252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1504 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_1504  ABC-2 type transporter  100 
 
 
272 aa  547  1e-155  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.457097  normal  0.179064 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1697  ABC-2 type transporter  46.32 
 
 
271 aa  276  2e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0042  ABC-2 type transporter  46.36 
 
 
266 aa  259  3e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1351  ABC-2 type transporter  47.81 
 
 
272 aa  254  1.0000000000000001e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0414359  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1622  ABC-2 type transporter  46.18 
 
 
278 aa  249  3e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1122  ABC-2 type transporter  43.37 
 
 
285 aa  248  6e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.408605  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3103  ABC transporter protein  45.38 
 
 
280 aa  240  2e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00849207 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0393  ABC-2 type transporter  43.36 
 
 
274 aa  235  5.0000000000000005e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2021  hypothetical protein  43.7 
 
 
289 aa  233  2.0000000000000002e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.290119  normal  0.988573 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22030  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  45.76 
 
 
281 aa  231  6e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6250  ABC-2 type transporter  41.5 
 
 
285 aa  228  1e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.243116  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4656  ABC-2 type transporter  42.23 
 
 
285 aa  227  2e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.890125  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3893  ABC-2 type transporter  41.74 
 
 
242 aa  213  2.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0012751  normal  0.0102027 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0451  ABC-type multidrug transport system, permease component  37.01 
 
 
269 aa  188  1e-46  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0034336  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30730  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  35.77 
 
 
277 aa  176  3e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.364162  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3253  ABC transporter related  33.21 
 
 
265 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00665342  normal  0.245763 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3328  ABC-2 type transporter  35.56 
 
 
281 aa  171  1e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.45338  normal  0.334159 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0746  ABC-2 type transporter  34.8 
 
 
280 aa  171  2e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1384  ABC-2 type transporter  39.45 
 
 
269 aa  169  4e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.78336  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1683  ABC-2 type transporter  33.72 
 
 
274 aa  168  7e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000181652  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5259  ABC-2 type transporter  35.46 
 
 
277 aa  168  8e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2897  ABC-2 type transporter  40.31 
 
 
274 aa  168  9e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.643507  normal  0.323486 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4023  ABC-2 type transporter  35.8 
 
 
267 aa  168  1e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.293949  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4056  ABC-2 type transporter  35.8 
 
 
267 aa  168  1e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3916  ABC transporter, inner membrane subunit  35.8 
 
 
267 aa  167  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23570  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  34.54 
 
 
267 aa  164  2.0000000000000002e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.24456  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35420  ABC-type multidrug transport system, permease component  35.34 
 
 
257 aa  162  5.0000000000000005e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2294  ABC-2 type transporter  36.21 
 
 
277 aa  162  6e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.911135  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0918  ABC-2 type transporter  35.6 
 
 
254 aa  162  8.000000000000001e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6787  ABC-2 type transporter  35.66 
 
 
268 aa  160  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000212784  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4936  ABC-2 type transporter  33.33 
 
 
280 aa  159  3e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.707728  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2100  ABC-2 type transporter  36.8 
 
 
267 aa  156  4e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4551  ABC-2 type transporter  36.55 
 
 
264 aa  154  2e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.442888  normal  0.0220595 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2775  ABC-2 type transporter  33.08 
 
 
278 aa  154  2e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00783625  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0666  ABC-2 type transporter  35.19 
 
 
285 aa  152  4e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2716  ABC-2 type transporter  36 
 
 
254 aa  151  1e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1236  ABC-2 type transporter  34.29 
 
 
281 aa  149  6e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4992  ABC-2 type transporter  33.58 
 
 
270 aa  148  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.402209  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1966  ABC-2 type transporter  32.41 
 
 
318 aa  146  3e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.115517  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1473  hypothetical protein  32.48 
 
 
269 aa  145  6e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.377134  normal  0.24112 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0340  ABC-2 type transporter  35.96 
 
 
273 aa  141  9e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.171685  hitchhiker  0.00234396 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1352  ABC-2 type transporter  34.14 
 
 
254 aa  141  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.137638  normal  0.090478 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0937  ABC-2 type transporter  32.45 
 
 
269 aa  139  4.999999999999999e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2043  ABC-2 type transporter  30.86 
 
 
279 aa  139  6e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.167343  hitchhiker  0.00685853 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1839  ABC-2 type transporter  31.58 
 
 
266 aa  136  4e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2939  ABC-2 type transporter  30.52 
 
 
286 aa  136  5e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.27677 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3922  ABC-2 type transporter  30.23 
 
 
266 aa  131  1.0000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0348636  normal  0.0335688 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0538  ABC-2 type transporter  32.16 
 
 
267 aa  129  5.0000000000000004e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.690834  hitchhiker  0.000010786 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39010  ABC-type multidrug transport system, permease component  29.26 
 
 
271 aa  126  4.0000000000000003e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.436846 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0542  ABC-2 type transporter  34.12 
 
 
253 aa  123  3e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7215  ABC transporter (permease)  32.11 
 
 
247 aa  123  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.284415 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8158  ABC-2 type transporter  30.19 
 
 
272 aa  119  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.880228 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1937  ABC-2 type transporter  26.25 
 
 
284 aa  116  5e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.008119  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4383  ABC-2 type transporter  30.12 
 
 
253 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.557459 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2016  ABC-2 type transporter  30.24 
 
 
268 aa  114  2.0000000000000002e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1476  ABC-2 type transporter  29.18 
 
 
267 aa  113  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0039  ABC-2 type transporter  31.13 
 
 
267 aa  113  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.953662 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0618  ABC-2 type transporter  29.39 
 
 
267 aa  112  7.000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.099686  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3101  ABC-2 type transporter  29.07 
 
 
266 aa  111  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19160  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  29.46 
 
 
319 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.338631 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0674  ABC-2 type transporter  30.99 
 
 
272 aa  110  3e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.890968  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0375  ABC-2 type transporter  28.57 
 
 
264 aa  110  3e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.133292  hitchhiker  0.00534901 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4092  ABC-2 type transporter  27.59 
 
 
290 aa  110  3e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0130357  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3132  ABC-2 type transporter  30.57 
 
 
248 aa  110  4.0000000000000004e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.571081  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1034  ABC-2 type transporter  30.83 
 
 
254 aa  109  5e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.489208  normal  0.0976555 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4795  ABC-2 type transporter  26.07 
 
 
284 aa  108  6e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.597944 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4259  ABC-2 type transporter  26.55 
 
 
282 aa  108  9.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.573247  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4345  ABC-2 type transporter  26.55 
 
 
282 aa  108  9.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0911686 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4638  ABC-2 type transporter  26.55 
 
 
282 aa  108  9.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.619797  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3239  ABC transporter efflux permease  29.32 
 
 
249 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3492  ABC transporter permease  29.32 
 
 
249 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.799548  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0058  ABC-2 type transporter  28.15 
 
 
271 aa  107  2e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1878  ABC-2 type transporter  31.18 
 
 
273 aa  107  2e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3453  ABC transporter, efflux permease protein  29.32 
 
 
249 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4874  ABC-2 type transporter  30.28 
 
 
253 aa  107  3e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0328295 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3467  ABC transporter, efflux permease protein  28.51 
 
 
249 aa  105  6e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000810233  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3149  ABC transporter efflux permease; daunorubicin resistance transmembrane protein  28.92 
 
 
249 aa  105  8e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0286068  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0895  ABC-2 type transporter  30.16 
 
 
266 aa  105  8e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1808  ABC transporter, efflux permease protein  30.28 
 
 
249 aa  105  9e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07250  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  29.5 
 
 
265 aa  105  1e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.307058 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1743  ABC-2 type transporter  29.25 
 
 
271 aa  103  2e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000246748 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3212  ABC transporter efflux permease; daunorubicin resistance transmembrane protein  29.32 
 
 
249 aa  103  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8859  ABC transporter permease  28.46 
 
 
253 aa  103  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3147  ABC-2 type transporter  30.28 
 
 
249 aa  103  4e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.145802  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1483  ABC-2 type transporter  28.51 
 
 
269 aa  103  4e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00140227  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3438  ABC transporter, efflux permease protein  30.28 
 
 
249 aa  102  5e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3718  ABC-2 type transporter  26.64 
 
 
260 aa  102  6e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.282288  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24940  ABC-type multidrug transport system, permease component  32.72 
 
 
284 aa  102  6e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.484855 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3446  ABC transporter, efflux permease protein  28.51 
 
 
249 aa  101  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00692281  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3016  ABC-2 type transporter  29.25 
 
 
254 aa  101  1e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.021308 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5654  ABC-2 type transporter  30.43 
 
 
267 aa  101  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4512  ABC-2 type transporter  25 
 
 
281 aa  99.8  4e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4081  ABC-2 type transporter  27.46 
 
 
274 aa  97.8  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.431533 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5718  ABC-2 type transporter  27.34 
 
 
263 aa  97.1  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4674  ABC-2 type transporter  27.8 
 
 
276 aa  97.1  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.348942  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1684  ABC-2 type transporter  28 
 
 
251 aa  95.9  6e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2065  ABC-2 type transporter  26.34 
 
 
254 aa  90.5  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18340  ABC-type multidrug transport system, permease component  26.36 
 
 
282 aa  90.5  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.823039 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00340  ABC-type multidrug transport system, permease component  28.71 
 
 
259 aa  90.5  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.15345 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1123  ABC-2 type transporter  28.98 
 
 
275 aa  90.5  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>