157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3121 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_3121  multidrug ABC transporter inner membrane protein  100 
 
 
274 aa  543  1e-153  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.656441  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3388  ABC-2 type transporter  85.5 
 
 
282 aa  444  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.264053 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2830  ABC transporter, DrrB efflux protein  51.92 
 
 
269 aa  289  4e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.578929  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2874  multidrug ABC transporter inner membrane protein  51.92 
 
 
269 aa  289  4e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.189586 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2859  multidrug ABC transporter inner membrane protein  51.92 
 
 
269 aa  289  4e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.464408  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12951  daunorubicin-dim-transport integral membrane protein ABC transporter drrB  45.83 
 
 
289 aa  227  1e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3736  ABC-2 type transporter  39.08 
 
 
263 aa  161  1e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4328  ABC-2 type transporter  34.36 
 
 
259 aa  124  2e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0654  ABC-2 type transporter  32.45 
 
 
270 aa  119  7e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.122619  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3106  ABC-2 type transporter  38.22 
 
 
229 aa  103  3e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3166  ABC-2 type transporter  38.22 
 
 
245 aa  103  3e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.591825 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0340  ABC-2 type transporter  33.85 
 
 
273 aa  100  3e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.171685  hitchhiker  0.00234396 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1755  ABC-2 type transporter  33.7 
 
 
264 aa  94.7  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.586856  decreased coverage  0.00328589 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0666  ABC-2 type transporter  28.81 
 
 
285 aa  91.3  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7215  ABC transporter (permease)  32.24 
 
 
247 aa  90.1  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.284415 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1122  ABC-2 type transporter  29.41 
 
 
285 aa  85.9  7e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.408605  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2716  ABC-2 type transporter  28.08 
 
 
254 aa  85.1  0.000000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0674  ABC-2 type transporter  28.81 
 
 
272 aa  82.4  0.000000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.890968  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1473  hypothetical protein  30.15 
 
 
269 aa  81.6  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.377134  normal  0.24112 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3132  ABC-2 type transporter  28.91 
 
 
248 aa  77.8  0.0000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.571081  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4081  ABC-2 type transporter  29.61 
 
 
274 aa  77.8  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.431533 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4023  ABC-2 type transporter  28.57 
 
 
267 aa  76.6  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.293949  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4056  ABC-2 type transporter  28.57 
 
 
267 aa  76.6  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1937  ABC-2 type transporter  28.23 
 
 
284 aa  75.9  0.0000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.008119  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4992  ABC-2 type transporter  26.76 
 
 
270 aa  75.9  0.0000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.402209  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3916  ABC transporter, inner membrane subunit  28.57 
 
 
267 aa  75.5  0.0000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23570  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  26.69 
 
 
267 aa  75.5  0.0000000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.24456  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0058  ABC-2 type transporter  28.92 
 
 
271 aa  75.1  0.000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3253  ABC transporter related  25.62 
 
 
265 aa  73.9  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00665342  normal  0.245763 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0375  ABC-2 type transporter  27.8 
 
 
264 aa  73.2  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.133292  hitchhiker  0.00534901 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4656  ABC-2 type transporter  30.46 
 
 
285 aa  73.2  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.890125  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1384  ABC-2 type transporter  27.34 
 
 
269 aa  73.2  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.78336  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0393  ABC-2 type transporter  28.45 
 
 
274 aa  72.8  0.000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4512  ABC-2 type transporter  27.57 
 
 
281 aa  72.4  0.000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4795  ABC-2 type transporter  28.74 
 
 
284 aa  72.4  0.000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.597944 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1839  ABC-2 type transporter  27.46 
 
 
266 aa  72.4  0.000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2829  daunorubicin resistance protein C  26.77 
 
 
287 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.212712  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2873  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit C  26.77 
 
 
287 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.716211  normal  0.118774 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2858  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit C  26.77 
 
 
287 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.375686  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0042  ABC-2 type transporter  26.74 
 
 
266 aa  71.2  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0918  ABC-2 type transporter  29.63 
 
 
254 aa  72  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2016  ABC-2 type transporter  29.95 
 
 
268 aa  71.2  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3328  ABC-2 type transporter  27.64 
 
 
281 aa  71.2  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.45338  normal  0.334159 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30730  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  25.9 
 
 
277 aa  70.5  0.00000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.364162  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4183  ABC-2 type transporter  27.37 
 
 
269 aa  70.5  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.013923  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4259  ABC-2 type transporter  28.57 
 
 
282 aa  70.1  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.573247  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4345  ABC-2 type transporter  28.57 
 
 
282 aa  70.1  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0911686 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4638  ABC-2 type transporter  28.57 
 
 
282 aa  70.1  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.619797  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1352  ABC-2 type transporter  26.34 
 
 
254 aa  69.3  0.00000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.137638  normal  0.090478 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1683  ABC-2 type transporter  28.99 
 
 
274 aa  68.6  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000181652  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3103  ABC transporter protein  28.21 
 
 
280 aa  68.2  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00849207 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1351  ABC-2 type transporter  26.26 
 
 
272 aa  67.8  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0414359  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1622  ABC-2 type transporter  25.95 
 
 
278 aa  68.2  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0598  ABC-2 type transporter  34.52 
 
 
277 aa  68.2  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2775  ABC-2 type transporter  29.24 
 
 
278 aa  66.6  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00783625  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0959  ABC-2 type transporter  27.27 
 
 
256 aa  66.6  0.0000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00197586  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5259  ABC-2 type transporter  25 
 
 
277 aa  66.6  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6787  ABC-2 type transporter  30.49 
 
 
268 aa  66.2  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000212784  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3737  ABC-2 type transporter  25.48 
 
 
294 aa  66.2  0.0000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2897  ABC-2 type transporter  30.23 
 
 
274 aa  66.2  0.0000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.643507  normal  0.323486 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3387  multidrug ABC transporter inner membrane protein  28.51 
 
 
281 aa  65.5  0.0000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.169242 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3922  ABC-2 type transporter  27.03 
 
 
266 aa  65.5  0.0000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0348636  normal  0.0335688 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1697  ABC-2 type transporter  23.84 
 
 
271 aa  64.7  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3893  ABC-2 type transporter  28.74 
 
 
242 aa  64.3  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0012751  normal  0.0102027 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0538  ABC-2 type transporter  26.52 
 
 
267 aa  64.3  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.690834  hitchhiker  0.000010786 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12952  daunorubicin-dim-transport integral membrane protein ABC transporter drrC  27.39 
 
 
276 aa  63.9  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0895  ABC-2 type transporter  27.55 
 
 
266 aa  63.2  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2294  ABC-2 type transporter  29.89 
 
 
277 aa  62.8  0.000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.911135  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00340  ABC-type multidrug transport system, permease component  29.76 
 
 
259 aa  62.8  0.000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.15345 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3467  ABC transporter, efflux permease protein  26.34 
 
 
249 aa  62.4  0.000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000810233  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3149  ABC transporter efflux permease; daunorubicin resistance transmembrane protein  26.7 
 
 
249 aa  62  0.000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0286068  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5718  ABC-2 type transporter  29.28 
 
 
263 aa  62.4  0.000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2021  hypothetical protein  26.79 
 
 
289 aa  61.6  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.290119  normal  0.988573 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3120  multidrug ABC transporter inner membrane protein  30.49 
 
 
284 aa  62  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.561291  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35420  ABC-type multidrug transport system, permease component  24.91 
 
 
257 aa  61.6  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0451  ABC-type multidrug transport system, permease component  22.03 
 
 
269 aa  60.8  0.00000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0034336  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6250  ABC-2 type transporter  28.57 
 
 
285 aa  60.8  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.243116  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2939  ABC-2 type transporter  28.32 
 
 
286 aa  60.8  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.27677 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22030  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  27.18 
 
 
281 aa  61.2  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1504  ABC-2 type transporter  25 
 
 
272 aa  61.2  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.457097  normal  0.179064 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8158  ABC-2 type transporter  23.85 
 
 
272 aa  60.1  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.880228 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2100  ABC-2 type transporter  26.83 
 
 
267 aa  60.5  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39010  ABC-type multidrug transport system, permease component  29.38 
 
 
271 aa  60.1  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.436846 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8873  ABC-2 type transporter  27.7 
 
 
270 aa  59.7  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.53633  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4551  ABC-2 type transporter  26.61 
 
 
264 aa  59.3  0.00000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.442888  normal  0.0220595 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0937  ABC-2 type transporter  25.51 
 
 
269 aa  59.3  0.00000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3239  ABC transporter efflux permease  26.21 
 
 
249 aa  59.3  0.00000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3492  ABC transporter permease  26.21 
 
 
249 aa  59.3  0.00000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.799548  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3453  ABC transporter, efflux permease protein  26.21 
 
 
249 aa  59.3  0.00000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1684  ABC-2 type transporter  27.8 
 
 
251 aa  59.3  0.00000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1236  ABC-2 type transporter  28.72 
 
 
281 aa  59.3  0.00000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0542  ABC-2 type transporter  24.88 
 
 
253 aa  58.9  0.00000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1878  ABC-2 type transporter  30 
 
 
273 aa  58.9  0.00000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6375  ABC-2 type transporter  25.12 
 
 
247 aa  58.5  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3718  ABC-2 type transporter  29.38 
 
 
260 aa  58.2  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.282288  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19160  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  29.21 
 
 
319 aa  57.4  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.338631 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1483  ABC-2 type transporter  23.81 
 
 
269 aa  57.8  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00140227  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1258  ABC-2 type transporter  27.03 
 
 
300 aa  57.4  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0746  ABC-2 type transporter  24.71 
 
 
280 aa  57.8  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1034  ABC-2 type transporter  25.49 
 
 
254 aa  57.4  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.489208  normal  0.0976555 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>