249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0959 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0959  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 256 aa  507  1e-143  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00197586  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1034  ABC-2 type transporter  74.61 
 
 		 254 aa  375  1e-103  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.489208  normal  0.0976555 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8859  ABC transporter permease  72.66 
 
 		 253 aa  357  9.999999999999999e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0542  ABC-2 type transporter  68.75 
 
 		 253 aa  350  1e-95  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3016  ABC-2 type transporter  73.23 
 
 		 254 aa  342  4e-93  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.021308 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4383  ABC-2 type transporter  69.02 
 
 		 253 aa  339  2.9999999999999998e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.557459 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4874  ABC-2 type transporter  70.59 
 
 		 253 aa  331  8e-90  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0328295 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2016  ABC-2 type transporter  65.6 
 
 		 268 aa  328  6e-89  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3467  ABC transporter, efflux permease protein  66.27 
 
 		 249 aa  327  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000810233  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3149  ABC transporter efflux permease; daunorubicin resistance transmembrane protein  65.86 
 
 		 249 aa  326  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0286068  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3239  ABC transporter efflux permease  65.06 
 
 		 249 aa  323  2e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3492  ABC transporter permease  65.06 
 
 		 249 aa  323  2e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.799548  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3453  ABC transporter, efflux permease protein  65.06 
 
 		 249 aa  323  2e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1808  ABC transporter, efflux permease protein  65.86 
 
 		 249 aa  323  2e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3147  ABC-2 type transporter  67.47 
 
 		 249 aa  317  7.999999999999999e-86  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.145802  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3438  ABC transporter, efflux permease protein  65.86 
 
 		 249 aa  315  4e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3212  ABC transporter efflux permease; daunorubicin resistance transmembrane protein  65.46 
 
 		 249 aa  315  5e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3446  ABC transporter, efflux permease protein  64.66 
 
 		 249 aa  311  4.999999999999999e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00692281  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1684  ABC-2 type transporter  68.8 
 
 		 251 aa  308  4e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3132  ABC-2 type transporter  61.69 
 
 		 248 aa  296  3e-79  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.571081  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0674  ABC-2 type transporter  44.53 
 
 		 272 aa  209  3e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.890968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0375  ABC-2 type transporter  42.86 
 
 		 264 aa  191  8e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.133292  hitchhiker  0.00534901 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7215  ABC transporter (permease)  40.96 
 
 		 247 aa  190  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.284415 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2065  ABC-2 type transporter  44.4 
 
 		 254 aa  189  5e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0058  ABC-2 type transporter  38.28 
 
 		 271 aa  188  7e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4081  ABC-2 type transporter  42.08 
 
 		 274 aa  184  1.0000000000000001e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.431533 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6375  ABC-2 type transporter  39.52 
 
 		 247 aa  184  1.0000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4190  ABC-2 type transporter  42.86 
 
 		 257 aa  180  2e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5588  ABC-2 type transporter  39.53 
 
 		 261 aa  177  2e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0213  ABC transporter permease  41.5 
 
 		 257 aa  174  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4761  ABC-2 type transporter  38.46 
 
 		 261 aa  174  1.9999999999999998e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000109025  hitchhiker  0.000621886 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8873  ABC-2 type transporter  37.65 
 
 		 270 aa  172  3.9999999999999995e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.53633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1189  ABC-2 type transporter  44.25 
 
 		 263 aa  164  9e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000916915 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1473  hypothetical protein  38.52 
 
 		 269 aa  162  5.0000000000000005e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.377134  normal  0.24112 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4992  ABC-2 type transporter  35.02 
 
 		 270 aa  157  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.402209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5259  ABC-2 type transporter  36.44 
 
 		 277 aa  146  3e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0340  ABC-2 type transporter  37.8 
 
 		 273 aa  143  3e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.171685  hitchhiker  0.00234396 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0918  ABC-2 type transporter  36.51 
 
 		 254 aa  141  9.999999999999999e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35420  ABC-type multidrug transport system, permease component  33.47 
 
 		 257 aa  140  1.9999999999999998e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2086  ABC-2 type transporter  36.92 
 
 		 267 aa  137  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1839  ABC-2 type transporter  34.47 
 
 		 266 aa  135  8e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1384  ABC-2 type transporter  35.06 
 
 		 269 aa  135  8e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.78336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23570  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  34.98 
 
 		 267 aa  134  9.999999999999999e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.24456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00340  ABC-type multidrug transport system, permease component  32.22 
 
 		 259 aa  132  5e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.15345 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0538  ABC-2 type transporter  33.18 
 
 		 267 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.690834  hitchhiker  0.000010786 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0666  ABC-2 type transporter  34.4 
 
 		 285 aa  127  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4551  ABC-2 type transporter  34.9 
 
 		 264 aa  126  3e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.442888  normal  0.0220595 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2363  ABC-2 type transporter  42.21 
 
 		 267 aa  126  4.0000000000000003e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0153945  hitchhiker  0.00708379 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0287  ABC-2 type transporter  39.31 
 
 		 284 aa  121  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0746  ABC-2 type transporter  32.23 
 
 		 280 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30730  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  33.07 
 
 		 277 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.364162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1483  ABC-2 type transporter  30.14 
 
 		 269 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00140227  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4183  ABC-2 type transporter  32.05 
 
 		 269 aa  119  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.013923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0937  ABC-2 type transporter  33.33 
 
 		 269 aa  120  3e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1878  ABC-2 type transporter  36.97 
 
 		 273 aa  119  3.9999999999999996e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0042  ABC-2 type transporter  31.4 
 
 		 266 aa  119  6e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3718  ABC-2 type transporter  28.74 
 
 		 260 aa  118  7.999999999999999e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.282288  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1476  ABC-2 type transporter  32.7 
 
 		 267 aa  118  7.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2775  ABC-2 type transporter  31.69 
 
 		 278 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00783625  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8158  ABC-2 type transporter  30.89 
 
 		 272 aa  118  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.880228 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1122  ABC-2 type transporter  31.13 
 
 		 285 aa  117  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.408605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6787  ABC-2 type transporter  31.47 
 
 		 268 aa  116  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000212784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4936  ABC-2 type transporter  35.75 
 
 		 280 aa  116  3e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.707728  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3986  ABC-2 type transporter  31.33 
 
 		 280 aa  114  2.0000000000000002e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1258  ABC-2 type transporter  32.32 
 
 		 300 aa  113  3e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4092  ABC-2 type transporter  28.46 
 
 		 290 aa  112  5e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0130357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24940  ABC-type multidrug transport system, permease component  29.84 
 
 		 284 aa  112  6e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.484855 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22030  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  31.02 
 
 		 281 aa  112  7.000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1697  ABC-2 type transporter  29.02 
 
 		 271 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0598  ABC-2 type transporter  33.89 
 
 		 277 aa  111  1.0000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2716  ABC-2 type transporter  31.2 
 
 		 254 aa  110  2.0000000000000002e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3103  ABC transporter protein  29.64 
 
 		 280 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00849207 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3922  ABC-2 type transporter  33.65 
 
 		 266 aa  110  2.0000000000000002e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0348636  normal  0.0335688 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2897  ABC-2 type transporter  31.6 
 
 		 274 aa  109  3e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.643507  normal  0.323486 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2939  ABC-2 type transporter  32.52 
 
 		 286 aa  109  4.0000000000000004e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.27677 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2294  ABC-2 type transporter  29.05 
 
 		 277 aa  108  6e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.911135  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1966  ABC-2 type transporter  30.99 
 
 		 318 aa  108  6e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.115517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39010  ABC-type multidrug transport system, permease component  33.48 
 
 		 271 aa  107  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.436846 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1351  ABC-2 type transporter  30.29 
 
 		 272 aa  107  2e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0414359  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1236  ABC-2 type transporter  33.18 
 
 		 281 aa  106  4e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1937  ABC-2 type transporter  30.41 
 
 		 284 aa  105  5e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.008119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19160  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  28.57 
 
 		 319 aa  105  7e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.338631 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0393  ABC-2 type transporter  28.4 
 
 		 274 aa  105  8e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3328  ABC-2 type transporter  32.71 
 
 		 281 aa  104  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.45338  normal  0.334159 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1743  ABC-2 type transporter  30.45 
 
 		 271 aa  104  1e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000246748 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4512  ABC-2 type transporter  28.52 
 
 		 281 aa  103  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6250  ABC-2 type transporter  29.48 
 
 		 285 aa  104  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.243116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4056  ABC-2 type transporter  28.57 
 
 		 267 aa  103  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4023  ABC-2 type transporter  28.57 
 
 		 267 aa  103  3e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.293949  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1352  ABC-2 type transporter  31.02 
 
 		 254 aa  102  4e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.137638  normal  0.090478 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1622  ABC-2 type transporter  30.14 
 
 		 278 aa  102  4e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3916  ABC transporter, inner membrane subunit  28.16 
 
 		 267 aa  102  8e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3101  ABC-2 type transporter  29.55 
 
 		 266 aa  101  1e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07250  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  30.53 
 
 		 265 aa  101  1e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.307058 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4795  ABC-2 type transporter  31.34 
 
 		 284 aa  100  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597944 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4259  ABC-2 type transporter  31.34 
 
 		 282 aa  99.8  4e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.573247  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4345  ABC-2 type transporter  31.34 
 
 		 282 aa  99.8  4e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0911686 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4638  ABC-2 type transporter  31.34 
 
 		 282 aa  99.8  4e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.619797  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1525  ABC-2 type transporter  32.56 
 
 		 290 aa  99  7e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00118323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5081  ABC transporter related protein  29.73 
 
 		 260 aa  98.6  9e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.630665  normal  0.675914 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>