More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_1697 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_1697  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 271 aa  548  1e-155  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0042  ABC-2 type transporter  63.77 
 
 		 266 aa  360  1e-98  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1622  ABC-2 type transporter  60.08 
 
 		 278 aa  333  2e-90  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1351  ABC-2 type transporter  64.11 
 
 		 272 aa  325  5e-88  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0414359  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22030  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  64.5 
 
 		 281 aa  322  6e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1122  ABC-2 type transporter  58.73 
 
 		 285 aa  318  3.9999999999999996e-86  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.408605  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0393  ABC-2 type transporter  57.25 
 
 		 274 aa  299  3e-80  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3103  ABC transporter protein  54.37 
 
 		 280 aa  290  1e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00849207 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4656  ABC-2 type transporter  54.76 
 
 		 285 aa  288  9e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.890125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2021  hypothetical protein  53.6 
 
 		 289 aa  282  3.0000000000000004e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.290119  normal  0.988573 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1504  ABC-2 type transporter  46.32 
 
 		 272 aa  276  2e-73  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.457097  normal  0.179064 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3893  ABC-2 type transporter  55.83 
 
 		 242 aa  273  2.0000000000000002e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0012751  normal  0.0102027 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6250  ABC-2 type transporter  53.06 
 
 		 285 aa  273  3e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.243116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30730  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  46.69 
 
 		 277 aa  252  6e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.364162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0451  ABC-type multidrug transport system, permease component  47.22 
 
 		 269 aa  232  4.0000000000000004e-60  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0034336  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1236  ABC-2 type transporter  47.08 
 
 		 281 aa  231  6e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0746  ABC-2 type transporter  42.52 
 
 		 280 aa  223  3e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5259  ABC-2 type transporter  47.52 
 
 		 277 aa  218  1e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3328  ABC-2 type transporter  42.22 
 
 		 281 aa  216  4e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.45338  normal  0.334159 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4056  ABC-2 type transporter  41.64 
 
 		 267 aa  213  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4023  ABC-2 type transporter  41.64 
 
 		 267 aa  213  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.293949  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3253  ABC transporter related  42.35 
 
 		 265 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00665342  normal  0.245763 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3916  ABC transporter, inner membrane subunit  42.01 
 
 		 267 aa  212  4.9999999999999996e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1966  ABC-2 type transporter  43.14 
 
 		 318 aa  212  4.9999999999999996e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.115517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1384  ABC-2 type transporter  42.97 
 
 		 269 aa  212  5.999999999999999e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.78336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4936  ABC-2 type transporter  41.37 
 
 		 280 aa  207  1e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.707728  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2294  ABC-2 type transporter  44.94 
 
 		 277 aa  204  2e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.911135  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6787  ABC-2 type transporter  40.62 
 
 		 268 aa  200  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000212784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2775  ABC-2 type transporter  40.29 
 
 		 278 aa  198  7.999999999999999e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00783625  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2939  ABC-2 type transporter  40.55 
 
 		 286 aa  196  4.0000000000000005e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.27677 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2897  ABC-2 type transporter  41.02 
 
 		 274 aa  194  1e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.643507  normal  0.323486 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2716  ABC-2 type transporter  42.57 
 
 		 254 aa  190  2e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2100  ABC-2 type transporter  38.43 
 
 		 267 aa  187  2e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1683  ABC-2 type transporter  37.69 
 
 		 274 aa  185  6e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000181652  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35420  ABC-type multidrug transport system, permease component  39.2 
 
 		 257 aa  182  5.0000000000000004e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0918  ABC-2 type transporter  36.4 
 
 		 254 aa  180  2e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23570  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  37.8 
 
 		 267 aa  178  8e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.24456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1352  ABC-2 type transporter  40.16 
 
 		 254 aa  177  2e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.137638  normal  0.090478 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2043  ABC-2 type transporter  36.36 
 
 		 279 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.167343  hitchhiker  0.00685853 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4551  ABC-2 type transporter  38.71 
 
 		 264 aa  173  2.9999999999999996e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.442888  normal  0.0220595 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4992  ABC-2 type transporter  36.68 
 
 		 270 aa  166  5e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.402209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0937  ABC-2 type transporter  34.83 
 
 		 269 aa  162  4.0000000000000004e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0340  ABC-2 type transporter  37.5 
 
 		 273 aa  162  4.0000000000000004e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.171685  hitchhiker  0.00234396 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1473  hypothetical protein  36.92 
 
 		 269 aa  162  5.0000000000000005e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.377134  normal  0.24112 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0538  ABC-2 type transporter  35.66 
 
 		 267 aa  157  2e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.690834  hitchhiker  0.000010786 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4259  ABC-2 type transporter  34.07 
 
 		 282 aa  151  8.999999999999999e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.573247  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4345  ABC-2 type transporter  34.07 
 
 		 282 aa  151  8.999999999999999e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0911686 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4638  ABC-2 type transporter  34.07 
 
 		 282 aa  151  8.999999999999999e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.619797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4092  ABC-2 type transporter  35.63 
 
 		 290 aa  151  1e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0130357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1839  ABC-2 type transporter  35.23 
 
 		 266 aa  150  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0666  ABC-2 type transporter  36.36 
 
 		 285 aa  149  4e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1476  ABC-2 type transporter  36.15 
 
 		 267 aa  149  5e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1937  ABC-2 type transporter  33.46 
 
 		 284 aa  148  8e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.008119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4795  ABC-2 type transporter  33.72 
 
 		 284 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597944 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07250  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  34.11 
 
 		 265 aa  148  1.0000000000000001e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.307058 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4512  ABC-2 type transporter  33.6 
 
 		 281 aa  145  5e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3922  ABC-2 type transporter  32.83 
 
 		 266 aa  145  1e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0348636  normal  0.0335688 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1878  ABC-2 type transporter  37.07 
 
 		 273 aa  144  2e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39010  ABC-type multidrug transport system, permease component  33.83 
 
 		 271 aa  140  1.9999999999999998e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.436846 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3101  ABC-2 type transporter  32.7 
 
 		 266 aa  133  3e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0039  ABC-2 type transporter  33.72 
 
 		 267 aa  132  6.999999999999999e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.953662 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3986  ABC-2 type transporter  29.21 
 
 		 280 aa  131  1.0000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8158  ABC-2 type transporter  31.42 
 
 		 272 aa  130  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.880228 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1483  ABC-2 type transporter  34.56 
 
 		 269 aa  130  3e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00140227  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4183  ABC-2 type transporter  34.16 
 
 		 269 aa  124  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.013923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0542  ABC-2 type transporter  31.87 
 
 		 253 aa  124  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1743  ABC-2 type transporter  34.56 
 
 		 271 aa  122  6e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000246748 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19160  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  32.08 
 
 		 319 aa  122  8e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.338631 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0375  ABC-2 type transporter  30.65 
 
 		 264 aa  120  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.133292  hitchhiker  0.00534901 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4190  ABC-2 type transporter  34.12 
 
 		 257 aa  118  7.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3718  ABC-2 type transporter  30 
 
 		 260 aa  118  9.999999999999999e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.282288  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0895  ABC-2 type transporter  30.53 
 
 		 266 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0618  ABC-2 type transporter  29.39 
 
 		 267 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.099686  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1034  ABC-2 type transporter  28.57 
 
 		 254 aa  115  5e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.489208  normal  0.0976555 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24940  ABC-type multidrug transport system, permease component  31.44 
 
 		 284 aa  115  6e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.484855 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4081  ABC-2 type transporter  31.3 
 
 		 274 aa  115  1.0000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.431533 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0058  ABC-2 type transporter  31.54 
 
 		 271 aa  113  3e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7215  ABC transporter (permease)  32.65 
 
 		 247 aa  113  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.284415 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4383  ABC-2 type transporter  30.52 
 
 		 253 aa  113  3e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.557459 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4106  ABC-2 type transporter  29.69 
 
 		 293 aa  112  6e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2016  ABC-2 type transporter  28.4 
 
 		 268 aa  112  6e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3132  ABC-2 type transporter  30.91 
 
 		 248 aa  112  9e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.571081  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18340  ABC-type multidrug transport system, permease component  33.33 
 
 		 282 aa  111  1.0000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.823039 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0674  ABC-2 type transporter  33.2 
 
 		 272 aa  111  1.0000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.890968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1123  ABC-2 type transporter  33.64 
 
 		 275 aa  111  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0959  ABC-2 type transporter  29.02 
 
 		 256 aa  111  1.0000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00197586  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2065  ABC-2 type transporter  31.1 
 
 		 254 aa  109  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4674  ABC-2 type transporter  32.02 
 
 		 276 aa  108  8.000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.348942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3453  ABC transporter, efflux permease protein  28.63 
 
 		 249 aa  108  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3239  ABC transporter efflux permease  28.63 
 
 		 249 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3438  ABC transporter, efflux permease protein  29.52 
 
 		 249 aa  108  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3492  ABC transporter permease  28.63 
 
 		 249 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.799548  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1808  ABC transporter, efflux permease protein  29.07 
 
 		 249 aa  108  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1258  ABC-2 type transporter  28.79 
 
 		 300 aa  107  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3147  ABC-2 type transporter  29.07 
 
 		 249 aa  107  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.145802  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0014  ABC-2 type transporter  30.18 
 
 		 304 aa  107  2e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5718  ABC-2 type transporter  28.35 
 
 		 263 aa  107  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3149  ABC transporter efflux permease; daunorubicin resistance transmembrane protein  28.19 
 
 		 249 aa  106  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0286068  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5654  ABC-2 type transporter  31.76 
 
 		 267 aa  106  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3467  ABC transporter, efflux permease protein  27.75 
 
 		 249 aa  105  9e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000810233  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>