More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4761 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_4761  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 261 aa  517  1e-146  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000109025  hitchhiker  0.000621886 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7215  ABC transporter (permease)  46.09 
 
 		 247 aa  221  9.999999999999999e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.284415 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4190  ABC-2 type transporter  49.6 
 
 		 257 aa  219  3e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0674  ABC-2 type transporter  47.6 
 
 		 272 aa  210  2e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.890968  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4081  ABC-2 type transporter  45.97 
 
 		 274 aa  203  2e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.431533 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2016  ABC-2 type transporter  45.34 
 
 		 268 aa  202  7e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0058  ABC-2 type transporter  39.61 
 
 		 271 aa  192  5e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4383  ABC-2 type transporter  43.15 
 
 		 253 aa  190  2e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.557459 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3149  ABC transporter efflux permease; daunorubicin resistance transmembrane protein  37.7 
 
 		 249 aa  186  2e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0286068  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1034  ABC-2 type transporter  40.65 
 
 		 254 aa  186  3e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.489208  normal  0.0976555 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3467  ABC transporter, efflux permease protein  37.7 
 
 		 249 aa  186  4e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000810233  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3239  ABC transporter efflux permease  37.3 
 
 		 249 aa  184  9e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3453  ABC transporter, efflux permease protein  37.3 
 
 		 249 aa  184  9e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3492  ABC transporter permease  37.3 
 
 		 249 aa  184  9e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.799548  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1808  ABC transporter, efflux permease protein  37.7 
 
 		 249 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0542  ABC-2 type transporter  38.27 
 
 		 253 aa  183  3e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3147  ABC-2 type transporter  38.93 
 
 		 249 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.145802  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8859  ABC transporter permease  40.74 
 
 		 253 aa  181  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3438  ABC transporter, efflux permease protein  38.11 
 
 		 249 aa  180  2e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4874  ABC-2 type transporter  42.86 
 
 		 253 aa  179  4.999999999999999e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0328295 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3446  ABC transporter, efflux permease protein  37.3 
 
 		 249 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00692281  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3212  ABC transporter efflux permease; daunorubicin resistance transmembrane protein  37.7 
 
 		 249 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6375  ABC-2 type transporter  42.17 
 
 		 247 aa  177  1e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00340  ABC-type multidrug transport system, permease component  41.74 
 
 		 259 aa  175  5e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.15345 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2065  ABC-2 type transporter  42.86 
 
 		 254 aa  174  9.999999999999999e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0959  ABC-2 type transporter  38.46 
 
 		 256 aa  174  1.9999999999999998e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00197586  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3132  ABC-2 type transporter  38.68 
 
 		 248 aa  174  1.9999999999999998e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.571081  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1684  ABC-2 type transporter  40.25 
 
 		 251 aa  169  3e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3016  ABC-2 type transporter  40.82 
 
 		 254 aa  167  2e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.021308 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8873  ABC-2 type transporter  36.95 
 
 		 270 aa  162  7e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.53633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5588  ABC-2 type transporter  36.4 
 
 		 261 aa  160  2e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0213  ABC transporter permease  41.2 
 
 		 257 aa  160  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0375  ABC-2 type transporter  39.26 
 
 		 264 aa  155  9e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.133292  hitchhiker  0.00534901 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0918  ABC-2 type transporter  35.89 
 
 		 254 aa  147  1.0000000000000001e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1189  ABC-2 type transporter  42.4 
 
 		 263 aa  146  3e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000916915 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1473  hypothetical protein  36.86 
 
 		 269 aa  142  4e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.377134  normal  0.24112 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4992  ABC-2 type transporter  35.86 
 
 		 270 aa  138  7.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.402209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2086  ABC-2 type transporter  38.04 
 
 		 267 aa  128  8.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0340  ABC-2 type transporter  35.71 
 
 		 273 aa  126  4.0000000000000003e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.171685  hitchhiker  0.00234396 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2363  ABC-2 type transporter  34.5 
 
 		 267 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0153945  hitchhiker  0.00708379 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0598  ABC-2 type transporter  34.41 
 
 		 277 aa  120  1.9999999999999998e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1839  ABC-2 type transporter  33.64 
 
 		 266 aa  117  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1878  ABC-2 type transporter  37.44 
 
 		 273 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1483  ABC-2 type transporter  32.72 
 
 		 269 aa  116  3.9999999999999997e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00140227  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23570  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  29.81 
 
 		 267 aa  115  7.999999999999999e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.24456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0937  ABC-2 type transporter  31.82 
 
 		 269 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3922  ABC-2 type transporter  32.08 
 
 		 266 aa  112  7.000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0348636  normal  0.0335688 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0538  ABC-2 type transporter  30.43 
 
 		 267 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.690834  hitchhiker  0.000010786 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0287  ABC-2 type transporter  39.84 
 
 		 284 aa  110  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4512  ABC-2 type transporter  30.14 
 
 		 281 aa  109  4.0000000000000004e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0666  ABC-2 type transporter  31.08 
 
 		 285 aa  109  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39010  ABC-type multidrug transport system, permease component  32.47 
 
 		 271 aa  105  7e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.436846 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4023  ABC-2 type transporter  32 
 
 		 267 aa  105  8e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.293949  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4056  ABC-2 type transporter  32 
 
 		 267 aa  105  8e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1384  ABC-2 type transporter  29.66 
 
 		 269 aa  103  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.78336  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3916  ABC transporter, inner membrane subunit  31.5 
 
 		 267 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5259  ABC-2 type transporter  28.14 
 
 		 277 aa  103  4e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3718  ABC-2 type transporter  32.75 
 
 		 260 aa  101  1e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.282288  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3986  ABC-2 type transporter  32.63 
 
 		 280 aa  101  1e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35420  ABC-type multidrug transport system, permease component  30.24 
 
 		 257 aa  100  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1258  ABC-2 type transporter  31.15 
 
 		 300 aa  99.4  5e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07250  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  31.31 
 
 		 265 aa  97.8  2e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.307058 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4092  ABC-2 type transporter  31.63 
 
 		 290 aa  96.7  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0130357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4259  ABC-2 type transporter  29.05 
 
 		 282 aa  97.1  3e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.573247  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4345  ABC-2 type transporter  29.05 
 
 		 282 aa  97.1  3e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0911686 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4638  ABC-2 type transporter  29.05 
 
 		 282 aa  97.1  3e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.619797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1937  ABC-2 type transporter  28.1 
 
 		 284 aa  96.7  3e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.008119  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1525  ABC-2 type transporter  32.44 
 
 		 290 aa  96.3  5e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00118323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0895  ABC-2 type transporter  27.56 
 
 		 266 aa  95.9  5e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1476  ABC-2 type transporter  29.44 
 
 		 267 aa  95.9  6e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1123  ABC-2 type transporter  29.39 
 
 		 275 aa  95.5  7e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4551  ABC-2 type transporter  32.27 
 
 		 264 aa  95.5  9e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.442888  normal  0.0220595 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1697  ABC-2 type transporter  28.97 
 
 		 271 aa  94.7  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2716  ABC-2 type transporter  30.04 
 
 		 254 aa  95.1  1e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4795  ABC-2 type transporter  28.1 
 
 		 284 aa  94.7  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597944 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2939  ABC-2 type transporter  29.15 
 
 		 286 aa  94.7  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.27677 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2775  ABC-2 type transporter  29.66 
 
 		 278 aa  94.4  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00783625  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3101  ABC-2 type transporter  31.82 
 
 		 266 aa  94  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6787  ABC-2 type transporter  28.82 
 
 		 268 aa  94.4  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000212784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0746  ABC-2 type transporter  29.26 
 
 		 280 aa  93.6  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1351  ABC-2 type transporter  27.62 
 
 		 272 aa  93.6  3e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0414359  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0042  ABC-2 type transporter  27.18 
 
 		 266 aa  93.6  3e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2294  ABC-2 type transporter  28.64 
 
 		 277 aa  92.8  4e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.911135  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4183  ABC-2 type transporter  31.36 
 
 		 269 aa  92.4  7e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.013923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1743  ABC-2 type transporter  31.28 
 
 		 271 aa  92.4  7e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000246748 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4674  ABC-2 type transporter  29.36 
 
 		 276 aa  92  9e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.348942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0451  ABC-type multidrug transport system, permease component  25.21 
 
 		 269 aa  91.3  1e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0034336  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0618  ABC-2 type transporter  25.59 
 
 		 267 aa  91.7  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.099686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4188  hypothetical protein  56.18 
 
 		 214 aa  91.3  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00904545  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1622  ABC-2 type transporter  28.64 
 
 		 278 aa  89.7  4e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2897  ABC-2 type transporter  28.02 
 
 		 274 aa  89.4  6e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.643507  normal  0.323486 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3328  ABC-2 type transporter  31.25 
 
 		 281 aa  89  8e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.45338  normal  0.334159 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5654  ABC-2 type transporter  32.78 
 
 		 267 aa  88.2  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3253  ABC transporter related  27.83 
 
 		 265 aa  88.2  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00665342  normal  0.245763 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4936  ABC-2 type transporter  27.24 
 
 		 280 aa  87.4  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.707728  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19160  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  27.27 
 
 		 319 aa  87.8  2e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.338631 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1966  ABC-2 type transporter  27.43 
 
 		 318 aa  87.4  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.115517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1352  ABC-2 type transporter  30.1 
 
 		 254 aa  87.4  2e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.137638  normal  0.090478 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2043  ABC-2 type transporter  26.96 
 
 		 279 aa  86.7  4e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.167343  hitchhiker  0.00685853 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6250  ABC-2 type transporter  27.23 
 
 		 285 aa  86.3  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.243116  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>