268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2016 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_2016  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 268 aa  515  1.0000000000000001e-145  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1034  ABC-2 type transporter  66.8 
 
 		 254 aa  344  1e-93  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.489208  normal  0.0976555 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8859  ABC transporter permease  69.32 
 
 		 253 aa  341  8e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0542  ABC-2 type transporter  64.9 
 
 		 253 aa  338  5e-92  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4383  ABC-2 type transporter  66.27 
 
 		 253 aa  330  2e-89  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.557459 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3016  ABC-2 type transporter  68.13 
 
 		 254 aa  329  3e-89  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.021308 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0959  ABC-2 type transporter  65.6 
 
 		 256 aa  328  4e-89  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00197586  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4874  ABC-2 type transporter  67.6 
 
 		 253 aa  324  1e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0328295 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1808  ABC transporter, efflux permease protein  60.16 
 
 		 249 aa  314  8e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3467  ABC transporter, efflux permease protein  59.35 
 
 		 249 aa  313  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000810233  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3239  ABC transporter efflux permease  59.35 
 
 		 249 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3149  ABC transporter efflux permease; daunorubicin resistance transmembrane protein  58.94 
 
 		 249 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0286068  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3492  ABC transporter permease  59.35 
 
 		 249 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.799548  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3453  ABC transporter, efflux permease protein  59.35 
 
 		 249 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3132  ABC-2 type transporter  61.38 
 
 		 248 aa  309  2.9999999999999997e-83  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.571081  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3147  ABC-2 type transporter  60.98 
 
 		 249 aa  305  4.0000000000000004e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.145802  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3212  ABC transporter efflux permease; daunorubicin resistance transmembrane protein  59.76 
 
 		 249 aa  305  7e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3438  ABC transporter, efflux permease protein  59.76 
 
 		 249 aa  303  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3446  ABC transporter, efflux permease protein  58.94 
 
 		 249 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00692281  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1684  ABC-2 type transporter  59.44 
 
 		 251 aa  291  8e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7215  ABC transporter (permease)  43.72 
 
 		 247 aa  208  7e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.284415 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4761  ABC-2 type transporter  43.77 
 
 		 261 aa  202  6e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000109025  hitchhiker  0.000621886 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0674  ABC-2 type transporter  42.45 
 
 		 272 aa  199  3e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.890968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8873  ABC-2 type transporter  40.38 
 
 		 270 aa  196  3e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.53633  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4081  ABC-2 type transporter  40.51 
 
 		 274 aa  195  7e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.431533 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6375  ABC-2 type transporter  40.33 
 
 		 247 aa  193  3e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0058  ABC-2 type transporter  39.02 
 
 		 271 aa  190  2e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0375  ABC-2 type transporter  44.73 
 
 		 264 aa  189  2.9999999999999997e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.133292  hitchhiker  0.00534901 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0213  ABC transporter permease  43.75 
 
 		 257 aa  189  5e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4190  ABC-2 type transporter  47.37 
 
 		 257 aa  186  2e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5588  ABC-2 type transporter  40.32 
 
 		 261 aa  185  8e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0918  ABC-2 type transporter  41.94 
 
 		 254 aa  176  3e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2065  ABC-2 type transporter  40 
 
 		 254 aa  174  9e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1473  hypothetical protein  42.68 
 
 		 269 aa  168  7e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.377134  normal  0.24112 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1189  ABC-2 type transporter  42.86 
 
 		 263 aa  166  5e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000916915 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4992  ABC-2 type transporter  39.77 
 
 		 270 aa  161  1e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.402209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2086  ABC-2 type transporter  43.98 
 
 		 267 aa  159  5e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0538  ABC-2 type transporter  36.02 
 
 		 267 aa  148  8e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.690834  hitchhiker  0.000010786 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0340  ABC-2 type transporter  39.2 
 
 		 273 aa  148  8e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.171685  hitchhiker  0.00234396 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23570  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  34.08 
 
 		 267 aa  148  9e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.24456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00340  ABC-type multidrug transport system, permease component  38.21 
 
 		 259 aa  148  1.0000000000000001e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.15345 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4551  ABC-2 type transporter  38.29 
 
 		 264 aa  146  3e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.442888  normal  0.0220595 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1384  ABC-2 type transporter  35.18 
 
 		 269 aa  141  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.78336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5259  ABC-2 type transporter  34.27 
 
 		 277 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35420  ABC-type multidrug transport system, permease component  34.92 
 
 		 257 aa  139  3.9999999999999997e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4936  ABC-2 type transporter  34.75 
 
 		 280 aa  137  2e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.707728  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6787  ABC-2 type transporter  36.84 
 
 		 268 aa  135  5e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000212784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1839  ABC-2 type transporter  34.75 
 
 		 266 aa  134  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3718  ABC-2 type transporter  32.95 
 
 		 260 aa  132  6e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.282288  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4092  ABC-2 type transporter  33.98 
 
 		 290 aa  132  6.999999999999999e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0130357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2716  ABC-2 type transporter  34.27 
 
 		 254 aa  131  1.0000000000000001e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1483  ABC-2 type transporter  33.02 
 
 		 269 aa  131  1.0000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00140227  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0666  ABC-2 type transporter  35.5 
 
 		 285 aa  130  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8158  ABC-2 type transporter  36.05 
 
 		 272 aa  129  6e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.880228 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1878  ABC-2 type transporter  36.72 
 
 		 273 aa  128  8.000000000000001e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0937  ABC-2 type transporter  34.11 
 
 		 269 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0287  ABC-2 type transporter  38.34 
 
 		 284 aa  127  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3922  ABC-2 type transporter  34.12 
 
 		 266 aa  127  1.0000000000000001e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0348636  normal  0.0335688 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4023  ABC-2 type transporter  34.31 
 
 		 267 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.293949  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1937  ABC-2 type transporter  30.22 
 
 		 284 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.008119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4056  ABC-2 type transporter  34.31 
 
 		 267 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2363  ABC-2 type transporter  39.49 
 
 		 267 aa  126  3e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0153945  hitchhiker  0.00708379 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3916  ABC transporter, inner membrane subunit  33.89 
 
 		 267 aa  126  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24940  ABC-type multidrug transport system, permease component  32.98 
 
 		 284 aa  124  1e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.484855 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0598  ABC-2 type transporter  37.87 
 
 		 277 aa  125  1e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30730  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  34.05 
 
 		 277 aa  124  2e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.364162  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0042  ABC-2 type transporter  31.05 
 
 		 266 aa  123  3e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1122  ABC-2 type transporter  33.06 
 
 		 285 aa  123  4e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.408605  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2897  ABC-2 type transporter  35.27 
 
 		 274 aa  122  6e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.643507  normal  0.323486 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4183  ABC-2 type transporter  33.94 
 
 		 269 aa  122  6e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.013923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0746  ABC-2 type transporter  31.94 
 
 		 280 aa  122  8e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4259  ABC-2 type transporter  29.35 
 
 		 282 aa  120  3e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.573247  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2294  ABC-2 type transporter  32.05 
 
 		 277 aa  120  3e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.911135  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4345  ABC-2 type transporter  29.35 
 
 		 282 aa  120  3e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0911686 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4638  ABC-2 type transporter  29.35 
 
 		 282 aa  120  3e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.619797  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4795  ABC-2 type transporter  30.37 
 
 		 284 aa  119  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597944 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0618  ABC-2 type transporter  33.2 
 
 		 267 aa  119  3.9999999999999996e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.099686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6250  ABC-2 type transporter  33.07 
 
 		 285 aa  119  4.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.243116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1352  ABC-2 type transporter  31.87 
 
 		 254 aa  119  7e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.137638  normal  0.090478 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1683  ABC-2 type transporter  31.35 
 
 		 274 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000181652  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0451  ABC-type multidrug transport system, permease component  29.37 
 
 		 269 aa  117  1.9999999999999998e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0034336  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1476  ABC-2 type transporter  32.57 
 
 		 267 aa  117  3e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1966  ABC-2 type transporter  32.7 
 
 		 318 aa  116  5e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.115517  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1258  ABC-2 type transporter  32.74 
 
 		 300 aa  115  6e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1504  ABC-2 type transporter  30.24 
 
 		 272 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.457097  normal  0.179064 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2021  hypothetical protein  32.92 
 
 		 289 aa  114  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.290119  normal  0.988573 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4656  ABC-2 type transporter  30.8 
 
 		 285 aa  114  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.890125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4512  ABC-2 type transporter  29.77 
 
 		 281 aa  114  2.0000000000000002e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2939  ABC-2 type transporter  30.08 
 
 		 286 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.27677 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1236  ABC-2 type transporter  32.08 
 
 		 281 aa  113  3e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19160  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  32.5 
 
 		 319 aa  113  4.0000000000000004e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.338631 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1697  ABC-2 type transporter  27.24 
 
 		 271 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1743  ABC-2 type transporter  35.85 
 
 		 271 aa  113  4.0000000000000004e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000246748 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3101  ABC-2 type transporter  34.77 
 
 		 266 aa  112  6e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1622  ABC-2 type transporter  29.64 
 
 		 278 aa  112  7.000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3986  ABC-2 type transporter  32.22 
 
 		 280 aa  112  7.000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1525  ABC-2 type transporter  34.15 
 
 		 290 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00118323  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3103  ABC transporter protein  31.27 
 
 		 280 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00849207 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1351  ABC-2 type transporter  30.67 
 
 		 272 aa  110  2.0000000000000002e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0414359  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39010  ABC-type multidrug transport system, permease component  30.92 
 
 		 271 aa  110  2.0000000000000002e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.436846 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>