More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1622 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1622  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 278 aa  563  1e-160  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1351  ABC-2 type transporter  67.46 
 
 		 272 aa  358  8e-98  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0414359  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0042  ABC-2 type transporter  65.23 
 
 		 266 aa  350  1e-95  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1697  ABC-2 type transporter  60.08 
 
 		 271 aa  333  2e-90  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1122  ABC-2 type transporter  59.13 
 
 		 285 aa  327  2.0000000000000001e-88  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.408605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22030  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  69.57 
 
 		 281 aa  321  9.999999999999999e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0393  ABC-2 type transporter  57.65 
 
 		 274 aa  311  4.999999999999999e-84  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3103  ABC transporter protein  52.69 
 
 		 280 aa  305  6e-82  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00849207 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4656  ABC-2 type transporter  56 
 
 		 285 aa  295  4e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.890125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2021  hypothetical protein  54 
 
 		 289 aa  295  8e-79  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.290119  normal  0.988573 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6250  ABC-2 type transporter  54 
 
 		 285 aa  290  2e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.243116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3893  ABC-2 type transporter  54.77 
 
 		 242 aa  275  4e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0012751  normal  0.0102027 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30730  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  52.46 
 
 		 277 aa  266  4e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.364162  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0746  ABC-2 type transporter  46.49 
 
 		 280 aa  251  1e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1504  ABC-2 type transporter  46.18 
 
 		 272 aa  249  3e-65  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.457097  normal  0.179064 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3328  ABC-2 type transporter  47.92 
 
 		 281 aa  239  4e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.45338  normal  0.334159 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1236  ABC-2 type transporter  44.93 
 
 		 281 aa  237  1e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4936  ABC-2 type transporter  47.13 
 
 		 280 aa  232  5e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.707728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1966  ABC-2 type transporter  43.4 
 
 		 318 aa  230  2e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.115517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1384  ABC-2 type transporter  45.78 
 
 		 269 aa  229  3e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.78336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4056  ABC-2 type transporter  43.54 
 
 		 267 aa  228  7e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4023  ABC-2 type transporter  43.54 
 
 		 267 aa  228  7e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.293949  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3916  ABC transporter, inner membrane subunit  43.54 
 
 		 267 aa  228  1e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5259  ABC-2 type transporter  47.15 
 
 		 277 aa  228  1e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0451  ABC-type multidrug transport system, permease component  44.53 
 
 		 269 aa  227  2e-58  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0034336  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2294  ABC-2 type transporter  45.68 
 
 		 277 aa  223  4e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.911135  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3253  ABC transporter related  43.27 
 
 		 265 aa  218  7e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00665342  normal  0.245763 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2897  ABC-2 type transporter  44.48 
 
 		 274 aa  214  9.999999999999999e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.643507  normal  0.323486 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6787  ABC-2 type transporter  44.26 
 
 		 268 aa  211  9e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000212784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2939  ABC-2 type transporter  46.18 
 
 		 286 aa  209  6e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.27677 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2775  ABC-2 type transporter  38.73 
 
 		 278 aa  205  8e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00783625  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2100  ABC-2 type transporter  41.18 
 
 		 267 aa  205  8e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1352  ABC-2 type transporter  42.97 
 
 		 254 aa  203  3e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.137638  normal  0.090478 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2716  ABC-2 type transporter  41 
 
 		 254 aa  202  7e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35420  ABC-type multidrug transport system, permease component  43.8 
 
 		 257 aa  196  3e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0918  ABC-2 type transporter  40.65 
 
 		 254 aa  187  2e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1683  ABC-2 type transporter  40.23 
 
 		 274 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000181652  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23570  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  37.45 
 
 		 267 aa  184  2.0000000000000003e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.24456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4551  ABC-2 type transporter  40.32 
 
 		 264 aa  176  4e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.442888  normal  0.0220595 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4992  ABC-2 type transporter  39.84 
 
 		 270 aa  172  5e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.402209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0937  ABC-2 type transporter  35.74 
 
 		 269 aa  169  7e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2043  ABC-2 type transporter  32.97 
 
 		 279 aa  168  9e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.167343  hitchhiker  0.00685853 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1473  hypothetical protein  39.84 
 
 		 269 aa  167  2e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.377134  normal  0.24112 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0538  ABC-2 type transporter  39.92 
 
 		 267 aa  165  8e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.690834  hitchhiker  0.000010786 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1937  ABC-2 type transporter  38.37 
 
 		 284 aa  165  8e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.008119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4259  ABC-2 type transporter  34.86 
 
 		 282 aa  165  9e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.573247  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4345  ABC-2 type transporter  34.86 
 
 		 282 aa  165  9e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0911686 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4638  ABC-2 type transporter  34.86 
 
 		 282 aa  165  9e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.619797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4512  ABC-2 type transporter  36.33 
 
 		 281 aa  162  6e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1839  ABC-2 type transporter  38.34 
 
 		 266 aa  159  4e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3922  ABC-2 type transporter  38 
 
 		 266 aa  157  2e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0348636  normal  0.0335688 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1878  ABC-2 type transporter  39.6 
 
 		 273 aa  157  2e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4795  ABC-2 type transporter  36.12 
 
 		 284 aa  155  7e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597944 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0666  ABC-2 type transporter  37.12 
 
 		 285 aa  154  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07250  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  35.27 
 
 		 265 aa  154  2e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.307058 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39010  ABC-type multidrug transport system, permease component  34.98 
 
 		 271 aa  152  4e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.436846 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0340  ABC-2 type transporter  36.51 
 
 		 273 aa  152  8e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.171685  hitchhiker  0.00234396 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1476  ABC-2 type transporter  36.02 
 
 		 267 aa  150  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0039  ABC-2 type transporter  36.43 
 
 		 267 aa  148  7e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.953662 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1483  ABC-2 type transporter  38.54 
 
 		 269 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00140227  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4092  ABC-2 type transporter  34.47 
 
 		 290 aa  145  7.0000000000000006e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0130357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4183  ABC-2 type transporter  35.63 
 
 		 269 aa  138  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.013923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8158  ABC-2 type transporter  33.2 
 
 		 272 aa  137  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.880228 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0618  ABC-2 type transporter  33.21 
 
 		 267 aa  133  3.9999999999999996e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.099686  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3986  ABC-2 type transporter  30.45 
 
 		 280 aa  129  4.0000000000000003e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3101  ABC-2 type transporter  32.31 
 
 		 266 aa  129  7.000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19160  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  33.33 
 
 		 319 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.338631 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3718  ABC-2 type transporter  30.31 
 
 		 260 aa  126  3e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.282288  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24940  ABC-type multidrug transport system, permease component  33.45 
 
 		 284 aa  126  4.0000000000000003e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.484855 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0895  ABC-2 type transporter  32.97 
 
 		 266 aa  123  4e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7215  ABC transporter (permease)  34.76 
 
 		 247 aa  122  6e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.284415 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1743  ABC-2 type transporter  34.27 
 
 		 271 aa  119  7.999999999999999e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000246748 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4383  ABC-2 type transporter  33.2 
 
 		 253 aa  118  9.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.557459 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0542  ABC-2 type transporter  31.73 
 
 		 253 aa  117  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0375  ABC-2 type transporter  31.98 
 
 		 264 aa  116  5e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.133292  hitchhiker  0.00534901 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4081  ABC-2 type transporter  31.58 
 
 		 274 aa  115  7.999999999999999e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.431533 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0058  ABC-2 type transporter  30.29 
 
 		 271 aa  114  1.0000000000000001e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8859  ABC transporter permease  32.9 
 
 		 253 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0674  ABC-2 type transporter  30.47 
 
 		 272 aa  110  2.0000000000000002e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.890968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2016  ABC-2 type transporter  30.12 
 
 		 268 aa  110  3e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1123  ABC-2 type transporter  32.57 
 
 		 275 aa  109  4.0000000000000004e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1034  ABC-2 type transporter  31.84 
 
 		 254 aa  108  1e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.489208  normal  0.0976555 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4674  ABC-2 type transporter  32.71 
 
 		 276 aa  108  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.348942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5654  ABC-2 type transporter  33.2 
 
 		 267 aa  107  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3132  ABC-2 type transporter  30.8 
 
 		 248 aa  107  2e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.571081  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3467  ABC transporter, efflux permease protein  31.8 
 
 		 249 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000810233  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1808  ABC transporter, efflux permease protein  33.47 
 
 		 249 aa  107  3e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5718  ABC-2 type transporter  30.92 
 
 		 263 aa  106  4e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8873  ABC-2 type transporter  28.81 
 
 		 270 aa  106  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.53633  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3149  ABC transporter efflux permease; daunorubicin resistance transmembrane protein  31.36 
 
 		 249 aa  106  4e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0286068  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4874  ABC-2 type transporter  32.27 
 
 		 253 aa  105  6e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0328295 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3239  ABC transporter efflux permease  31.36 
 
 		 249 aa  105  9e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3492  ABC transporter permease  31.36 
 
 		 249 aa  105  9e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.799548  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3453  ABC transporter, efflux permease protein  31.36 
 
 		 249 aa  105  9e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3446  ABC transporter, efflux permease protein  31.36 
 
 		 249 aa  104  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00692281  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5081  ABC transporter related protein  31.33 
 
 		 260 aa  104  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.630665  normal  0.675914 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3147  ABC-2 type transporter  30.93 
 
 		 249 aa  103  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.145802  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4106  ABC-2 type transporter  31.58 
 
 		 293 aa  104  2e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3438  ABC transporter, efflux permease protein  31.51 
 
 		 249 aa  104  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0959  ABC-2 type transporter  30.14 
 
 		 256 aa  102  5e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00197586  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>