More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_18340 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_18340  ABC-type multidrug transport system, permease component  100 
 
 		 282 aa  548  1e-155  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.823039 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1123  ABC-2 type transporter  50.66 
 
 		 275 aa  211  9e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4106  ABC-2 type transporter  34.66 
 
 		 293 aa  130  2.0000000000000002e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4992  ABC-2 type transporter  36.03 
 
 		 270 aa  125  5e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.402209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1473  hypothetical protein  36.16 
 
 		 269 aa  125  6e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.377134  normal  0.24112 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0666  ABC-2 type transporter  35.45 
 
 		 285 aa  122  9e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0014  ABC-2 type transporter  35.2 
 
 		 304 aa  121  9.999999999999999e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0042  ABC-2 type transporter  34.9 
 
 		 266 aa  119  6e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0918  ABC-2 type transporter  36.89 
 
 		 254 aa  118  7.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0497  ABC-2 type transporter  34.73 
 
 		 286 aa  117  1.9999999999999998e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.779296  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1351  ABC-2 type transporter  35.71 
 
 		 272 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0414359  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1697  ABC-2 type transporter  31.25 
 
 		 271 aa  117  3e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1122  ABC-2 type transporter  31.72 
 
 		 285 aa  115  6e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.408605  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0393  ABC-2 type transporter  33.04 
 
 		 274 aa  112  6e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1878  ABC-2 type transporter  34.63 
 
 		 273 aa  112  8.000000000000001e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3103  ABC transporter protein  32.82 
 
 		 280 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00849207 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4656  ABC-2 type transporter  31.98 
 
 		 285 aa  110  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.890125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1483  ABC-2 type transporter  33.03 
 
 		 269 aa  109  4.0000000000000004e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00140227  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4512  ABC-2 type transporter  31.76 
 
 		 281 aa  108  9.000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22030  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  37.5 
 
 		 281 aa  108  1e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1839  ABC-2 type transporter  31.14 
 
 		 266 aa  107  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1937  ABC-2 type transporter  29.55 
 
 		 284 aa  106  3e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.008119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1622  ABC-2 type transporter  31.7 
 
 		 278 aa  105  1e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4795  ABC-2 type transporter  30.47 
 
 		 284 aa  105  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597944 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6250  ABC-2 type transporter  31.8 
 
 		 285 aa  104  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.243116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2021  hypothetical protein  31.8 
 
 		 289 aa  103  4e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.290119  normal  0.988573 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0538  ABC-2 type transporter  29.06 
 
 		 267 aa  102  7e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.690834  hitchhiker  0.000010786 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2897  ABC-2 type transporter  36.19 
 
 		 274 aa  100  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.643507  normal  0.323486 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0340  ABC-2 type transporter  34.98 
 
 		 273 aa  100  3e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.171685  hitchhiker  0.00234396 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0451  ABC-type multidrug transport system, permease component  27.75 
 
 		 269 aa  99.8  4e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0034336  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19160  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  34.67 
 
 		 319 aa  100  4e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.338631 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0937  ABC-2 type transporter  30.5 
 
 		 269 aa  99  7e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5259  ABC-2 type transporter  29.48 
 
 		 277 aa  98.6  9e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4259  ABC-2 type transporter  30.09 
 
 		 282 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.573247  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1504  ABC-2 type transporter  26.36 
 
 		 272 aa  98.2  1e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.457097  normal  0.179064 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4345  ABC-2 type transporter  30.09 
 
 		 282 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0911686 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4638  ABC-2 type transporter  30.09 
 
 		 282 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.619797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3893  ABC-2 type transporter  32.13 
 
 		 242 aa  97.8  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0012751  normal  0.0102027 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0746  ABC-2 type transporter  30.18 
 
 		 280 aa  97.1  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39010  ABC-type multidrug transport system, permease component  31.47 
 
 		 271 aa  97.1  3e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.436846 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2939  ABC-2 type transporter  29.84 
 
 		 286 aa  96.3  4e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.27677 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1384  ABC-2 type transporter  32.83 
 
 		 269 aa  96.3  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.78336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07250  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  33.85 
 
 		 265 aa  94.7  2e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.307058 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2775  ABC-2 type transporter  30.86 
 
 		 278 aa  94  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00783625  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2716  ABC-2 type transporter  32.41 
 
 		 254 aa  93.2  4e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23570  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  33.68 
 
 		 267 aa  93.2  4e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.24456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3922  ABC-2 type transporter  30.37 
 
 		 266 aa  92.8  6e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0348636  normal  0.0335688 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0786  ABC-2 type transporter  31.2 
 
 		 254 aa  92.4  7e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.585621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1342  ABC-2 type transporter  35.57 
 
 		 279 aa  92.4  8e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.333729  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24940  ABC-type multidrug transport system, permease component  31.28 
 
 		 284 aa  92.4  8e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.484855 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0058  ABC-2 type transporter  32.06 
 
 		 271 aa  92.4  8e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4023  ABC-2 type transporter  31.98 
 
 		 267 aa  92  1e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.293949  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3328  ABC-2 type transporter  32.66 
 
 		 281 aa  91.7  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.45338  normal  0.334159 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4056  ABC-2 type transporter  31.98 
 
 		 267 aa  92  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0966  ABC-2 type transporter  32.9 
 
 		 259 aa  91.7  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2294  ABC-2 type transporter  31.31 
 
 		 277 aa  90.9  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.911135  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3916  ABC transporter, inner membrane subunit  31.98 
 
 		 267 aa  91.3  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1476  ABC-2 type transporter  30.8 
 
 		 267 aa  91.3  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3253  ABC transporter related  30.3 
 
 		 265 aa  90.9  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00665342  normal  0.245763 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0039  ABC-2 type transporter  35.57 
 
 		 267 aa  90.5  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.953662 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7215  ABC transporter (permease)  32.26 
 
 		 247 aa  90.1  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.284415 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0674  ABC-2 type transporter  29.22 
 
 		 272 aa  89.4  6e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.890968  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3882  ABC-2 type transporter  30.17 
 
 		 278 aa  89.4  7e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2250  ABC-2 type transporter  32.39 
 
 		 256 aa  88.6  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.239998  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8158  ABC-2 type transporter  30.21 
 
 		 272 aa  87  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.880228 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0062  ABC-2 type transporter  28.89 
 
 		 260 aa  86.7  4e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000566487  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3718  ABC-2 type transporter  31.94 
 
 		 260 aa  86.3  5e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.282288  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1743  ABC-2 type transporter  32.81 
 
 		 271 aa  85.9  7e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000246748 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0906  ABC-2 type transporter  26.11 
 
 		 253 aa  85.5  8e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000570099 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3101  ABC-2 type transporter  31.84 
 
 		 266 aa  85.5  8e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1236  ABC-2 type transporter  34.5 
 
 		 281 aa  85.5  9e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6787  ABC-2 type transporter  30.8 
 
 		 268 aa  85.1  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000212784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4183  ABC-2 type transporter  33.84 
 
 		 269 aa  85.1  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.013923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1593  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  28.23 
 
 		 255 aa  85.5  0.000000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.327285  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8873  ABC-2 type transporter  30.04 
 
 		 270 aa  84.7  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.53633  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0096  ABC-2 type transporter  31.6 
 
 		 247 aa  85.1  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1683  ABC-2 type transporter  31.56 
 
 		 274 aa  84.7  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000181652  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4936  ABC-2 type transporter  31.14 
 
 		 280 aa  84.3  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.707728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4551  ABC-2 type transporter  33.16 
 
 		 264 aa  84  0.000000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.442888  normal  0.0220595 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3137  ABC-2 type transporter  30.33 
 
 		 277 aa  83.2  0.000000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.428202  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1525  ABC-2 type transporter  30.9 
 
 		 290 aa  83.2  0.000000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00118323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2409  ABC-2 type transporter  31.08 
 
 		 253 aa  83.2  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3239  ABC transporter efflux permease  30.73 
 
 		 249 aa  82.8  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3492  ABC transporter permease  30.73 
 
 		 249 aa  82.8  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.799548  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3453  ABC transporter, efflux permease protein  30.73 
 
 		 249 aa  82.8  0.000000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1123  ABC-2 type transporter  30.21 
 
 		 257 aa  82.8  0.000000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1189  ABC-2 type transporter  31.28 
 
 		 263 aa  82.8  0.000000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000916915 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0542  ABC-2 type transporter  31.78 
 
 		 253 aa  82.4  0.000000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1258  ABC-2 type transporter  33.03 
 
 		 300 aa  82  0.000000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4873  ABC-2 type transporter  33.17 
 
 		 298 aa  82  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30730  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  30.37 
 
 		 277 aa  82  0.000000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.364162  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0959  ABC-2 type transporter  31.15 
 
 		 256 aa  82  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00197586  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2043  ABC-2 type transporter  30 
 
 		 279 aa  82  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.167343  hitchhiker  0.00685853 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3467  ABC transporter, efflux permease protein  30.28 
 
 		 249 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000810233  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1966  ABC-2 type transporter  30.16 
 
 		 318 aa  81.6  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.115517  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3149  ABC transporter efflux permease; daunorubicin resistance transmembrane protein  30.28 
 
 		 249 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0286068  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1352  ABC-2 type transporter  32.16 
 
 		 254 aa  80.9  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.137638  normal  0.090478 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0375  ABC-2 type transporter  32.99 
 
 		 264 aa  80.9  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.133292  hitchhiker  0.00534901 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35420  ABC-type multidrug transport system, permease component  29.81 
 
 		 257 aa  81.3  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1755  ABC-2 type transporter  34.83 
 
 		 264 aa  81.3  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.586856  decreased coverage  0.00328589 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>