268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4383 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_4383  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 253 aa  500  1e-141  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.557459 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4874  ABC-2 type transporter  89.29 
 
 		 253 aa  422  1e-117  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0328295 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0542  ABC-2 type transporter  74.6 
 
 		 253 aa  388  1e-107  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8859  ABC transporter permease  78.17 
 
 		 253 aa  386  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1034  ABC-2 type transporter  70.36 
 
 		 254 aa  362  2e-99  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.489208  normal  0.0976555 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0959  ABC-2 type transporter  69.02 
 
 		 256 aa  347  8e-95  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00197586  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3016  ABC-2 type transporter  71.03 
 
 		 254 aa  346  2e-94  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.021308 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2016  ABC-2 type transporter  66.27 
 
 		 268 aa  339  2.9999999999999998e-92  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1808  ABC transporter, efflux permease protein  64.9 
 
 		 249 aa  332  3e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3467  ABC transporter, efflux permease protein  64.08 
 
 		 249 aa  332  4e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000810233  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3149  ABC transporter efflux permease; daunorubicin resistance transmembrane protein  64.08 
 
 		 249 aa  331  6e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0286068  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3239  ABC transporter efflux permease  63.27 
 
 		 249 aa  330  1e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3492  ABC transporter permease  63.27 
 
 		 249 aa  330  1e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.799548  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3453  ABC transporter, efflux permease protein  63.27 
 
 		 249 aa  330  1e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3147  ABC-2 type transporter  66.53 
 
 		 249 aa  325  4.0000000000000003e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.145802  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3438  ABC transporter, efflux permease protein  65.31 
 
 		 249 aa  323  2e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3446  ABC transporter, efflux permease protein  64.49 
 
 		 249 aa  320  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00692281  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3212  ABC transporter efflux permease; daunorubicin resistance transmembrane protein  64.08 
 
 		 249 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1684  ABC-2 type transporter  64.66 
 
 		 251 aa  309  2.9999999999999997e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3132  ABC-2 type transporter  60.98 
 
 		 248 aa  297  1e-79  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.571081  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0674  ABC-2 type transporter  46.25 
 
 		 272 aa  211  1e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.890968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7215  ABC transporter (permease)  44.96 
 
 		 247 aa  205  4e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.284415 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4761  ABC-2 type transporter  43.15 
 
 		 261 aa  197  2.0000000000000003e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000109025  hitchhiker  0.000621886 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0375  ABC-2 type transporter  44.86 
 
 		 264 aa  195  6e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.133292  hitchhiker  0.00534901 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6375  ABC-2 type transporter  42.5 
 
 		 247 aa  192  4e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5588  ABC-2 type transporter  40.08 
 
 		 261 aa  189  4e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4081  ABC-2 type transporter  41.67 
 
 		 274 aa  183  2.0000000000000003e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.431533 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0058  ABC-2 type transporter  38.19 
 
 		 271 aa  182  4.0000000000000006e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4190  ABC-2 type transporter  46.94 
 
 		 257 aa  182  4.0000000000000006e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8873  ABC-2 type transporter  39.84 
 
 		 270 aa  181  8.000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.53633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0213  ABC transporter permease  41.7 
 
 		 257 aa  177  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1473  hypothetical protein  43.75 
 
 		 269 aa  172  2.9999999999999996e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.377134  normal  0.24112 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2065  ABC-2 type transporter  41.3 
 
 		 254 aa  172  5e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4992  ABC-2 type transporter  38.27 
 
 		 270 aa  166  2.9999999999999998e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.402209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1189  ABC-2 type transporter  43.81 
 
 		 263 aa  165  5.9999999999999996e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000916915 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0918  ABC-2 type transporter  38.11 
 
 		 254 aa  160  1e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00340  ABC-type multidrug transport system, permease component  36.97 
 
 		 259 aa  144  1e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.15345 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2086  ABC-2 type transporter  38.52 
 
 		 267 aa  144  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5259  ABC-2 type transporter  36.07 
 
 		 277 aa  142  4e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35420  ABC-type multidrug transport system, permease component  34.73 
 
 		 257 aa  140  1.9999999999999998e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1384  ABC-2 type transporter  37.25 
 
 		 269 aa  138  7e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.78336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0287  ABC-2 type transporter  39.31 
 
 		 284 aa  138  7.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0538  ABC-2 type transporter  36.28 
 
 		 267 aa  136  3.0000000000000003e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.690834  hitchhiker  0.000010786 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4551  ABC-2 type transporter  35.22 
 
 		 264 aa  135  7.000000000000001e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.442888  normal  0.0220595 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0340  ABC-2 type transporter  38.74 
 
 		 273 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.171685  hitchhiker  0.00234396 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23570  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  32.92 
 
 		 267 aa  134  9.999999999999999e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.24456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30730  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  36.4 
 
 		 277 aa  133  1.9999999999999998e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.364162  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6787  ABC-2 type transporter  33.06 
 
 		 268 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000212784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4936  ABC-2 type transporter  36.36 
 
 		 280 aa  133  3e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.707728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1483  ABC-2 type transporter  34.55 
 
 		 269 aa  132  6.999999999999999e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00140227  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3718  ABC-2 type transporter  36.1 
 
 		 260 aa  132  7.999999999999999e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.282288  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1839  ABC-2 type transporter  39.61 
 
 		 266 aa  131  7.999999999999999e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0746  ABC-2 type transporter  33.33 
 
 		 280 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2363  ABC-2 type transporter  42.35 
 
 		 267 aa  129  3e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0153945  hitchhiker  0.00708379 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4092  ABC-2 type transporter  32.43 
 
 		 290 aa  129  6e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0130357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0666  ABC-2 type transporter  37.02 
 
 		 285 aa  129  6e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1878  ABC-2 type transporter  36.78 
 
 		 273 aa  127  1.0000000000000001e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0042  ABC-2 type transporter  33.06 
 
 		 266 aa  128  1.0000000000000001e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3103  ABC transporter protein  33.2 
 
 		 280 aa  125  7e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00849207 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1351  ABC-2 type transporter  34.84 
 
 		 272 aa  125  8.000000000000001e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0414359  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1476  ABC-2 type transporter  33.85 
 
 		 267 aa  124  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0937  ABC-2 type transporter  31.64 
 
 		 269 aa  123  2e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2897  ABC-2 type transporter  35.63 
 
 		 274 aa  123  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.643507  normal  0.323486 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4056  ABC-2 type transporter  32.92 
 
 		 267 aa  122  4e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4023  ABC-2 type transporter  32.92 
 
 		 267 aa  122  4e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.293949  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3922  ABC-2 type transporter  35.63 
 
 		 266 aa  122  5e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0348636  normal  0.0335688 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3916  ABC transporter, inner membrane subunit  32.92 
 
 		 267 aa  121  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2716  ABC-2 type transporter  30.49 
 
 		 254 aa  121  9.999999999999999e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1622  ABC-2 type transporter  33.2 
 
 		 278 aa  120  9.999999999999999e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1236  ABC-2 type transporter  34 
 
 		 281 aa  120  1.9999999999999998e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0039  ABC-2 type transporter  34.09 
 
 		 267 aa  120  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.953662 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19160  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  33.75 
 
 		 319 aa  119  3e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.338631 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1937  ABC-2 type transporter  31.47 
 
 		 284 aa  118  9e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.008119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2775  ABC-2 type transporter  30.71 
 
 		 278 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00783625  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3328  ABC-2 type transporter  33.05 
 
 		 281 aa  117  9.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.45338  normal  0.334159 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1697  ABC-2 type transporter  31.35 
 
 		 271 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4656  ABC-2 type transporter  32.81 
 
 		 285 aa  117  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.890125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24940  ABC-type multidrug transport system, permease component  33.47 
 
 		 284 aa  116  3e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.484855 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1504  ABC-2 type transporter  30.12 
 
 		 272 aa  116  3e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.457097  normal  0.179064 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22030  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  34.27 
 
 		 281 aa  116  3.9999999999999997e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1122  ABC-2 type transporter  29.67 
 
 		 285 aa  116  3.9999999999999997e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.408605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1352  ABC-2 type transporter  29.84 
 
 		 254 aa  115  5e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.137638  normal  0.090478 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0598  ABC-2 type transporter  36.4 
 
 		 277 aa  115  6e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1683  ABC-2 type transporter  31.2 
 
 		 274 aa  115  6e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000181652  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3101  ABC-2 type transporter  35.68 
 
 		 266 aa  115  6.9999999999999995e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2294  ABC-2 type transporter  30.99 
 
 		 277 aa  115  7.999999999999999e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.911135  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3986  ABC-2 type transporter  35.98 
 
 		 280 aa  115  7.999999999999999e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4183  ABC-2 type transporter  33.05 
 
 		 269 aa  115  7.999999999999999e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.013923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1966  ABC-2 type transporter  34.02 
 
 		 318 aa  115  8.999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.115517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0618  ABC-2 type transporter  32.17 
 
 		 267 aa  113  2.0000000000000002e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.099686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6250  ABC-2 type transporter  30.68 
 
 		 285 aa  113  3e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.243116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1743  ABC-2 type transporter  33.8 
 
 		 271 aa  113  3e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000246748 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4795  ABC-2 type transporter  31.87 
 
 		 284 aa  112  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597944 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39010  ABC-type multidrug transport system, permease component  35.56 
 
 		 271 aa  112  7.000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.436846 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2939  ABC-2 type transporter  31.22 
 
 		 286 aa  112  7.000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.27677 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4512  ABC-2 type transporter  33.64 
 
 		 281 aa  112  8.000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1525  ABC-2 type transporter  35.42 
 
 		 290 aa  112  8.000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00118323  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0393  ABC-2 type transporter  33.46 
 
 		 274 aa  111  1.0000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07250  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  35.32 
 
 		 265 aa  110  2.0000000000000002e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.307058 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4345  ABC-2 type transporter  31.47 
 
 		 282 aa  108  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0911686 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>