5e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0538  ABC-2 type transporter  31.19 
 
 		 267 aa  105  6e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.690834  hitchhiker  0.000010786 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2939  ABC-2 type transporter  33.02 
 
 		 286 aa  105  6e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.27677 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2294  ABC-2 type transporter  31.86 
 
 		 277 aa  105  8e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.911135  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4512  ABC-2 type transporter  30.23 
 
 		 281 aa  104  1e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1122  ABC-2 type transporter  30.33 
 
 		 285 aa  105  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.408605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0746  ABC-2 type transporter  32.86 
 
 		 280 aa  104  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2897  ABC-2 type transporter  29.24 
 
 		 274 aa  104  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.643507  normal  0.323486 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1483  ABC-2 type transporter  32.29 
 
 		 269 aa  103  3e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00140227  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3986  ABC-2 type transporter  32.74 
 
 		 280 aa  103  4e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3101  ABC-2 type transporter  33.63 
 
 		 266 aa  103  4e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1743  ABC-2 type transporter  32.88 
 
 		 271 aa  102  5e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000246748 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3103  ABC transporter protein  28.96 
 
 		 280 aa  102  7e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00849207 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4656  ABC-2 type transporter  28.24 
 
 		 285 aa  100  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.890125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30730  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  28.57 
 
 		 277 aa  100  3e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.364162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1966  ABC-2 type transporter  31.03 
 
 		 318 aa  100  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.115517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1937  ABC-2 type transporter  31.94 
 
 		 284 aa  99.8  4e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.008119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4056  ABC-2 type transporter  33.33 
 
 		 267 aa  99.4  5e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4023  ABC-2 type transporter  33.33 
 
 		 267 aa  99.4  5e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.293949  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19160  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  34.21 
 
 		 319 aa  99.4  6e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.338631 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3916  ABC transporter, inner membrane subunit  32.8 
 
 		 267 aa  98.2  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1504  ABC-2 type transporter  27.46 
 
 		 272 aa  97.8  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.457097  normal  0.179064 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2043  ABC-2 type transporter  26.74 
 
 		 279 aa  96.7  3e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.167343  hitchhiker  0.00685853 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0618  ABC-2 type transporter  29.36 
 
 		 267 aa  97.1  3e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.099686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6250  ABC-2 type transporter  27.78 
 
 		 285 aa  97.1  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.243116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3253  ABC transporter related  30 
 
 		 265 aa  96.3  5e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00665342  normal  0.245763 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1351  ABC-2 type transporter  30.04 
 
 		 272 aa  96.3  5e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0414359  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1352  ABC-2 type transporter  30 
 
 		 254 aa  96.3  5e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.137638  normal  0.090478 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3166  ABC-2 type transporter  32.37 
 
 		 245 aa  95.9  6e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.591825 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39010  ABC-type multidrug transport system, permease component  31.36 
 
 		 271 aa  95.5  8e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.436846 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4259  ABC-2 type transporter  29.44 
 
 		 282 aa  95.5  8e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.573247  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4345  ABC-2 type transporter  29.44 
 
 		 282 aa  95.5  8e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0911686 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4795  ABC-2 type transporter  29.86 
 
 		 284 aa  95.5  8e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597944 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4638  ABC-2 type transporter  29.44 
 
 		 282 aa  95.5  8e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.619797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2021  hypothetical protein  27.31 
 
 		 289 aa  94.7  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.290119  normal  0.988573 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1236  ABC-2 type transporter  30.88 
 
 		 281 aa  93.6  3e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07250  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  33.19 
 
 		 265 aa  93.2  4e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.307058 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>