More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2363 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_2363  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 267 aa  521  1e-147  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0153945  hitchhiker  0.00708379 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0375  ABC-2 type transporter  59.14 
 
 		 264 aa  296  2e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.133292  hitchhiker  0.00534901 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1189  ABC-2 type transporter  56.06 
 
 		 263 aa  258  9e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000916915 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5588  ABC-2 type transporter  51.92 
 
 		 261 aa  245  4.9999999999999997e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2086  ABC-2 type transporter  56.87 
 
 		 267 aa  244  1.9999999999999999e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0213  ABC transporter permease  53.26 
 
 		 257 aa  238  8e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8873  ABC-2 type transporter  47.33 
 
 		 270 aa  234  1.0000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.53633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6375  ABC-2 type transporter  39.53 
 
 		 247 aa  191  1e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0287  ABC-2 type transporter  51.87 
 
 		 284 aa  189  4e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2065  ABC-2 type transporter  40.91 
 
 		 254 aa  181  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0542  ABC-2 type transporter  40.38 
 
 		 253 aa  176  3e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0674  ABC-2 type transporter  42.53 
 
 		 272 aa  172  5e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.890968  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1034  ABC-2 type transporter  38.91 
 
 		 254 aa  172  5.999999999999999e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.489208  normal  0.0976555 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7215  ABC transporter (permease)  39.68 
 
 		 247 aa  168  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.284415 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2016  ABC-2 type transporter  38.49 
 
 		 268 aa  167  2e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4383  ABC-2 type transporter  40.62 
 
 		 253 aa  167  2e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.557459 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0959  ABC-2 type transporter  39.15 
 
 		 256 aa  165  8e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00197586  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4874  ABC-2 type transporter  40.47 
 
 		 253 aa  163  2.0000000000000002e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0328295 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3149  ABC transporter efflux permease; daunorubicin resistance transmembrane protein  39.13 
 
 		 249 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0286068  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1808  ABC transporter, efflux permease protein  38.34 
 
 		 249 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3467  ABC transporter, efflux permease protein  38.55 
 
 		 249 aa  162  6e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000810233  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3016  ABC-2 type transporter  39 
 
 		 254 aa  162  8.000000000000001e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.021308 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3239  ABC transporter efflux permease  38.15 
 
 		 249 aa  160  1e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3492  ABC transporter permease  38.15 
 
 		 249 aa  160  1e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.799548  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3453  ABC transporter, efflux permease protein  38.15 
 
 		 249 aa  160  1e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3132  ABC-2 type transporter  40.33 
 
 		 248 aa  158  7e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.571081  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3438  ABC transporter, efflux permease protein  39.13 
 
 		 249 aa  158  8e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8859  ABC transporter permease  38.52 
 
 		 253 aa  157  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4190  ABC-2 type transporter  42.18 
 
 		 257 aa  155  4e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3147  ABC-2 type transporter  38.34 
 
 		 249 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.145802  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1684  ABC-2 type transporter  40.48 
 
 		 251 aa  155  8e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3212  ABC transporter efflux permease; daunorubicin resistance transmembrane protein  38.34 
 
 		 249 aa  155  9e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3446  ABC transporter, efflux permease protein  37.75 
 
 		 249 aa  154  1e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00692281  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4081  ABC-2 type transporter  38.26 
 
 		 274 aa  146  3e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.431533 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0058  ABC-2 type transporter  33.6 
 
 		 271 aa  145  6e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4761  ABC-2 type transporter  32.31 
 
 		 261 aa  144  1e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000109025  hitchhiker  0.000621886 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0598  ABC-2 type transporter  36.9 
 
 		 277 aa  141  9.999999999999999e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0918  ABC-2 type transporter  33.08 
 
 		 254 aa  134  9.999999999999999e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00340  ABC-type multidrug transport system, permease component  33.2 
 
 		 259 aa  133  3e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.15345 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1473  hypothetical protein  31.7 
 
 		 269 aa  127  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.377134  normal  0.24112 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0746  ABC-2 type transporter  32.26 
 
 		 280 aa  124  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4992  ABC-2 type transporter  31.58 
 
 		 270 aa  119  6e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.402209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35420  ABC-type multidrug transport system, permease component  32.08 
 
 		 257 aa  117  1.9999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0937  ABC-2 type transporter  29.31 
 
 		 269 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23570  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  32.64 
 
 		 267 aa  113  3e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.24456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4092  ABC-2 type transporter  32.74 
 
 		 290 aa  110  3e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0130357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4936  ABC-2 type transporter  30.87 
 
 		 280 aa  110  3e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.707728  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0538  ABC-2 type transporter  29.31 
 
 		 267 aa  110  3e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.690834  hitchhiker  0.000010786 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0340  ABC-2 type transporter  32.46 
 
 		 273 aa  109  4.0000000000000004e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.171685  hitchhiker  0.00234396 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2294  ABC-2 type transporter  32.42 
 
 		 277 aa  108  9.000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.911135  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1839  ABC-2 type transporter  30.14 
 
 		 266 aa  108  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2939  ABC-2 type transporter  32.72 
 
 		 286 aa  108  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.27677 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30730  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  31.12 
 
 		 277 aa  107  2e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.364162  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0666  ABC-2 type transporter  31.39 
 
 		 285 aa  107  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6787  ABC-2 type transporter  33.77 
 
 		 268 aa  107  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000212784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24940  ABC-type multidrug transport system, permease component  28.4 
 
 		 284 aa  107  3e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.484855 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4656  ABC-2 type transporter  27.41 
 
 		 285 aa  107  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.890125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0042  ABC-2 type transporter  27.1 
 
 		 266 aa  106  4e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0039  ABC-2 type transporter  29.44 
 
 		 267 aa  106  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.953662 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3922  ABC-2 type transporter  30.18 
 
 		 266 aa  106  5e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0348636  normal  0.0335688 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5259  ABC-2 type transporter  30.32 
 
 		 277 aa  105  5e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1937  ABC-2 type transporter  33.18 
 
 		 284 aa  105  7e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.008119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1483  ABC-2 type transporter  27.27 
 
 		 269 aa  105  8e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00140227  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2775  ABC-2 type transporter  30.77 
 
 		 278 aa  104  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00783625  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1476  ABC-2 type transporter  29.56 
 
 		 267 aa  104  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3328  ABC-2 type transporter  32.09 
 
 		 281 aa  103  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.45338  normal  0.334159 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4551  ABC-2 type transporter  33.62 
 
 		 264 aa  102  8e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.442888  normal  0.0220595 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1122  ABC-2 type transporter  27.82 
 
 		 285 aa  101  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.408605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1384  ABC-2 type transporter  32.44 
 
 		 269 aa  100  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.78336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39010  ABC-type multidrug transport system, permease component  29.87 
 
 		 271 aa  99.8  4e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.436846 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1504  ABC-2 type transporter  27.63 
 
 		 272 aa  100  4e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.457097  normal  0.179064 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1683  ABC-2 type transporter  31.75 
 
 		 274 aa  99.4  5e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000181652  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3916  ABC transporter, inner membrane subunit  30.09 
 
 		 267 aa  98.6  8e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4259  ABC-2 type transporter  31.88 
 
 		 282 aa  98.6  8e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.573247  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4345  ABC-2 type transporter  31.88 
 
 		 282 aa  98.6  8e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0911686 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4638  ABC-2 type transporter  31.88 
 
 		 282 aa  98.6  8e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.619797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6250  ABC-2 type transporter  29.11 
 
 		 285 aa  98.6  9e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.243116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07250  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  29.65 
 
 		 265 aa  98.6  9e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.307058 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1351  ABC-2 type transporter  27.27 
 
 		 272 aa  98.2  1e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0414359  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1697  ABC-2 type transporter  26.72 
 
 		 271 aa  97.4  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0393  ABC-2 type transporter  26.42 
 
 		 274 aa  97.1  3e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1236  ABC-2 type transporter  30.7 
 
 		 281 aa  97.1  3e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4795  ABC-2 type transporter  33.18 
 
 		 284 aa  97.1  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597944 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3103  ABC transporter protein  27.44 
 
 		 280 aa  96.3  4e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00849207 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4512  ABC-2 type transporter  32.31 
 
 		 281 aa  96.7  4e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4056  ABC-2 type transporter  29.63 
 
 		 267 aa  96.3  5e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4023  ABC-2 type transporter  29.63 
 
 		 267 aa  96.3  5e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.293949  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8158  ABC-2 type transporter  28.27 
 
 		 272 aa  95.9  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.880228 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3253  ABC transporter related  31.02 
 
 		 265 aa  94.7  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00665342  normal  0.245763 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3718  ABC-2 type transporter  28.46 
 
 		 260 aa  94.4  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.282288  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1258  ABC-2 type transporter  29.6 
 
 		 300 aa  94  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5718  ABC-2 type transporter  28.7 
 
 		 263 aa  93.6  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22030  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  25.88 
 
 		 281 aa  92.8  6e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2716  ABC-2 type transporter  33.02 
 
 		 254 aa  92  9e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2100  ABC-2 type transporter  31.01 
 
 		 267 aa  91.7  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1352  ABC-2 type transporter  34.42 
 
 		 254 aa  91.3  1e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.137638  normal  0.090478 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0451  ABC-type multidrug transport system, permease component  26.94 
 
 		 269 aa  91.3  2e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0034336  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3986  ABC-2 type transporter  30.14 
 
 		 280 aa  91.3  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4183  ABC-2 type transporter  29.66 
 
 		 269 aa  90.5  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.013923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1966  ABC-2 type transporter  27.08 
 
 		 318 aa  90.5  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.115517  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>