260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1684 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1684  ABC-2 type transporter  100 
 
 
251 aa  499  1e-140  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3239  ABC transporter efflux permease  69.32 
 
 
249 aa  362  3e-99  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3492  ABC transporter permease  69.32 
 
 
249 aa  362  3e-99  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.799548  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3453  ABC transporter, efflux permease protein  69.32 
 
 
249 aa  362  3e-99  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3149  ABC transporter efflux permease; daunorubicin resistance transmembrane protein  68.92 
 
 
249 aa  360  9e-99  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0286068  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1808  ABC transporter, efflux permease protein  69.32 
 
 
249 aa  358  3e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3467  ABC transporter, efflux permease protein  68.53 
 
 
249 aa  358  4e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000810233  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3147  ABC-2 type transporter  71.31 
 
 
249 aa  352  2.9999999999999997e-96  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.145802  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1034  ABC-2 type transporter  68.95 
 
 
254 aa  350  8.999999999999999e-96  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.489208  normal  0.0976555 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3212  ABC transporter efflux permease; daunorubicin resistance transmembrane protein  69.72 
 
 
249 aa  350  2e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3438  ABC transporter, efflux permease protein  69.32 
 
 
249 aa  346  2e-94  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8859  ABC transporter permease  69.48 
 
 
253 aa  345  4e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3446  ABC transporter, efflux permease protein  67.73 
 
 
249 aa  342  4e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00692281  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0542  ABC-2 type transporter  65.86 
 
 
253 aa  337  9.999999999999999e-92  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0959  ABC-2 type transporter  68.8 
 
 
256 aa  335  3.9999999999999995e-91  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00197586  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3016  ABC-2 type transporter  67.34 
 
 
254 aa  322  4e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.021308 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4383  ABC-2 type transporter  64.66 
 
 
253 aa  320  9.999999999999999e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.557459 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2016  ABC-2 type transporter  59.44 
 
 
268 aa  317  1e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3132  ABC-2 type transporter  63.16 
 
 
248 aa  315  7e-85  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.571081  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4874  ABC-2 type transporter  65.06 
 
 
253 aa  312  3.9999999999999997e-84  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0328295 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0674  ABC-2 type transporter  44.64 
 
 
272 aa  208  7e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.890968  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6375  ABC-2 type transporter  42.4 
 
 
247 aa  196  2.0000000000000003e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7215  ABC transporter (permease)  40.73 
 
 
247 aa  191  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.284415 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4081  ABC-2 type transporter  42.5 
 
 
274 aa  190  2e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.431533 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4761  ABC-2 type transporter  40.25 
 
 
261 aa  189  5e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000109025  hitchhiker  0.000621886 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8873  ABC-2 type transporter  38.8 
 
 
270 aa  187  2e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.53633  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0375  ABC-2 type transporter  39.84 
 
 
264 aa  187  2e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.133292  hitchhiker  0.00534901 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0213  ABC transporter permease  44.21 
 
 
257 aa  184  8e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5588  ABC-2 type transporter  40.64 
 
 
261 aa  181  7e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2065  ABC-2 type transporter  42.97 
 
 
254 aa  181  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0058  ABC-2 type transporter  36.33 
 
 
271 aa  181  1e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4190  ABC-2 type transporter  42.97 
 
 
257 aa  177  2e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1473  hypothetical protein  38.93 
 
 
269 aa  164  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.377134  normal  0.24112 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4992  ABC-2 type transporter  35.25 
 
 
270 aa  162  5.0000000000000005e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.402209  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0918  ABC-2 type transporter  37.65 
 
 
254 aa  159  3e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1189  ABC-2 type transporter  41.96 
 
 
263 aa  155  7e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  unclonable  0.00000916915 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2086  ABC-2 type transporter  39.69 
 
 
267 aa  150  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1839  ABC-2 type transporter  35.97 
 
 
266 aa  144  1e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00340  ABC-type multidrug transport system, permease component  35.08 
 
 
259 aa  144  2e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.15345 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5259  ABC-2 type transporter  34.66 
 
 
277 aa  143  3e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0666  ABC-2 type transporter  31.42 
 
 
285 aa  138  8.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0042  ABC-2 type transporter  35.04 
 
 
266 aa  136  2e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0538  ABC-2 type transporter  33.07 
 
 
267 aa  135  6.0000000000000005e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.690834  hitchhiker  0.000010786 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2363  ABC-2 type transporter  43.59 
 
 
267 aa  135  8e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0153945  hitchhiker  0.00708379 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35420  ABC-type multidrug transport system, permease component  32.67 
 
 
257 aa  133  3e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0340  ABC-2 type transporter  34.26 
 
 
273 aa  132  3.9999999999999996e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.171685  hitchhiker  0.00234396 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0937  ABC-2 type transporter  31.52 
 
 
269 aa  132  6.999999999999999e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1384  ABC-2 type transporter  34.26 
 
 
269 aa  131  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.78336  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0287  ABC-2 type transporter  39.27 
 
 
284 aa  131  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1351  ABC-2 type transporter  34.27 
 
 
272 aa  130  2.0000000000000002e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0414359  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30730  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  34.8 
 
 
277 aa  130  3e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.364162  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6787  ABC-2 type transporter  32.53 
 
 
268 aa  127  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000212784  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23570  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  29.48 
 
 
267 aa  125  7e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.24456  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1483  ABC-2 type transporter  31.25 
 
 
269 aa  123  3e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00140227  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1122  ABC-2 type transporter  31.35 
 
 
285 aa  123  3e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.408605  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0746  ABC-2 type transporter  32.78 
 
 
280 aa  122  4e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19160  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  33.47 
 
 
319 aa  122  5e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.338631 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2897  ABC-2 type transporter  34.26 
 
 
274 aa  121  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.643507  normal  0.323486 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4551  ABC-2 type transporter  31.87 
 
 
264 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.442888  normal  0.0220595 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4183  ABC-2 type transporter  31.1 
 
 
269 aa  120  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.013923  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3103  ABC transporter protein  31.33 
 
 
280 aa  119  3e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00849207 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3922  ABC-2 type transporter  32.95 
 
 
266 aa  119  3e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0348636  normal  0.0335688 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1878  ABC-2 type transporter  35.46 
 
 
273 aa  118  7e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1937  ABC-2 type transporter  31.06 
 
 
284 aa  119  7e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.008119  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4092  ABC-2 type transporter  31.4 
 
 
290 aa  118  9e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0130357  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0451  ABC-type multidrug transport system, permease component  31.86 
 
 
269 aa  117  9.999999999999999e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0034336  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4056  ABC-2 type transporter  32.23 
 
 
267 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1476  ABC-2 type transporter  31.52 
 
 
267 aa  117  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1697  ABC-2 type transporter  29.6 
 
 
271 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4023  ABC-2 type transporter  32.23 
 
 
267 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.293949  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3916  ABC transporter, inner membrane subunit  32.23 
 
 
267 aa  116  3e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2716  ABC-2 type transporter  29.2 
 
 
254 aa  117  3e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4512  ABC-2 type transporter  31.78 
 
 
281 aa  116  3.9999999999999997e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2294  ABC-2 type transporter  31.54 
 
 
277 aa  116  3.9999999999999997e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.911135  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3328  ABC-2 type transporter  31.25 
 
 
281 aa  115  6e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.45338  normal  0.334159 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4259  ABC-2 type transporter  31.68 
 
 
282 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.573247  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4345  ABC-2 type transporter  31.68 
 
 
282 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0911686 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4795  ABC-2 type transporter  30.3 
 
 
284 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.597944 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4638  ABC-2 type transporter  31.68 
 
 
282 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.619797  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4656  ABC-2 type transporter  30.68 
 
 
285 aa  114  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.890125  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0598  ABC-2 type transporter  35.32 
 
 
277 aa  114  2.0000000000000002e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1622  ABC-2 type transporter  32.91 
 
 
278 aa  113  3e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4936  ABC-2 type transporter  33.64 
 
 
280 aa  112  4.0000000000000004e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.707728  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1236  ABC-2 type transporter  32.92 
 
 
281 aa  112  4.0000000000000004e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2775  ABC-2 type transporter  29.39 
 
 
278 aa  112  5e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00783625  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8158  ABC-2 type transporter  27.63 
 
 
272 aa  112  7.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.880228 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0393  ABC-2 type transporter  30.12 
 
 
274 aa  112  8.000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22030  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  31.94 
 
 
281 aa  111  9e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39010  ABC-type multidrug transport system, permease component  31.98 
 
 
271 aa  111  1.0000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.436846 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24940  ABC-type multidrug transport system, permease component  28.74 
 
 
284 aa  111  1.0000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.484855 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2939  ABC-2 type transporter  31.16 
 
 
286 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.27677 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6250  ABC-2 type transporter  33.18 
 
 
285 aa  110  3e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.243116  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1683  ABC-2 type transporter  30.31 
 
 
274 aa  109  5e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000181652  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1352  ABC-2 type transporter  30.58 
 
 
254 aa  109  5e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.137638  normal  0.090478 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1504  ABC-2 type transporter  28.4 
 
 
272 aa  108  9.000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.457097  normal  0.179064 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5718  ABC-2 type transporter  31.89 
 
 
263 aa  107  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3101  ABC-2 type transporter  34.68 
 
 
266 aa  108  1e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2021  hypothetical protein  34.45 
 
 
289 aa  107  2e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.290119  normal  0.988573 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1966  ABC-2 type transporter  32.65 
 
 
318 aa  107  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.115517  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4188  hypothetical protein  46.96 
 
 
214 aa  106  4e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00904545  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>