281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3253 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009429  Rsph17025_3253  ABC transporter related  100 
 
 		 265 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00665342  normal  0.245763 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2100  ABC-2 type transporter  76.03 
 
 		 267 aa  390  1e-108  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30730  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  57.09 
 
 		 277 aa  295  7e-79  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.364162  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0746  ABC-2 type transporter  52.51 
 
 		 280 aa  281  8.000000000000001e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1236  ABC-2 type transporter  55.91 
 
 		 281 aa  280  1e-74  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2294  ABC-2 type transporter  53.26 
 
 		 277 aa  278  8e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.911135  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3328  ABC-2 type transporter  50 
 
 		 281 aa  273  2.0000000000000002e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.45338  normal  0.334159 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4023  ABC-2 type transporter  51.97 
 
 		 267 aa  271  6e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.293949  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4056  ABC-2 type transporter  51.97 
 
 		 267 aa  271  6e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3916  ABC transporter, inner membrane subunit  51.97 
 
 		 267 aa  270  2e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1966  ABC-2 type transporter  51.89 
 
 		 318 aa  263  2e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.115517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4936  ABC-2 type transporter  49.03 
 
 		 280 aa  250  2e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.707728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2939  ABC-2 type transporter  46.59 
 
 		 286 aa  248  6e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.27677 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2775  ABC-2 type transporter  40.77 
 
 		 278 aa  224  1e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00783625  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1351  ABC-2 type transporter  44.98 
 
 		 272 aa  221  7e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0414359  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1622  ABC-2 type transporter  43.27 
 
 		 278 aa  218  6e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0042  ABC-2 type transporter  41.89 
 
 		 266 aa  216  2.9999999999999998e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1122  ABC-2 type transporter  43.72 
 
 		 285 aa  215  7e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.408605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1697  ABC-2 type transporter  42.35 
 
 		 271 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2897  ABC-2 type transporter  43.4 
 
 		 274 aa  212  3.9999999999999995e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.643507  normal  0.323486 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22030  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  49.77 
 
 		 281 aa  203  2e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3103  ABC transporter protein  42.64 
 
 		 280 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00849207 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0393  ABC-2 type transporter  43.55 
 
 		 274 aa  199  3e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2043  ABC-2 type transporter  39.61 
 
 		 279 aa  195  6e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.167343  hitchhiker  0.00685853 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6787  ABC-2 type transporter  41.02 
 
 		 268 aa  189  4e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000212784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5259  ABC-2 type transporter  42.02 
 
 		 277 aa  187  1e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2716  ABC-2 type transporter  42.17 
 
 		 254 aa  187  2e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4656  ABC-2 type transporter  40 
 
 		 285 aa  186  3e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.890125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6250  ABC-2 type transporter  39.84 
 
 		 285 aa  184  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.243116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1384  ABC-2 type transporter  39.37 
 
 		 269 aa  183  3e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.78336  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2021  hypothetical protein  40.08 
 
 		 289 aa  182  4.0000000000000006e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.290119  normal  0.988573 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1352  ABC-2 type transporter  42.11 
 
 		 254 aa  181  8.000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.137638  normal  0.090478 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3893  ABC-2 type transporter  41.22 
 
 		 242 aa  177  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0012751  normal  0.0102027 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35420  ABC-type multidrug transport system, permease component  38.46 
 
 		 257 aa  172  2.9999999999999996e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1504  ABC-2 type transporter  33.21 
 
 		 272 aa  172  5e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.457097  normal  0.179064 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0918  ABC-2 type transporter  36.59 
 
 		 254 aa  171  2e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0451  ABC-type multidrug transport system, permease component  36.95 
 
 		 269 aa  166  5e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0034336  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4551  ABC-2 type transporter  38.62 
 
 		 264 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.442888  normal  0.0220595 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0937  ABC-2 type transporter  37.31 
 
 		 269 aa  163  3e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4992  ABC-2 type transporter  36.72 
 
 		 270 aa  159  3e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.402209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1683  ABC-2 type transporter  36.25 
 
 		 274 aa  159  5e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000181652  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1937  ABC-2 type transporter  36.36 
 
 		 284 aa  157  1e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.008119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23570  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  33.59 
 
 		 267 aa  157  2e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.24456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1473  hypothetical protein  35.27 
 
 		 269 aa  153  2.9999999999999998e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.377134  normal  0.24112 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1483  ABC-2 type transporter  37.67 
 
 		 269 aa  153  2.9999999999999998e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00140227  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0666  ABC-2 type transporter  41.01 
 
 		 285 aa  149  5e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4795  ABC-2 type transporter  37.74 
 
 		 284 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597944 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0538  ABC-2 type transporter  34.77 
 
 		 267 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.690834  hitchhiker  0.000010786 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1839  ABC-2 type transporter  35.25 
 
 		 266 aa  146  4.0000000000000006e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4259  ABC-2 type transporter  36.13 
 
 		 282 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.573247  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4345  ABC-2 type transporter  36.13 
 
 		 282 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0911686 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4638  ABC-2 type transporter  36.13 
 
 		 282 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.619797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4092  ABC-2 type transporter  35.04 
 
 		 290 aa  139  3e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0130357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1476  ABC-2 type transporter  36.11 
 
 		 267 aa  138  7.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39010  ABC-type multidrug transport system, permease component  32.69 
 
 		 271 aa  137  2e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.436846 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0618  ABC-2 type transporter  34.25 
 
 		 267 aa  137  2e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.099686  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4512  ABC-2 type transporter  36.89 
 
 		 281 aa  136  3.0000000000000003e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0895  ABC-2 type transporter  34.39 
 
 		 266 aa  136  5e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19160  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  36.4 
 
 		 319 aa  135  8e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.338631 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3922  ABC-2 type transporter  35.71 
 
 		 266 aa  133  3e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0348636  normal  0.0335688 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3718  ABC-2 type transporter  33.07 
 
 		 260 aa  132  5e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.282288  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0340  ABC-2 type transporter  32.06 
 
 		 273 aa  129  3e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.171685  hitchhiker  0.00234396 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3101  ABC-2 type transporter  35.29 
 
 		 266 aa  129  5.0000000000000004e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07250  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  32.93 
 
 		 265 aa  127  2.0000000000000002e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.307058 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0039  ABC-2 type transporter  33.33 
 
 		 267 aa  126  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.953662 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3986  ABC-2 type transporter  33.94 
 
 		 280 aa  125  8.000000000000001e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1878  ABC-2 type transporter  34.29 
 
 		 273 aa  124  1e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7215  ABC transporter (permease)  34.11 
 
 		 247 aa  120  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.284415 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1743  ABC-2 type transporter  37.21 
 
 		 271 aa  117  3e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000246748 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1258  ABC-2 type transporter  31.6 
 
 		 300 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5718  ABC-2 type transporter  32.38 
 
 		 263 aa  113  3e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3132  ABC-2 type transporter  32.69 
 
 		 248 aa  109  4.0000000000000004e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.571081  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4183  ABC-2 type transporter  30.77 
 
 		 269 aa  109  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.013923  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0674  ABC-2 type transporter  30.74 
 
 		 272 aa  108  9.000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.890968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0375  ABC-2 type transporter  33.47 
 
 		 264 aa  107  3e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.133292  hitchhiker  0.00534901 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5081  ABC transporter related protein  30.2 
 
 		 260 aa  104  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.630665  normal  0.675914 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2016  ABC-2 type transporter  30 
 
 		 268 aa  104  1e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24940  ABC-type multidrug transport system, permease component  33.18 
 
 		 284 aa  104  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.484855 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4190  ABC-2 type transporter  32.69 
 
 		 257 aa  103  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0058  ABC-2 type transporter  29.11 
 
 		 271 aa  102  7e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8859  ABC transporter permease  31.22 
 
 		 253 aa  100  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8158  ABC-2 type transporter  30.27 
 
 		 272 aa  99  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.880228 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0959  ABC-2 type transporter  28.63 
 
 		 256 aa  96.7  4e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00197586  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5654  ABC-2 type transporter  33.82 
 
 		 267 aa  96.7  4e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1034  ABC-2 type transporter  27.42 
 
 		 254 aa  96.3  5e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.489208  normal  0.0976555 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4081  ABC-2 type transporter  30 
 
 		 274 aa  96.3  5e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.431533 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1525  ABC-2 type transporter  30.11 
 
 		 290 aa  95.9  6e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00118323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3467  ABC transporter, efflux permease protein  29.36 
 
 		 249 aa  95.5  8e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000810233  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4383  ABC-2 type transporter  27.43 
 
 		 253 aa  95.1  9e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.557459 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3149  ABC transporter efflux permease; daunorubicin resistance transmembrane protein  29.36 
 
 		 249 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0286068  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4674  ABC-2 type transporter  30.5 
 
 		 276 aa  94.4  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.348942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1123  ABC-2 type transporter  31.51 
 
 		 275 aa  93.6  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0542  ABC-2 type transporter  28.57 
 
 		 253 aa  92.8  5e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3239  ABC transporter efflux permease  29.36 
 
 		 249 aa  92.8  5e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3492  ABC transporter permease  29.36 
 
 		 249 aa  92.8  5e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.799548  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3453  ABC transporter, efflux permease protein  29.36 
 
 		 249 aa  92.8  5e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4874  ABC-2 type transporter  27.85 
 
 		 253 aa  91.7  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0328295 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1808  ABC transporter, efflux permease protein  27.88 
 
 		 249 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3438  ABC transporter, efflux permease protein  28.37 
 
 		 249 aa  89.7  4e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6375  ABC-2 type transporter  27.06 
 
 		 247 aa  89.4  6e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>