More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4992 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4992  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 270 aa  529  1e-149  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.402209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1473  hypothetical protein  76.58 
 
 		 269 aa  426  1e-118  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.377134  normal  0.24112 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0340  ABC-2 type transporter  51.14 
 
 		 273 aa  253  3e-66  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.171685  hitchhiker  0.00234396 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1839  ABC-2 type transporter  50.95 
 
 		 266 aa  247  2e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0918  ABC-2 type transporter  51.81 
 
 		 254 aa  245  6e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0666  ABC-2 type transporter  49.62 
 
 		 285 aa  242  5e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0937  ABC-2 type transporter  46.82 
 
 		 269 aa  226  4e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0538  ABC-2 type transporter  45.86 
 
 		 267 aa  220  1.9999999999999999e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.690834  hitchhiker  0.000010786 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1476  ABC-2 type transporter  48.44 
 
 		 267 aa  216  4e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1483  ABC-2 type transporter  49.54 
 
 		 269 aa  207  1e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00140227  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3922  ABC-2 type transporter  43.61 
 
 		 266 aa  206  4e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0348636  normal  0.0335688 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1384  ABC-2 type transporter  44.44 
 
 		 269 aa  201  8e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.78336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5259  ABC-2 type transporter  41.74 
 
 		 277 aa  199  3e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1878  ABC-2 type transporter  48.64 
 
 		 273 aa  194  1e-48  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4183  ABC-2 type transporter  44.27 
 
 		 269 aa  191  8e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.013923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39010  ABC-type multidrug transport system, permease component  43.89 
 
 		 271 aa  189  2.9999999999999997e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.436846 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07250  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  40.86 
 
 		 265 aa  183  2.0000000000000003e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.307058 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3718  ABC-2 type transporter  44.78 
 
 		 260 aa  183  3e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.282288  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2897  ABC-2 type transporter  47.5 
 
 		 274 aa  182  4.0000000000000006e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.643507  normal  0.323486 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0042  ABC-2 type transporter  36.76 
 
 		 266 aa  182  4.0000000000000006e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1937  ABC-2 type transporter  36.84 
 
 		 284 aa  182  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.008119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6787  ABC-2 type transporter  41.31 
 
 		 268 aa  181  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000212784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19160  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  41.25 
 
 		 319 aa  177  1e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.338631 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2716  ABC-2 type transporter  45.45 
 
 		 254 aa  177  1e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3101  ABC-2 type transporter  43.23 
 
 		 266 aa  177  2e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4023  ABC-2 type transporter  41.25 
 
 		 267 aa  175  8e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.293949  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4056  ABC-2 type transporter  41.25 
 
 		 267 aa  175  8e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3916  ABC transporter, inner membrane subunit  41.25 
 
 		 267 aa  174  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1622  ABC-2 type transporter  39.84 
 
 		 278 aa  172  3.9999999999999995e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1034  ABC-2 type transporter  38.43 
 
 		 254 aa  172  5.999999999999999e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.489208  normal  0.0976555 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0618  ABC-2 type transporter  38.64 
 
 		 267 aa  172  5.999999999999999e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.099686  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4259  ABC-2 type transporter  36.4 
 
 		 282 aa  172  6.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.573247  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4345  ABC-2 type transporter  36.4 
 
 		 282 aa  172  6.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0911686 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4638  ABC-2 type transporter  36.4 
 
 		 282 aa  172  6.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.619797  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3986  ABC-2 type transporter  44.81 
 
 		 280 aa  171  1e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4512  ABC-2 type transporter  37.21 
 
 		 281 aa  171  2e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4795  ABC-2 type transporter  35.52 
 
 		 284 aa  170  2e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597944 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3467  ABC transporter, efflux permease protein  38.68 
 
 		 249 aa  168  7e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000810233  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3149  ABC transporter efflux permease; daunorubicin resistance transmembrane protein  38.27 
 
 		 249 aa  168  8e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0286068  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1351  ABC-2 type transporter  37.16 
 
 		 272 aa  168  1e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0414359  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1808  ABC transporter, efflux permease protein  38.27 
 
 		 249 aa  167  1e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3239  ABC transporter efflux permease  38.27 
 
 		 249 aa  167  2e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3492  ABC transporter permease  38.27 
 
 		 249 aa  167  2e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.799548  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3453  ABC transporter, efflux permease protein  38.27 
 
 		 249 aa  167  2e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1743  ABC-2 type transporter  46.01 
 
 		 271 aa  167  2e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000246748 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1683  ABC-2 type transporter  42.21 
 
 		 274 aa  167  2e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000181652  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3328  ABC-2 type transporter  39.2 
 
 		 281 aa  166  2.9999999999999998e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.45338  normal  0.334159 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23570  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  35.82 
 
 		 267 aa  166  4e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.24456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1697  ABC-2 type transporter  36.68 
 
 		 271 aa  166  5e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3103  ABC transporter protein  39.51 
 
 		 280 aa  165  5.9999999999999996e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00849207 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1966  ABC-2 type transporter  38.66 
 
 		 318 aa  164  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.115517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0039  ABC-2 type transporter  42.47 
 
 		 267 aa  164  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.953662 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0674  ABC-2 type transporter  38.72 
 
 		 272 aa  163  2.0000000000000002e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.890968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30730  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  37.97 
 
 		 277 aa  162  4.0000000000000004e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.364162  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24940  ABC-type multidrug transport system, permease component  39.53 
 
 		 284 aa  161  1e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.484855 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4551  ABC-2 type transporter  38.95 
 
 		 264 aa  160  2e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.442888  normal  0.0220595 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3438  ABC transporter, efflux permease protein  38.68 
 
 		 249 aa  160  2e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8859  ABC transporter permease  38.15 
 
 		 253 aa  160  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2016  ABC-2 type transporter  39.77 
 
 		 268 aa  160  2e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0746  ABC-2 type transporter  37.5 
 
 		 280 aa  160  3e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3253  ABC transporter related  36.72 
 
 		 265 aa  159  3e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00665342  normal  0.245763 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3147  ABC-2 type transporter  38.27 
 
 		 249 aa  159  5e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.145802  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3212  ABC transporter efflux permease; daunorubicin resistance transmembrane protein  38.27 
 
 		 249 aa  158  7e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0542  ABC-2 type transporter  34.82 
 
 		 253 aa  159  7e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2294  ABC-2 type transporter  38.66 
 
 		 277 aa  158  1e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.911135  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0959  ABC-2 type transporter  35.02 
 
 		 256 aa  157  2e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00197586  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3446  ABC transporter, efflux permease protein  37.45 
 
 		 249 aa  156  4e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00692281  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2939  ABC-2 type transporter  37.45 
 
 		 286 aa  156  4e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.27677 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1122  ABC-2 type transporter  37.04 
 
 		 285 aa  155  5.0000000000000005e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.408605  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4081  ABC-2 type transporter  37.21 
 
 		 274 aa  155  6e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.431533 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4383  ABC-2 type transporter  38.27 
 
 		 253 aa  155  8e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.557459 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1352  ABC-2 type transporter  40.08 
 
 		 254 aa  155  9e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.137638  normal  0.090478 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7215  ABC transporter (permease)  38.21 
 
 		 247 aa  154  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.284415 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2100  ABC-2 type transporter  36.03 
 
 		 267 aa  154  2e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4874  ABC-2 type transporter  38 
 
 		 253 aa  153  2.9999999999999998e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0328295 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2775  ABC-2 type transporter  38.35 
 
 		 278 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00783625  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1258  ABC-2 type transporter  39.25 
 
 		 300 aa  153  2.9999999999999998e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4656  ABC-2 type transporter  36.07 
 
 		 285 aa  152  4e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.890125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1684  ABC-2 type transporter  34.84 
 
 		 251 aa  152  8e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0375  ABC-2 type transporter  35.48 
 
 		 264 aa  151  8.999999999999999e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.133292  hitchhiker  0.00534901 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4674  ABC-2 type transporter  38.46 
 
 		 276 aa  149  5e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.348942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4092  ABC-2 type transporter  36.84 
 
 		 290 aa  148  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0130357  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1504  ABC-2 type transporter  33.58 
 
 		 272 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.457097  normal  0.179064 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22030  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  40.38 
 
 		 281 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35420  ABC-type multidrug transport system, permease component  39.58 
 
 		 257 aa  147  2.0000000000000003e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0393  ABC-2 type transporter  34.18 
 
 		 274 aa  147  3e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8158  ABC-2 type transporter  35.36 
 
 		 272 aa  146  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.880228 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2021  hypothetical protein  38.46 
 
 		 289 aa  146  4.0000000000000006e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.290119  normal  0.988573 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5588  ABC-2 type transporter  35.02 
 
 		 261 aa  145  9e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1236  ABC-2 type transporter  35.16 
 
 		 281 aa  143  3e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0058  ABC-2 type transporter  34.77 
 
 		 271 aa  143  3e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0895  ABC-2 type transporter  37.12 
 
 		 266 aa  143  3e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6250  ABC-2 type transporter  35.63 
 
 		 285 aa  143  3e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.243116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4190  ABC-2 type transporter  39.06 
 
 		 257 aa  143  3e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3132  ABC-2 type transporter  36.96 
 
 		 248 aa  143  3e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.571081  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8873  ABC-2 type transporter  32.12 
 
 		 270 aa  142  5e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.53633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4936  ABC-2 type transporter  34.58 
 
 		 280 aa  142  7e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.707728  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3016  ABC-2 type transporter  36 
 
 		 254 aa  140  3e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.021308 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3893  ABC-2 type transporter  34.57 
 
 		 242 aa  139  6e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0012751  normal  0.0102027 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4761  ABC-2 type transporter  35.86 
 
 		 261 aa  138  7.999999999999999e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000109025  hitchhiker  0.000621886 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>