More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0393 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_0393  ABC-2 type transporter  100 
 
 
274 aa  544  1e-154  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1122  ABC-2 type transporter  76.28 
 
 
285 aa  414  9.999999999999999e-116  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.408605  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3103  ABC transporter protein  76.32 
 
 
280 aa  397  1e-109  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00849207 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4656  ABC-2 type transporter  71.76 
 
 
285 aa  377  1e-104  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.890125  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6250  ABC-2 type transporter  72.36 
 
 
285 aa  362  3e-99  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.243116  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2021  hypothetical protein  70.8 
 
 
289 aa  362  3e-99  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.290119  normal  0.988573 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3893  ABC-2 type transporter  73.14 
 
 
242 aa  358  7e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0012751  normal  0.0102027 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0042  ABC-2 type transporter  58.14 
 
 
266 aa  320  1.9999999999999998e-86  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1351  ABC-2 type transporter  62.06 
 
 
272 aa  318  7.999999999999999e-86  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0414359  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1622  ABC-2 type transporter  58.04 
 
 
278 aa  317  1e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1697  ABC-2 type transporter  57.25 
 
 
271 aa  309  4e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22030  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  65.76 
 
 
281 aa  301  5.000000000000001e-81  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30730  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  47.96 
 
 
277 aa  252  5.000000000000001e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.364162  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1504  ABC-2 type transporter  42.07 
 
 
272 aa  241  6e-63  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.457097  normal  0.179064 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3328  ABC-2 type transporter  43.96 
 
 
281 aa  216  2.9999999999999998e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.45338  normal  0.334159 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1236  ABC-2 type transporter  44.53 
 
 
281 aa  216  5e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5259  ABC-2 type transporter  41.89 
 
 
277 aa  214  9.999999999999999e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0451  ABC-type multidrug transport system, permease component  41.63 
 
 
269 aa  213  1.9999999999999998e-54  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0034336  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1966  ABC-2 type transporter  44.94 
 
 
318 aa  212  5.999999999999999e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.115517  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0746  ABC-2 type transporter  40.96 
 
 
280 aa  211  7.999999999999999e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3253  ABC transporter related  43.55 
 
 
265 aa  211  7.999999999999999e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00665342  normal  0.245763 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4023  ABC-2 type transporter  41.37 
 
 
267 aa  211  1e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.293949  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4056  ABC-2 type transporter  41.37 
 
 
267 aa  211  1e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3916  ABC transporter, inner membrane subunit  41.37 
 
 
267 aa  209  4e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1384  ABC-2 type transporter  42 
 
 
269 aa  206  3e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.78336  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4936  ABC-2 type transporter  40.71 
 
 
280 aa  204  1e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.707728  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2294  ABC-2 type transporter  41.48 
 
 
277 aa  202  3e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.911135  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2897  ABC-2 type transporter  43.35 
 
 
274 aa  200  3e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.643507  normal  0.323486 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2775  ABC-2 type transporter  41.56 
 
 
278 aa  198  7.999999999999999e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00783625  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2716  ABC-2 type transporter  42.28 
 
 
254 aa  198  9e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35420  ABC-type multidrug transport system, permease component  41.9 
 
 
257 aa  197  1.0000000000000001e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1352  ABC-2 type transporter  41.2 
 
 
254 aa  194  1e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.137638  normal  0.090478 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6787  ABC-2 type transporter  39.85 
 
 
268 aa  191  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000212784  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2939  ABC-2 type transporter  41.12 
 
 
286 aa  187  1e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.27677 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2100  ABC-2 type transporter  38.96 
 
 
267 aa  180  2e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1683  ABC-2 type transporter  39.77 
 
 
274 aa  179  5.999999999999999e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000181652  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0918  ABC-2 type transporter  37.6 
 
 
254 aa  176  4e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23570  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  34.96 
 
 
267 aa  173  3.9999999999999995e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.24456  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0538  ABC-2 type transporter  36.78 
 
 
267 aa  165  5.9999999999999996e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.690834  hitchhiker  0.000010786 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4551  ABC-2 type transporter  38.22 
 
 
264 aa  165  8e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.442888  normal  0.0220595 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0340  ABC-2 type transporter  37 
 
 
273 aa  165  1.0000000000000001e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.171685  hitchhiker  0.00234396 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0937  ABC-2 type transporter  34.6 
 
 
269 aa  160  2e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1473  hypothetical protein  38.34 
 
 
269 aa  160  2e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.377134  normal  0.24112 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1839  ABC-2 type transporter  36.76 
 
 
266 aa  158  1e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1878  ABC-2 type transporter  38.89 
 
 
273 aa  155  5.0000000000000005e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39010  ABC-type multidrug transport system, permease component  33.71 
 
 
271 aa  154  1e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.436846 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4992  ABC-2 type transporter  34.55 
 
 
270 aa  154  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.402209  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1937  ABC-2 type transporter  33.98 
 
 
284 aa  151  8.999999999999999e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.008119  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0666  ABC-2 type transporter  36.9 
 
 
285 aa  149  4e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3922  ABC-2 type transporter  33.85 
 
 
266 aa  149  6e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0348636  normal  0.0335688 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4512  ABC-2 type transporter  36.43 
 
 
281 aa  149  7e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1476  ABC-2 type transporter  36.26 
 
 
267 aa  146  4.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4259  ABC-2 type transporter  34.48 
 
 
282 aa  144  1e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.573247  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4345  ABC-2 type transporter  34.48 
 
 
282 aa  144  1e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0911686 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4638  ABC-2 type transporter  34.48 
 
 
282 aa  144  1e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.619797  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2043  ABC-2 type transporter  32.1 
 
 
279 aa  142  7e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.167343  hitchhiker  0.00685853 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07250  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  34.11 
 
 
265 aa  141  9.999999999999999e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.307058 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4092  ABC-2 type transporter  36.02 
 
 
290 aa  141  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0130357  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4795  ABC-2 type transporter  33.59 
 
 
284 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.597944 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8158  ABC-2 type transporter  32.2 
 
 
272 aa  137  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.880228 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1483  ABC-2 type transporter  34.86 
 
 
269 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00140227  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3986  ABC-2 type transporter  30.47 
 
 
280 aa  130  3e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19160  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  33.91 
 
 
319 aa  128  8.000000000000001e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.338631 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3718  ABC-2 type transporter  33.07 
 
 
260 aa  128  1.0000000000000001e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.282288  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0039  ABC-2 type transporter  33.33 
 
 
267 aa  127  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.953662 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0058  ABC-2 type transporter  30.77 
 
 
271 aa  126  5e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0542  ABC-2 type transporter  30.28 
 
 
253 aa  124  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3101  ABC-2 type transporter  33.47 
 
 
266 aa  122  6e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24940  ABC-type multidrug transport system, permease component  30.11 
 
 
284 aa  122  7e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.484855 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0674  ABC-2 type transporter  30.59 
 
 
272 aa  121  9.999999999999999e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.890968  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0895  ABC-2 type transporter  33.89 
 
 
266 aa  119  4.9999999999999996e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1034  ABC-2 type transporter  32.82 
 
 
254 aa  119  7e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.489208  normal  0.0976555 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4183  ABC-2 type transporter  32.57 
 
 
269 aa  119  7.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.013923  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8859  ABC transporter permease  31.47 
 
 
253 aa  118  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0618  ABC-2 type transporter  31.23 
 
 
267 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.099686  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4383  ABC-2 type transporter  33.59 
 
 
253 aa  117  3e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.557459 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7215  ABC transporter (permease)  29.67 
 
 
247 aa  115  6e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.284415 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2016  ABC-2 type transporter  31.25 
 
 
268 aa  114  2.0000000000000002e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18340  ABC-type multidrug transport system, permease component  34.38 
 
 
282 aa  114  2.0000000000000002e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.823039 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4674  ABC-2 type transporter  35.98 
 
 
276 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.348942  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4106  ABC-2 type transporter  34.31 
 
 
293 aa  110  2.0000000000000002e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1123  ABC-2 type transporter  36.21 
 
 
275 aa  110  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0375  ABC-2 type transporter  29.08 
 
 
264 aa  110  3e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.133292  hitchhiker  0.00534901 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4081  ABC-2 type transporter  31.02 
 
 
274 aa  108  8.000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.431533 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0959  ABC-2 type transporter  28.4 
 
 
256 aa  108  1e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00197586  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1743  ABC-2 type transporter  33.67 
 
 
271 aa  108  1e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000246748 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3132  ABC-2 type transporter  33.64 
 
 
248 aa  107  2e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.571081  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4874  ABC-2 type transporter  31.03 
 
 
253 aa  107  3e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0328295 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1525  ABC-2 type transporter  32.46 
 
 
290 aa  106  4e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00118323  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3467  ABC transporter, efflux permease protein  28.1 
 
 
249 aa  106  4e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000810233  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3149  ABC transporter efflux permease; daunorubicin resistance transmembrane protein  28.1 
 
 
249 aa  105  6e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0286068  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3438  ABC transporter, efflux permease protein  28.45 
 
 
249 aa  105  6e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1684  ABC-2 type transporter  31.23 
 
 
251 aa  105  9e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5654  ABC-2 type transporter  32.3 
 
 
267 aa  104  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3239  ABC transporter efflux permease  28.1 
 
 
249 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3492  ABC transporter permease  28.1 
 
 
249 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.799548  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1808  ABC transporter, efflux permease protein  27.62 
 
 
249 aa  104  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3453  ABC transporter, efflux permease protein  28.1 
 
 
249 aa  105  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3446  ABC transporter, efflux permease protein  28.45 
 
 
249 aa  104  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00692281  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3147  ABC-2 type transporter  28.03 
 
 
249 aa  104  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.145802  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>