193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0598 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0598  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 277 aa  545  1e-154  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5588  ABC-2 type transporter  42.08 
 
 		 261 aa  204  1e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0213  ABC transporter permease  42.74 
 
 		 257 aa  201  8e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8873  ABC-2 type transporter  41.98 
 
 		 270 aa  194  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.53633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0375  ABC-2 type transporter  40.65 
 
 		 264 aa  191  1e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.133292  hitchhiker  0.00534901 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1189  ABC-2 type transporter  42.98 
 
 		 263 aa  181  2e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000916915 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6375  ABC-2 type transporter  38.58 
 
 		 247 aa  176  4e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2086  ABC-2 type transporter  44.35 
 
 		 267 aa  165  6.9999999999999995e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2016  ABC-2 type transporter  38.72 
 
 		 268 aa  158  8e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2065  ABC-2 type transporter  37.19 
 
 		 254 aa  156  3e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4081  ABC-2 type transporter  35.89 
 
 		 274 aa  152  5.9999999999999996e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.431533 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0058  ABC-2 type transporter  34.27 
 
 		 271 aa  151  1e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8859  ABC transporter permease  38.52 
 
 		 253 aa  150  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0542  ABC-2 type transporter  35.02 
 
 		 253 aa  147  2.0000000000000003e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1034  ABC-2 type transporter  35.8 
 
 		 254 aa  147  2.0000000000000003e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.489208  normal  0.0976555 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0674  ABC-2 type transporter  34.91 
 
 		 272 aa  145  5e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.890968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3132  ABC-2 type transporter  34.78 
 
 		 248 aa  145  9e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.571081  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3239  ABC transporter efflux permease  34.51 
 
 		 249 aa  142  6e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3492  ABC transporter permease  34.51 
 
 		 249 aa  142  6e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.799548  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4383  ABC-2 type transporter  36.82 
 
 		 253 aa  142  6e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.557459 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3453  ABC transporter, efflux permease protein  34.51 
 
 		 249 aa  142  6e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4761  ABC-2 type transporter  35.22 
 
 		 261 aa  142  7e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000109025  hitchhiker  0.000621886 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3149  ABC transporter efflux permease; daunorubicin resistance transmembrane protein  34.12 
 
 		 249 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0286068  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3467  ABC transporter, efflux permease protein  33.73 
 
 		 249 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000810233  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1808  ABC transporter, efflux permease protein  34.51 
 
 		 249 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0959  ABC-2 type transporter  33.47 
 
 		 256 aa  140  3e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00197586  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2363  ABC-2 type transporter  33.58 
 
 		 267 aa  138  8.999999999999999e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0153945  hitchhiker  0.00708379 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3438  ABC transporter, efflux permease protein  34.9 
 
 		 249 aa  138  1e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3446  ABC transporter, efflux permease protein  34.9 
 
 		 249 aa  137  2e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00692281  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4874  ABC-2 type transporter  36.82 
 
 		 253 aa  137  2e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0328295 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3147  ABC-2 type transporter  35.32 
 
 		 249 aa  137  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.145802  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3212  ABC transporter efflux permease; daunorubicin resistance transmembrane protein  34.9 
 
 		 249 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0287  ABC-2 type transporter  40.3 
 
 		 284 aa  136  4e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7215  ABC transporter (permease)  33.33 
 
 		 247 aa  136  4e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.284415 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1684  ABC-2 type transporter  35.32 
 
 		 251 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3016  ABC-2 type transporter  37.13 
 
 		 254 aa  132  6.999999999999999e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.021308 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4190  ABC-2 type transporter  36.86 
 
 		 257 aa  131  9e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0918  ABC-2 type transporter  30.89 
 
 		 254 aa  123  4e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4992  ABC-2 type transporter  30.45 
 
 		 270 aa  115  5e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.402209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1473  hypothetical protein  31.12 
 
 		 269 aa  112  8.000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.377134  normal  0.24112 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0538  ABC-2 type transporter  28.26 
 
 		 267 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.690834  hitchhiker  0.000010786 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3103  ABC transporter protein  30.5 
 
 		 280 aa  110  3e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00849207 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0937  ABC-2 type transporter  28.68 
 
 		 269 aa  109  6e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1384  ABC-2 type transporter  31.15 
 
 		 269 aa  108  7.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.78336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4183  ABC-2 type transporter  32.16 
 
 		 269 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.013923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5259  ABC-2 type transporter  32.05 
 
 		 277 aa  105  6e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2716  ABC-2 type transporter  31.36 
 
 		 254 aa  105  1e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6787  ABC-2 type transporter  30.42 
 
 		 268 aa  105  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000212784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1352  ABC-2 type transporter  30.29 
 
 		 254 aa  104  2e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.137638  normal  0.090478 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24940  ABC-type multidrug transport system, permease component  29.74 
 
 		 284 aa  102  5e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.484855 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2294  ABC-2 type transporter  32.86 
 
 		 277 aa  101  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.911135  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1937  ABC-2 type transporter  29.28 
 
 		 284 aa  101  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.008119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1966  ABC-2 type transporter  29.26 
 
 		 318 aa  100  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.115517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3718  ABC-2 type transporter  28.19 
 
 		 260 aa  99.8  4e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.282288  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1122  ABC-2 type transporter  28.57 
 
 		 285 aa  99.8  4e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.408605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0451  ABC-type multidrug transport system, permease component  28.69 
 
 		 269 aa  99.4  6e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0034336  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4023  ABC-2 type transporter  29.33 
 
 		 267 aa  99  7e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.293949  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4056  ABC-2 type transporter  29.33 
 
 		 267 aa  99  7e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1236  ABC-2 type transporter  30.47 
 
 		 281 aa  99.4  7e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30730  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  28.95 
 
 		 277 aa  98.6  9e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.364162  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3916  ABC transporter, inner membrane subunit  29.33 
 
 		 267 aa  98.2  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0340  ABC-2 type transporter  28.07 
 
 		 273 aa  98.6  1e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.171685  hitchhiker  0.00234396 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4512  ABC-2 type transporter  30.18 
 
 		 281 aa  98.2  1e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3922  ABC-2 type transporter  29.46 
 
 		 266 aa  98.2  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0348636  normal  0.0335688 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3253  ABC transporter related  29.83 
 
 		 265 aa  97.4  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00665342  normal  0.245763 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4551  ABC-2 type transporter  31.89 
 
 		 264 aa  97.4  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.442888  normal  0.0220595 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1839  ABC-2 type transporter  28.77 
 
 		 266 aa  96.7  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1697  ABC-2 type transporter  28.4 
 
 		 271 aa  96.3  4e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4259  ABC-2 type transporter  29.33 
 
 		 282 aa  96.7  4e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.573247  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4345  ABC-2 type transporter  29.33 
 
 		 282 aa  96.7  4e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0911686 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4638  ABC-2 type transporter  29.33 
 
 		 282 aa  96.7  4e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.619797  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4795  ABC-2 type transporter  29.73 
 
 		 284 aa  96.3  5e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597944 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3328  ABC-2 type transporter  33.18 
 
 		 281 aa  95.1  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.45338  normal  0.334159 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2939  ABC-2 type transporter  28.18 
 
 		 286 aa  93.6  3e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.27677 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0666  ABC-2 type transporter  29.91 
 
 		 285 aa  93.2  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4656  ABC-2 type transporter  28.17 
 
 		 285 aa  93.2  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.890125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1622  ABC-2 type transporter  25.6 
 
 		 278 aa  93.2  4e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0042  ABC-2 type transporter  27.23 
 
 		 266 aa  92  9e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2897  ABC-2 type transporter  28.69 
 
 		 274 aa  91.7  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.643507  normal  0.323486 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0895  ABC-2 type transporter  31.74 
 
 		 266 aa  91.3  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23570  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  29.83 
 
 		 267 aa  91.3  1e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.24456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00340  ABC-type multidrug transport system, permease component  27.66 
 
 		 259 aa  91.3  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.15345 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4936  ABC-2 type transporter  27.27 
 
 		 280 aa  90.9  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.707728  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07250  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  29.04 
 
 		 265 aa  90.1  3e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.307058 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0393  ABC-2 type transporter  28.19 
 
 		 274 aa  90.1  3e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8158  ABC-2 type transporter  29.78 
 
 		 272 aa  90.1  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.880228 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1351  ABC-2 type transporter  28.51 
 
 		 272 aa  88.2  1e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0414359  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22030  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  28.76 
 
 		 281 aa  87  3e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4092  ABC-2 type transporter  24.89 
 
 		 290 aa  87.4  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0130357  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3986  ABC-2 type transporter  27.65 
 
 		 280 aa  86.7  4e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0746  ABC-2 type transporter  26.77 
 
 		 280 aa  85.9  7e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35420  ABC-type multidrug transport system, permease component  30.7 
 
 		 257 aa  85.5  8e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1258  ABC-2 type transporter  28.57 
 
 		 300 aa  84.3  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1476  ABC-2 type transporter  27.39 
 
 		 267 aa  83.2  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2775  ABC-2 type transporter  25.82 
 
 		 278 aa  82.8  0.000000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00783625  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5718  ABC-2 type transporter  27.07 
 
 		 263 aa  82.4  0.000000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0618  ABC-2 type transporter  27.27 
 
 		 267 aa  82.4  0.000000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.099686  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3121  multidrug ABC transporter inner membrane protein  34.09 
 
 		 274 aa  82  0.000000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.656441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6250  ABC-2 type transporter  29.15 
 
 		 285 aa  81.6  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.243116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19160  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  26.2 
 
 		 319 aa  81.6  0.00000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.338631 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>