More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1525 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1525  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 290 aa  556  1e-157  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00118323  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1258  ABC-2 type transporter  50.73 
 
 		 300 aa  237  2e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4674  ABC-2 type transporter  46.21 
 
 		 276 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.348942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5718  ABC-2 type transporter  42.53 
 
 		 263 aa  209  3e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0895  ABC-2 type transporter  44.71 
 
 		 266 aa  206  5e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5081  ABC transporter related protein  44.19 
 
 		 260 aa  193  3e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.630665  normal  0.675914 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24940  ABC-type multidrug transport system, permease component  37.93 
 
 		 284 aa  184  2.0000000000000003e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.484855 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8158  ABC-2 type transporter  37.5 
 
 		 272 aa  177  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.880228 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0666  ABC-2 type transporter  35.56 
 
 		 285 aa  174  9.999999999999999e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0538  ABC-2 type transporter  35.61 
 
 		 267 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.690834  hitchhiker  0.000010786 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3922  ABC-2 type transporter  36.08 
 
 		 266 aa  171  1e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0348636  normal  0.0335688 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5654  ABC-2 type transporter  42.75 
 
 		 267 aa  170  2e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0937  ABC-2 type transporter  37.6 
 
 		 269 aa  169  4e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1839  ABC-2 type transporter  35.41 
 
 		 266 aa  167  1e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3718  ABC-2 type transporter  37.35 
 
 		 260 aa  165  6.9999999999999995e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.282288  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1937  ABC-2 type transporter  31.9 
 
 		 284 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.008119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4092  ABC-2 type transporter  37.12 
 
 		 290 aa  162  8.000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0130357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39010  ABC-type multidrug transport system, permease component  36.67 
 
 		 271 aa  160  2e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.436846 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4259  ABC-2 type transporter  33.33 
 
 		 282 aa  159  3e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.573247  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4345  ABC-2 type transporter  33.33 
 
 		 282 aa  159  3e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0911686 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4795  ABC-2 type transporter  33.7 
 
 		 284 aa  160  3e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597944 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4638  ABC-2 type transporter  33.33 
 
 		 282 aa  159  3e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.619797  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1483  ABC-2 type transporter  34.98 
 
 		 269 aa  156  3e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00140227  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3101  ABC-2 type transporter  36.98 
 
 		 266 aa  154  2e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07250  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  33.07 
 
 		 265 aa  153  4e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.307058 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0618  ABC-2 type transporter  34.75 
 
 		 267 aa  152  5.9999999999999996e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.099686  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1473  hypothetical protein  36.6 
 
 		 269 aa  150  3e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.377134  normal  0.24112 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1476  ABC-2 type transporter  36.68 
 
 		 267 aa  150  3e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19160  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  32.07 
 
 		 319 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.338631 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4512  ABC-2 type transporter  31.47 
 
 		 281 aa  146  3e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4992  ABC-2 type transporter  34.98 
 
 		 270 aa  143  4e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.402209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0039  ABC-2 type transporter  33.33 
 
 		 267 aa  140  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.953662 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0918  ABC-2 type transporter  34.36 
 
 		 254 aa  139  4.999999999999999e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3986  ABC-2 type transporter  34.62 
 
 		 280 aa  139  6e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8859  ABC transporter permease  34.39 
 
 		 253 aa  138  8.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1034  ABC-2 type transporter  33.2 
 
 		 254 aa  137  3.0000000000000003e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.489208  normal  0.0976555 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1743  ABC-2 type transporter  36.96 
 
 		 271 aa  135  9.999999999999999e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000246748 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0340  ABC-2 type transporter  32.06 
 
 		 273 aa  133  3e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.171685  hitchhiker  0.00234396 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2016  ABC-2 type transporter  35.32 
 
 		 268 aa  133  3.9999999999999996e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0542  ABC-2 type transporter  31.75 
 
 		 253 aa  132  6e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0674  ABC-2 type transporter  35.47 
 
 		 272 aa  130  3e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.890968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3132  ABC-2 type transporter  34.12 
 
 		 248 aa  129  4.0000000000000003e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.571081  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3467  ABC transporter, efflux permease protein  32.02 
 
 		 249 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000810233  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2065  ABC-2 type transporter  34.39 
 
 		 254 aa  127  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3149  ABC transporter efflux permease; daunorubicin resistance transmembrane protein  30.83 
 
 		 249 aa  125  6e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0286068  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3239  ABC transporter efflux permease  30.83 
 
 		 249 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3492  ABC transporter permease  30.83 
 
 		 249 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.799548  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1808  ABC transporter, efflux permease protein  31.62 
 
 		 249 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4383  ABC-2 type transporter  35.42 
 
 		 253 aa  125  8.000000000000001e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.557459 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3453  ABC transporter, efflux permease protein  30.83 
 
 		 249 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4874  ABC-2 type transporter  34.57 
 
 		 253 aa  124  2e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0328295 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1878  ABC-2 type transporter  34.62 
 
 		 273 aa  123  3e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4023  ABC-2 type transporter  33.33 
 
 		 267 aa  123  4e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.293949  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3016  ABC-2 type transporter  34.12 
 
 		 254 aa  123  4e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.021308 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4056  ABC-2 type transporter  33.33 
 
 		 267 aa  123  4e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5259  ABC-2 type transporter  32.8 
 
 		 277 aa  122  8e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3916  ABC transporter, inner membrane subunit  33.84 
 
 		 267 aa  121  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0959  ABC-2 type transporter  32.56 
 
 		 256 aa  120  3e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00197586  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3438  ABC transporter, efflux permease protein  32.02 
 
 		 249 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3147  ABC-2 type transporter  31.62 
 
 		 249 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.145802  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3446  ABC transporter, efflux permease protein  30.83 
 
 		 249 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00692281  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0042  ABC-2 type transporter  30.57 
 
 		 266 aa  118  9.999999999999999e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3212  ABC transporter efflux permease; daunorubicin resistance transmembrane protein  30.83 
 
 		 249 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6787  ABC-2 type transporter  34.2 
 
 		 268 aa  115  6e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000212784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0451  ABC-type multidrug transport system, permease component  28.02 
 
 		 269 aa  114  1.0000000000000001e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0034336  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23570  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  29.96 
 
 		 267 aa  114  3e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.24456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1684  ABC-2 type transporter  32.02 
 
 		 251 aa  114  3e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4183  ABC-2 type transporter  33.08 
 
 		 269 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.013923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4761  ABC-2 type transporter  32.44 
 
 		 261 aa  111  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000109025  hitchhiker  0.000621886 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5588  ABC-2 type transporter  29.84 
 
 		 261 aa  110  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7215  ABC transporter (permease)  32.93 
 
 		 247 aa  110  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.284415 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1122  ABC-2 type transporter  27.69 
 
 		 285 aa  110  3e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.408605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3253  ABC transporter related  30.11 
 
 		 265 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00665342  normal  0.245763 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1351  ABC-2 type transporter  32.81 
 
 		 272 aa  109  5e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0414359  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0393  ABC-2 type transporter  32.46 
 
 		 274 aa  109  5e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6375  ABC-2 type transporter  28.51 
 
 		 247 aa  109  5e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30730  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  30.61 
 
 		 277 aa  109  6e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.364162  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1352  ABC-2 type transporter  34.58 
 
 		 254 aa  108  8.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.137638  normal  0.090478 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0746  ABC-2 type transporter  31.76 
 
 		 280 aa  108  8.000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4656  ABC-2 type transporter  30.31 
 
 		 285 aa  107  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.890125  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3103  ABC transporter protein  31.01 
 
 		 280 aa  107  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00849207 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2021  hypothetical protein  30.43 
 
 		 289 aa  107  2e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.290119  normal  0.988573 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2294  ABC-2 type transporter  32.95 
 
 		 277 aa  108  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.911135  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1683  ABC-2 type transporter  33.59 
 
 		 274 aa  106  4e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000181652  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0375  ABC-2 type transporter  30.38 
 
 		 264 aa  106  4e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.133292  hitchhiker  0.00534901 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2716  ABC-2 type transporter  33.46 
 
 		 254 aa  105  7e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1384  ABC-2 type transporter  33.48 
 
 		 269 aa  105  7e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.78336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0058  ABC-2 type transporter  29.58 
 
 		 271 aa  105  9e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1622  ABC-2 type transporter  28.16 
 
 		 278 aa  104  1e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2939  ABC-2 type transporter  31.14 
 
 		 286 aa  105  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.27677 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2897  ABC-2 type transporter  34.02 
 
 		 274 aa  104  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.643507  normal  0.323486 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1504  ABC-2 type transporter  26.09 
 
 		 272 aa  101  1e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.457097  normal  0.179064 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35420  ABC-type multidrug transport system, permease component  31.02 
 
 		 257 aa  100  3e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1966  ABC-2 type transporter  32.52 
 
 		 318 aa  99.8  4e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.115517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1697  ABC-2 type transporter  28.01 
 
 		 271 aa  100  4e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3328  ABC-2 type transporter  31.91 
 
 		 281 aa  99.8  5e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.45338  normal  0.334159 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22030  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  29.95 
 
 		 281 aa  99.4  6e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1755  ABC-2 type transporter  40.49 
 
 		 264 aa  99.4  6e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.586856  decreased coverage  0.00328589 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4081  ABC-2 type transporter  28.57 
 
 		 274 aa  99  8e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.431533 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18340  ABC-type multidrug transport system, permease component  30.24 
 
 		 282 aa  99  8e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.823039 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>