261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3893 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_3893  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 242 aa  484  1e-136  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0012751  normal  0.0102027 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4656  ABC-2 type transporter  93.39 
 
 		 285 aa  433  1e-120  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.890125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1122  ABC-2 type transporter  78.93 
 
 		 285 aa  397  9.999999999999999e-111  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.408605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2021  hypothetical protein  74.79 
 
 		 289 aa  362  2e-99  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.290119  normal  0.988573 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6250  ABC-2 type transporter  76.03 
 
 		 285 aa  360  1e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.243116  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0393  ABC-2 type transporter  73.14 
 
 		 274 aa  358  3e-98  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3103  ABC transporter protein  71.49 
 
 		 280 aa  347  7e-95  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00849207 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1351  ABC-2 type transporter  60.17 
 
 		 272 aa  292  4e-78  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0414359  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0042  ABC-2 type transporter  55.6 
 
 		 266 aa  283  1.0000000000000001e-75  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1697  ABC-2 type transporter  55.83 
 
 		 271 aa  283  2.0000000000000002e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1622  ABC-2 type transporter  55.19 
 
 		 278 aa  280  2e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22030  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  66.05 
 
 		 281 aa  278  6e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30730  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  50.42 
 
 		 277 aa  235  4e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.364162  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0746  ABC-2 type transporter  46.44 
 
 		 280 aa  222  4e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1504  ABC-2 type transporter  41.74 
 
 		 272 aa  219  1.9999999999999999e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.457097  normal  0.179064 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1236  ABC-2 type transporter  47.3 
 
 		 281 aa  212  3.9999999999999995e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3916  ABC transporter, inner membrane subunit  43.15 
 
 		 267 aa  211  7.999999999999999e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3328  ABC-2 type transporter  46.22 
 
 		 281 aa  210  2e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.45338  normal  0.334159 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4056  ABC-2 type transporter  42.74 
 
 		 267 aa  209  3e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4023  ABC-2 type transporter  42.74 
 
 		 267 aa  209  3e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.293949  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1966  ABC-2 type transporter  45.15 
 
 		 318 aa  206  2e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.115517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4936  ABC-2 type transporter  43.51 
 
 		 280 aa  195  4.0000000000000005e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.707728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0451  ABC-type multidrug transport system, permease component  42.32 
 
 		 269 aa  195  5.000000000000001e-49  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0034336  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5259  ABC-2 type transporter  40.5 
 
 		 277 aa  194  1e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1384  ABC-2 type transporter  39.26 
 
 		 269 aa  191  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.78336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3253  ABC transporter related  41.39 
 
 		 265 aa  187  9e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00665342  normal  0.245763 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2775  ABC-2 type transporter  39.33 
 
 		 278 aa  187  1e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00783625  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2897  ABC-2 type transporter  42.15 
 
 		 274 aa  186  3e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.643507  normal  0.323486 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2294  ABC-2 type transporter  43.03 
 
 		 277 aa  185  5e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.911135  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2939  ABC-2 type transporter  41.35 
 
 		 286 aa  179  2.9999999999999997e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.27677 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35420  ABC-type multidrug transport system, permease component  39.5 
 
 		 257 aa  176  3e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2716  ABC-2 type transporter  39.26 
 
 		 254 aa  172  2.9999999999999996e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2100  ABC-2 type transporter  40.59 
 
 		 267 aa  171  7.999999999999999e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1352  ABC-2 type transporter  39.26 
 
 		 254 aa  169  3e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.137638  normal  0.090478 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6787  ABC-2 type transporter  39.75 
 
 		 268 aa  168  8e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000212784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1683  ABC-2 type transporter  37.65 
 
 		 274 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000181652  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0918  ABC-2 type transporter  39.75 
 
 		 254 aa  157  1e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23570  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  34.71 
 
 		 267 aa  153  2e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.24456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4551  ABC-2 type transporter  36.78 
 
 		 264 aa  150  1e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.442888  normal  0.0220595 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0538  ABC-2 type transporter  36.4 
 
 		 267 aa  149  4e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.690834  hitchhiker  0.000010786 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1839  ABC-2 type transporter  36.76 
 
 		 266 aa  147  2.0000000000000003e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0666  ABC-2 type transporter  34.92 
 
 		 285 aa  146  3e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0937  ABC-2 type transporter  35.94 
 
 		 269 aa  145  4.0000000000000006e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4992  ABC-2 type transporter  34.98 
 
 		 270 aa  144  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.402209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2043  ABC-2 type transporter  32.5 
 
 		 279 aa  144  1e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.167343  hitchhiker  0.00685853 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0340  ABC-2 type transporter  37.55 
 
 		 273 aa  143  2e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.171685  hitchhiker  0.00234396 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1473  hypothetical protein  37.04 
 
 		 269 aa  139  3e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.377134  normal  0.24112 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1937  ABC-2 type transporter  33.07 
 
 		 284 aa  139  4.999999999999999e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.008119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39010  ABC-type multidrug transport system, permease component  33.07 
 
 		 271 aa  137  2e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.436846 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4512  ABC-2 type transporter  34.8 
 
 		 281 aa  135  6.0000000000000005e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4259  ABC-2 type transporter  33.2 
 
 		 282 aa  132  5e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.573247  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8158  ABC-2 type transporter  33.87 
 
 		 272 aa  132  5e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.880228 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4345  ABC-2 type transporter  33.2 
 
 		 282 aa  132  5e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0911686 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4638  ABC-2 type transporter  33.2 
 
 		 282 aa  132  5e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.619797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3922  ABC-2 type transporter  32.53 
 
 		 266 aa  130  1.0000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0348636  normal  0.0335688 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1476  ABC-2 type transporter  33.07 
 
 		 267 aa  130  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4795  ABC-2 type transporter  32.27 
 
 		 284 aa  129  6e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597944 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07250  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  33.73 
 
 		 265 aa  127  1.0000000000000001e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.307058 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1878  ABC-2 type transporter  37.55 
 
 		 273 aa  125  7e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4092  ABC-2 type transporter  34.01 
 
 		 290 aa  125  7e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0130357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1483  ABC-2 type transporter  34.01 
 
 		 269 aa  119  3e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00140227  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3986  ABC-2 type transporter  30.08 
 
 		 280 aa  117  9.999999999999999e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3718  ABC-2 type transporter  31.05 
 
 		 260 aa  114  1.0000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.282288  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3101  ABC-2 type transporter  32.27 
 
 		 266 aa  113  3e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4183  ABC-2 type transporter  31.08 
 
 		 269 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.013923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0542  ABC-2 type transporter  28.75 
 
 		 253 aa  109  5e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0039  ABC-2 type transporter  31.58 
 
 		 267 aa  109  5e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.953662 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19160  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  32.61 
 
 		 319 aa  109  5e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.338631 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24940  ABC-type multidrug transport system, permease component  33.07 
 
 		 284 aa  108  6e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.484855 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4383  ABC-2 type transporter  32.52 
 
 		 253 aa  107  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.557459 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2016  ABC-2 type transporter  30.89 
 
 		 268 aa  107  2e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0058  ABC-2 type transporter  30.36 
 
 		 271 aa  105  5e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0618  ABC-2 type transporter  29.46 
 
 		 267 aa  105  8e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.099686  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8859  ABC transporter permease  30.58 
 
 		 253 aa  103  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18340  ABC-type multidrug transport system, permease component  32.81 
 
 		 282 aa  102  4e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.823039 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5654  ABC-2 type transporter  32.93 
 
 		 267 aa  100  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0895  ABC-2 type transporter  30.65 
 
 		 266 aa  101  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0674  ABC-2 type transporter  28.86 
 
 		 272 aa  100  3e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.890968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4106  ABC-2 type transporter  30.1 
 
 		 293 aa  99.8  3e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4874  ABC-2 type transporter  33.06 
 
 		 253 aa  99.8  4e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0328295 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0959  ABC-2 type transporter  28.81 
 
 		 256 aa  99.4  5e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00197586  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1034  ABC-2 type transporter  30.58 
 
 		 254 aa  99.4  5e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.489208  normal  0.0976555 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1123  ABC-2 type transporter  33.97 
 
 		 275 aa  98.2  9e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7215  ABC transporter (permease)  28.34 
 
 		 247 aa  98.6  9e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.284415 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3149  ABC transporter efflux permease; daunorubicin resistance transmembrane protein  26.12 
 
 		 249 aa  97.1  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0286068  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0014  ABC-2 type transporter  28.77 
 
 		 304 aa  97.4  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3132  ABC-2 type transporter  32.14 
 
 		 248 aa  97.1  2e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.571081  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3239  ABC transporter efflux permease  25.71 
 
 		 249 aa  97.1  3e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3453  ABC transporter, efflux permease protein  25.71 
 
 		 249 aa  97.1  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3492  ABC transporter permease  25.71 
 
 		 249 aa  97.1  3e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.799548  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0497  ABC-2 type transporter  30.14 
 
 		 286 aa  96.7  3e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.779296  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3467  ABC transporter, efflux permease protein  26.12 
 
 		 249 aa  96.3  4e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000810233  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1743  ABC-2 type transporter  31.55 
 
 		 271 aa  96.3  4e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000246748 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1684  ABC-2 type transporter  29.67 
 
 		 251 aa  95.1  9e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3212  ABC transporter efflux permease; daunorubicin resistance transmembrane protein  25.71 
 
 		 249 aa  94.7  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3147  ABC-2 type transporter  27.8 
 
 		 249 aa  94.7  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.145802  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3446  ABC transporter, efflux permease protein  26.25 
 
 		 249 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00692281  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3438  ABC transporter, efflux permease protein  25.42 
 
 		 249 aa  93.2  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1808  ABC transporter, efflux permease protein  25.42 
 
 		 249 aa  93.6  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3016  ABC-2 type transporter  31.12 
 
 		 254 aa  93.2  3e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.021308 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>