More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_35420 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_35420  ABC-type multidrug transport system, permease component  100 
 
 		 257 aa  506  9.999999999999999e-143  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1384  ABC-2 type transporter  49.6 
 
 		 269 aa  257  1e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.78336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5259  ABC-2 type transporter  48.37 
 
 		 277 aa  245  4.9999999999999997e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23570  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  43.58 
 
 		 267 aa  232  5e-60  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.24456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4551  ABC-2 type transporter  44.49 
 
 		 264 aa  218  1e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.442888  normal  0.0220595 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6787  ABC-2 type transporter  43.07 
 
 		 268 aa  215  5e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000212784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1622  ABC-2 type transporter  43.8 
 
 		 278 aa  204  1e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2897  ABC-2 type transporter  42.52 
 
 		 274 aa  202  3e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.643507  normal  0.323486 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0393  ABC-2 type transporter  42.29 
 
 		 274 aa  202  5e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30730  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  42.91 
 
 		 277 aa  198  6e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.364162  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0042  ABC-2 type transporter  40.8 
 
 		 266 aa  198  6e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2716  ABC-2 type transporter  42.57 
 
 		 254 aa  197  1.0000000000000001e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1351  ABC-2 type transporter  42.11 
 
 		 272 aa  197  2.0000000000000003e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0414359  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1122  ABC-2 type transporter  38.34 
 
 		 285 aa  195  7e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.408605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2021  hypothetical protein  37.15 
 
 		 289 aa  194  1e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.290119  normal  0.988573 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4656  ABC-2 type transporter  39.36 
 
 		 285 aa  193  3e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.890125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6250  ABC-2 type transporter  40.5 
 
 		 285 aa  190  2e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.243116  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3103  ABC transporter protein  40.16 
 
 		 280 aa  189  5e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00849207 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1697  ABC-2 type transporter  39.2 
 
 		 271 aa  189  5e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0746  ABC-2 type transporter  40.96 
 
 		 280 aa  186  3e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1236  ABC-2 type transporter  41.18 
 
 		 281 aa  184  1.0000000000000001e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3893  ABC-2 type transporter  39.5 
 
 		 242 aa  182  4.0000000000000006e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0012751  normal  0.0102027 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1352  ABC-2 type transporter  40.56 
 
 		 254 aa  181  8.000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.137638  normal  0.090478 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3916  ABC transporter, inner membrane subunit  40.24 
 
 		 267 aa  181  9.000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4936  ABC-2 type transporter  38.96 
 
 		 280 aa  181  9.000000000000001e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.707728  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4056  ABC-2 type transporter  39.84 
 
 		 267 aa  180  2e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4023  ABC-2 type transporter  39.84 
 
 		 267 aa  180  2e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.293949  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2294  ABC-2 type transporter  41.98 
 
 		 277 aa  178  9e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.911135  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1683  ABC-2 type transporter  42.25 
 
 		 274 aa  177  1e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000181652  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1966  ABC-2 type transporter  39.52 
 
 		 318 aa  175  6e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.115517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3253  ABC transporter related  38.46 
 
 		 265 aa  175  8e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00665342  normal  0.245763 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3328  ABC-2 type transporter  40.4 
 
 		 281 aa  173  2.9999999999999996e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.45338  normal  0.334159 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22030  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  42.13 
 
 		 281 aa  172  3.9999999999999995e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1504  ABC-2 type transporter  35.34 
 
 		 272 aa  171  1e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.457097  normal  0.179064 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2775  ABC-2 type transporter  39.08 
 
 		 278 aa  171  1e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00783625  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2100  ABC-2 type transporter  36.11 
 
 		 267 aa  166  2.9999999999999998e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2939  ABC-2 type transporter  37.84 
 
 		 286 aa  166  2.9999999999999998e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.27677 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4992  ABC-2 type transporter  39.58 
 
 		 270 aa  161  1e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.402209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0918  ABC-2 type transporter  34.27 
 
 		 254 aa  159  3e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1473  hypothetical protein  38 
 
 		 269 aa  157  2e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.377134  normal  0.24112 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0340  ABC-2 type transporter  36.92 
 
 		 273 aa  154  1e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.171685  hitchhiker  0.00234396 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0542  ABC-2 type transporter  34.31 
 
 		 253 aa  152  5e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1937  ABC-2 type transporter  35.09 
 
 		 284 aa  152  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.008119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4092  ABC-2 type transporter  35.66 
 
 		 290 aa  149  5e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0130357  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0674  ABC-2 type transporter  37.65 
 
 		 272 aa  149  6e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.890968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2016  ABC-2 type transporter  34.92 
 
 		 268 aa  147  2.0000000000000003e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0959  ABC-2 type transporter  33.87 
 
 		 256 aa  147  2.0000000000000003e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00197586  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4795  ABC-2 type transporter  36.23 
 
 		 284 aa  145  6e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597944 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2043  ABC-2 type transporter  35.71 
 
 		 279 aa  145  6e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.167343  hitchhiker  0.00685853 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1034  ABC-2 type transporter  32.92 
 
 		 254 aa  144  1e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.489208  normal  0.0976555 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0451  ABC-type multidrug transport system, permease component  31.28 
 
 		 269 aa  143  3e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0034336  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4512  ABC-2 type transporter  34.46 
 
 		 281 aa  142  4e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1839  ABC-2 type transporter  35 
 
 		 266 aa  141  9.999999999999999e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3016  ABC-2 type transporter  34.57 
 
 		 254 aa  140  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.021308 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1808  ABC transporter, efflux permease protein  34.15 
 
 		 249 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4383  ABC-2 type transporter  34.73 
 
 		 253 aa  138  7e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.557459 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0937  ABC-2 type transporter  31.8 
 
 		 269 aa  138  7.999999999999999e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3149  ABC transporter efflux permease; daunorubicin resistance transmembrane protein  33.74 
 
 		 249 aa  137  1e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0286068  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3467  ABC transporter, efflux permease protein  33.74 
 
 		 249 aa  137  1e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000810233  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3922  ABC-2 type transporter  34.5 
 
 		 266 aa  137  1e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0348636  normal  0.0335688 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8859  ABC transporter permease  35.95 
 
 		 253 aa  137  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4259  ABC-2 type transporter  34.24 
 
 		 282 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.573247  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4345  ABC-2 type transporter  34.24 
 
 		 282 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0911686 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4638  ABC-2 type transporter  34.24 
 
 		 282 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.619797  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1684  ABC-2 type transporter  31.47 
 
 		 251 aa  135  6.0000000000000005e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7215  ABC transporter (permease)  34.98 
 
 		 247 aa  135  7.000000000000001e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.284415 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3239  ABC transporter efflux permease  33.33 
 
 		 249 aa  135  8e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3492  ABC transporter permease  33.33 
 
 		 249 aa  135  8e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.799548  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3453  ABC transporter, efflux permease protein  33.33 
 
 		 249 aa  135  8e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4081  ABC-2 type transporter  34.45 
 
 		 274 aa  134  9.999999999999999e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.431533 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1476  ABC-2 type transporter  32.56 
 
 		 267 aa  134  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3147  ABC-2 type transporter  33.47 
 
 		 249 aa  133  3e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.145802  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3438  ABC transporter, efflux permease protein  33.74 
 
 		 249 aa  133  3e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3446  ABC transporter, efflux permease protein  32.93 
 
 		 249 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00692281  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3132  ABC-2 type transporter  33.33 
 
 		 248 aa  130  1.0000000000000001e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.571081  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4190  ABC-2 type transporter  38 
 
 		 257 aa  130  2.0000000000000002e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3212  ABC transporter efflux permease; daunorubicin resistance transmembrane protein  32.93 
 
 		 249 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4183  ABC-2 type transporter  33.58 
 
 		 269 aa  128  7.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.013923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0666  ABC-2 type transporter  33.08 
 
 		 285 aa  128  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8158  ABC-2 type transporter  32.72 
 
 		 272 aa  128  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.880228 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0618  ABC-2 type transporter  30.31 
 
 		 267 aa  125  5e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.099686  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07250  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  33.72 
 
 		 265 aa  125  7e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.307058 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0538  ABC-2 type transporter  33.46 
 
 		 267 aa  125  8.000000000000001e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.690834  hitchhiker  0.000010786 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0895  ABC-2 type transporter  39.74 
 
 		 266 aa  124  1e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4874  ABC-2 type transporter  34.31 
 
 		 253 aa  125  1e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0328295 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5588  ABC-2 type transporter  33.33 
 
 		 261 aa  122  6e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2065  ABC-2 type transporter  31.35 
 
 		 254 aa  122  6e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24940  ABC-type multidrug transport system, permease component  30.82 
 
 		 284 aa  121  9.999999999999999e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.484855 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6375  ABC-2 type transporter  28.57 
 
 		 247 aa  119  6e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3986  ABC-2 type transporter  30.23 
 
 		 280 aa  118  7.999999999999999e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0039  ABC-2 type transporter  31.13 
 
 		 267 aa  118  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.953662 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1258  ABC-2 type transporter  32.05 
 
 		 300 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1483  ABC-2 type transporter  32.03 
 
 		 269 aa  116  3e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00140227  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0058  ABC-2 type transporter  31.45 
 
 		 271 aa  115  5e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39010  ABC-type multidrug transport system, permease component  32.08 
 
 		 271 aa  115  6e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.436846 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0375  ABC-2 type transporter  31.71 
 
 		 264 aa  113  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.133292  hitchhiker  0.00534901 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1878  ABC-2 type transporter  33.2 
 
 		 273 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0213  ABC transporter permease  31.82 
 
 		 257 aa  112  5e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5654  ABC-2 type transporter  33.96 
 
 		 267 aa  109  4.0000000000000004e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1754  ABC-2 type transporter  32.92 
 
 		 250 aa  108  6e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00326384 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>