262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2100 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_2100  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 267 aa  521  1e-147  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3253  ABC transporter related  76.03 
 
 		 265 aa  413  1e-114  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00665342  normal  0.245763 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30730  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  54.33 
 
 		 277 aa  284  1.0000000000000001e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.364162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4023  ABC-2 type transporter  51.31 
 
 		 267 aa  279  4e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.293949  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4056  ABC-2 type transporter  51.31 
 
 		 267 aa  279  4e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3916  ABC transporter, inner membrane subunit  50.94 
 
 		 267 aa  275  6e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0746  ABC-2 type transporter  50.94 
 
 		 280 aa  273  2.0000000000000002e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3328  ABC-2 type transporter  49.24 
 
 		 281 aa  266  2e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.45338  normal  0.334159 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1236  ABC-2 type transporter  52.94 
 
 		 281 aa  263  2e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2294  ABC-2 type transporter  49.25 
 
 		 277 aa  256  3e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.911135  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1966  ABC-2 type transporter  48.08 
 
 		 318 aa  249  3e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.115517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4936  ABC-2 type transporter  48.68 
 
 		 280 aa  246  2e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.707728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2939  ABC-2 type transporter  47.24 
 
 		 286 aa  246  3e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.27677 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2775  ABC-2 type transporter  44.96 
 
 		 278 aa  230  2e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00783625  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1622  ABC-2 type transporter  41.18 
 
 		 278 aa  218  1e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1351  ABC-2 type transporter  44.18 
 
 		 272 aa  214  1.9999999999999998e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0414359  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0042  ABC-2 type transporter  38.11 
 
 		 266 aa  208  6e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1122  ABC-2 type transporter  40.56 
 
 		 285 aa  207  2e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.408605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1697  ABC-2 type transporter  38.43 
 
 		 271 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2043  ABC-2 type transporter  40.08 
 
 		 279 aa  199  3e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.167343  hitchhiker  0.00685853 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22030  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  47.73 
 
 		 281 aa  199  5e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2897  ABC-2 type transporter  40.15 
 
 		 274 aa  192  6e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.643507  normal  0.323486 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3103  ABC transporter protein  40.71 
 
 		 280 aa  190  2e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00849207 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6787  ABC-2 type transporter  41.11 
 
 		 268 aa  189  4e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000212784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4656  ABC-2 type transporter  40.82 
 
 		 285 aa  188  9e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.890125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1384  ABC-2 type transporter  38.74 
 
 		 269 aa  185  7e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.78336  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0393  ABC-2 type transporter  38.96 
 
 		 274 aa  185  8e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5259  ABC-2 type transporter  39.3 
 
 		 277 aa  182  5.0000000000000004e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2021  hypothetical protein  38.15 
 
 		 289 aa  181  1e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.290119  normal  0.988573 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6250  ABC-2 type transporter  36.95 
 
 		 285 aa  177  1e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.243116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3893  ABC-2 type transporter  40.42 
 
 		 242 aa  177  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0012751  normal  0.0102027 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2716  ABC-2 type transporter  38.55 
 
 		 254 aa  175  6e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35420  ABC-type multidrug transport system, permease component  36.11 
 
 		 257 aa  173  2.9999999999999996e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1504  ABC-2 type transporter  36.8 
 
 		 272 aa  171  7.999999999999999e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.457097  normal  0.179064 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1352  ABC-2 type transporter  37.25 
 
 		 254 aa  168  9e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.137638  normal  0.090478 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1473  hypothetical protein  37.17 
 
 		 269 aa  167  2e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.377134  normal  0.24112 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23570  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  34.36 
 
 		 267 aa  166  2.9999999999999998e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.24456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0918  ABC-2 type transporter  36.99 
 
 		 254 aa  166  5e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1683  ABC-2 type transporter  35.23 
 
 		 274 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000181652  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4992  ABC-2 type transporter  36.03 
 
 		 270 aa  164  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.402209  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0451  ABC-type multidrug transport system, permease component  35.27 
 
 		 269 aa  163  3e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0034336  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4551  ABC-2 type transporter  36.43 
 
 		 264 aa  160  2e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.442888  normal  0.0220595 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0937  ABC-2 type transporter  40.74 
 
 		 269 aa  158  1e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1839  ABC-2 type transporter  35.63 
 
 		 266 aa  152  7e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0666  ABC-2 type transporter  40.27 
 
 		 285 aa  150  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1483  ABC-2 type transporter  37.67 
 
 		 269 aa  150  2e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00140227  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1937  ABC-2 type transporter  35.46 
 
 		 284 aa  150  2e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.008119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0340  ABC-2 type transporter  34.78 
 
 		 273 aa  142  4e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.171685  hitchhiker  0.00234396 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0538  ABC-2 type transporter  35.84 
 
 		 267 aa  138  1e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.690834  hitchhiker  0.000010786 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39010  ABC-type multidrug transport system, permease component  32.31 
 
 		 271 aa  135  9e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.436846 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0618  ABC-2 type transporter  36.07 
 
 		 267 aa  134  9.999999999999999e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.099686  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1258  ABC-2 type transporter  33.21 
 
 		 300 aa  134  9.999999999999999e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1476  ABC-2 type transporter  36.24 
 
 		 267 aa  134  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3718  ABC-2 type transporter  33.06 
 
 		 260 aa  133  1.9999999999999998e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.282288  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4795  ABC-2 type transporter  35.19 
 
 		 284 aa  133  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597944 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0895  ABC-2 type transporter  33.96 
 
 		 266 aa  132  6e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4259  ABC-2 type transporter  34.4 
 
 		 282 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.573247  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4345  ABC-2 type transporter  34.4 
 
 		 282 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0911686 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4638  ABC-2 type transporter  34.4 
 
 		 282 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.619797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19160  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  33.89 
 
 		 319 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.338631 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4512  ABC-2 type transporter  34.23 
 
 		 281 aa  129  4.0000000000000003e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3922  ABC-2 type transporter  36.02 
 
 		 266 aa  129  4.0000000000000003e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0348636  normal  0.0335688 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4092  ABC-2 type transporter  32.3 
 
 		 290 aa  129  4.0000000000000003e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0130357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1878  ABC-2 type transporter  33.21 
 
 		 273 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0039  ABC-2 type transporter  35.91 
 
 		 267 aa  125  7e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.953662 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07250  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  31.78 
 
 		 265 aa  124  1e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.307058 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3986  ABC-2 type transporter  33.95 
 
 		 280 aa  124  1e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7215  ABC transporter (permease)  32.65 
 
 		 247 aa  120  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.284415 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3101  ABC-2 type transporter  33.2 
 
 		 266 aa  119  6e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5718  ABC-2 type transporter  32.38 
 
 		 263 aa  118  9.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2016  ABC-2 type transporter  30.4 
 
 		 268 aa  113  3e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1743  ABC-2 type transporter  35.16 
 
 		 271 aa  110  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000246748 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0674  ABC-2 type transporter  32.03 
 
 		 272 aa  110  2.0000000000000002e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.890968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4183  ABC-2 type transporter  31.58 
 
 		 269 aa  109  5e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.013923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0375  ABC-2 type transporter  33.63 
 
 		 264 aa  108  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.133292  hitchhiker  0.00534901 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1034  ABC-2 type transporter  28.23 
 
 		 254 aa  106  4e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.489208  normal  0.0976555 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5654  ABC-2 type transporter  34.29 
 
 		 267 aa  105  6e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24940  ABC-type multidrug transport system, permease component  31.8 
 
 		 284 aa  105  6e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.484855 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8859  ABC transporter permease  31.65 
 
 		 253 aa  105  7e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4190  ABC-2 type transporter  31.85 
 
 		 257 aa  105  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3132  ABC-2 type transporter  30.73 
 
 		 248 aa  103  2e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.571081  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0058  ABC-2 type transporter  28.84 
 
 		 271 aa  103  3e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4081  ABC-2 type transporter  29.85 
 
 		 274 aa  103  3e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.431533 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0959  ABC-2 type transporter  28.29 
 
 		 256 aa  103  3e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00197586  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1123  ABC-2 type transporter  32.88 
 
 		 275 aa  102  7e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4674  ABC-2 type transporter  31.42 
 
 		 276 aa  102  8e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.348942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4383  ABC-2 type transporter  28.57 
 
 		 253 aa  100  3e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.557459 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8158  ABC-2 type transporter  28.68 
 
 		 272 aa  100  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.880228 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3467  ABC transporter, efflux permease protein  27.66 
 
 		 249 aa  97.1  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000810233  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3149  ABC transporter efflux permease; daunorubicin resistance transmembrane protein  27.66 
 
 		 249 aa  97.1  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0286068  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0542  ABC-2 type transporter  26.78 
 
 		 253 aa  95.5  9e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5081  ABC transporter related protein  29.41 
 
 		 260 aa  94.7  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.630665  normal  0.675914 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1525  ABC-2 type transporter  28.98 
 
 		 290 aa  94.4  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00118323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4874  ABC-2 type transporter  27.73 
 
 		 253 aa  94.4  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0328295 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3239  ABC transporter efflux permease  26.81 
 
 		 249 aa  93.6  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6375  ABC-2 type transporter  28.32 
 
 		 247 aa  93.2  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3492  ABC transporter permease  26.81 
 
 		 249 aa  93.6  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.799548  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3453  ABC transporter, efflux permease protein  26.81 
 
 		 249 aa  93.6  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1808  ABC transporter, efflux permease protein  27.23 
 
 		 249 aa  92.8  5e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4761  ABC-2 type transporter  28.63 
 
 		 261 aa  92.4  6e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000109025  hitchhiker  0.000621886 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>