More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_2409 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_2409  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 253 aa  486  1e-136  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0786  ABC-2 type transporter  48.03 
 
 		 254 aa  232  4.0000000000000004e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.585621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3247  ABC-2 type transporter  42.69 
 
 		 254 aa  181  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.590775 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1533  ABC-2 type transporter  41.37 
 
 		 274 aa  179  2.9999999999999997e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0121  ABC-2 type transporter  43.32 
 
 		 252 aa  174  9.999999999999999e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0240531  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1730  hypothetical protein  40.56 
 
 		 251 aa  161  1e-38  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.45161 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1775  ABC transporter related protein  43.03 
 
 		 249 aa  150  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.254288 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3408  ABC-2 type transporter, permease protein  37.2 
 
 		 243 aa  149  4e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.184246  normal  0.618546 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4200  ABC-2 type transporter  41.55 
 
 		 275 aa  142  4e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.724357  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1958  ABC-2 type transporter  35.55 
 
 		 250 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00055396  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1123  ABC-2 type transporter  34.27 
 
 		 257 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3882  ABC-2 type transporter  34.19 
 
 		 278 aa  124  1e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3137  ABC-2 type transporter  34.7 
 
 		 277 aa  119  4.9999999999999996e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.428202  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0096  ABC-2 type transporter  36.84 
 
 		 247 aa  116  3e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1448  putative ABC transporter transmembrane protein  32.13 
 
 		 252 aa  115  7.999999999999999e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1448  ABC-2 type transporter  31.84 
 
 		 251 aa  109  4.0000000000000004e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0318973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0966  ABC-2 type transporter  33.33 
 
 		 259 aa  107  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0014  ABC-2 type transporter  28.81 
 
 		 304 aa  105  7e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0062  ABC-2 type transporter  27.38 
 
 		 260 aa  102  4e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000566487  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4170  ABC-2 type transporter  34.4 
 
 		 270 aa  100  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4106  ABC-2 type transporter  28.51 
 
 		 293 aa  100  2e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0497  ABC-2 type transporter  30.04 
 
 		 286 aa  94.4  2e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.779296  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3547  ABC-2 type transporter  31.6 
 
 		 259 aa  92.4  6e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.369986 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23570  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  28.51 
 
 		 267 aa  92  7e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.24456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4551  ABC-2 type transporter  29.39 
 
 		 264 aa  88.2  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.442888  normal  0.0220595 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0476  ABC transporter  28.25 
 
 		 261 aa  87.8  2e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0918062 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6126  ABC-2 type transporter  30.43 
 
 		 275 aa  85.5  8e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0365687  normal  0.579785 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3245  multidrug ABC transporter, permease protein  26.41 
 
 		 250 aa  83.6  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.234725  normal  0.0779856 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0340  ABC-2 type transporter  26.77 
 
 		 273 aa  83.6  0.000000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.171685  hitchhiker  0.00234396 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18340  ABC-type multidrug transport system, permease component  29.22 
 
 		 282 aa  82  0.000000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.823039 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0327  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  29.49 
 
 		 249 aa  77.8  0.0000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.315936  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1766  multidrug ABC transporter, permease protein  28.11 
 
 		 242 aa  77.4  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0192  hypothetical protein  31.19 
 
 		 295 aa  77  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.144906 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1755  ABC-2 type transporter  32.37 
 
 		 264 aa  77.4  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.586856  decreased coverage  0.00328589 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1020  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  30.11 
 
 		 249 aa  76.6  0.0000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0552463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1342  ABC-2 type transporter  28.57 
 
 		 279 aa  76.6  0.0000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.333729  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8873  ABC-2 type transporter  27.17 
 
 		 270 aa  77  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.53633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0449  putative multidrug efflux ABC transporter  27.03 
 
 		 274 aa  75.9  0.0000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.603097  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04741  putative multidrug efflux ABC transporter  27.03 
 
 		 274 aa  75.9  0.0000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05051  putative multidrug efflux ABC transporter  27.03 
 
 		 274 aa  75.5  0.0000000000008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.507008  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2561  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  28.4 
 
 		 249 aa  74.7  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.760407 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2775  ABC-2 type transporter  28.46 
 
 		 278 aa  73.9  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00783625  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1473  hypothetical protein  28.24 
 
 		 269 aa  73.2  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.377134  normal  0.24112 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0918  ABC-2 type transporter  25.6 
 
 		 254 aa  73.2  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05121  putative multidrug efflux ABC transporter  27.93 
 
 		 274 aa  73.6  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1384  ABC-2 type transporter  26.7 
 
 		 269 aa  73.2  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.78336  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1426  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  24.87 
 
 		 256 aa  73.2  0.000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0562869  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3861  ABC-2 type transporter  29.02 
 
 		 291 aa  73.2  0.000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.92497  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1079  ABC-2 type transporter  29.09 
 
 		 296 aa  72.8  0.000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4992  ABC-2 type transporter  26.54 
 
 		 270 aa  72.4  0.000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.402209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3574  ABC transporter, permease protein  28 
 
 		 254 aa  72.4  0.000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.426841  normal  0.115682 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1380  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  24.87 
 
 		 256 aa  72.4  0.000000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000932687  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1593  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  27.09 
 
 		 255 aa  72  0.000000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.327285  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0223  hypothetical protein  26.13 
 
 		 251 aa  71.6  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.587044  normal  0.793487 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2056  ABC-2 type transporter  27.57 
 
 		 241 aa  71.6  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.794734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1548  ABC-2 type transporter  29.95 
 
 		 366 aa  70.5  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.299648  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3849  ABC-2 type transporter  27.05 
 
 		 252 aa  70.5  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2250  ABC-2 type transporter  29.41 
 
 		 256 aa  70.9  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.239998  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0906  ABC-2 type transporter  30.77 
 
 		 253 aa  70.9  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000570099 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0388  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.01 
 
 		 249 aa  70.1  0.00000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.169706  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1123  ABC-2 type transporter  27.31 
 
 		 275 aa  70.5  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0363  ABC-2 type transporter  27.34 
 
 		 289 aa  70.1  0.00000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1126  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  24.22 
 
 		 254 aa  69.7  0.00000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.339371  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2407  ABC-2 type transporter  27.56 
 
 		 288 aa  69.3  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000146811  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0375  ABC-2 type transporter  25.49 
 
 		 264 aa  69.3  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.133292  hitchhiker  0.00534901 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0666  ABC-2 type transporter  31.11 
 
 		 285 aa  69.3  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1478  ABC-2 type transporter  24.54 
 
 		 254 aa  69.3  0.00000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4873  ABC-2 type transporter  27.57 
 
 		 298 aa  68.9  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1528  hypothetical protein  25 
 
 		 249 aa  68.9  0.00000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.102699 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0785  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  26.86 
 
 		 253 aa  68.9  0.00000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0380  ABC-2 type transporter  27.67 
 
 		 280 aa  68.6  0.00000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2221  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  26.83 
 
 		 273 aa  68.6  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000454003  normal  0.343798 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3931  ABC-2 type transporter  26.42 
 
 		 263 aa  67.8  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.284935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2298  daunorubicin resistance ABC transporter membrane protein  25.81 
 
 		 264 aa  67.4  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.207913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0287  hypothetical protein  27.91 
 
 		 241 aa  67.4  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.301015  normal  0.184502 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1510  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  26.45 
 
 		 253 aa  67.4  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.525568  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1750  putative multidrug efflux ABC transporter  28.32 
 
 		 277 aa  67  0.0000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0190039  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0037  ABC-2 type transporter  25.82 
 
 		 255 aa  66.2  0.0000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0042  ABC-2 type transporter  25 
 
 		 266 aa  66.2  0.0000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4739  ABC-2 type transporter  29.27 
 
 		 285 aa  65.9  0.0000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0230  ABC-2 type transporter  24.78 
 
 		 256 aa  65.9  0.0000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.214662 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0300  ABC-2 type transporter  26.72 
 
 		 270 aa  65.9  0.0000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1459  ABC-2 type transporter  26.63 
 
 		 249 aa  65.9  0.0000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1170  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  25.32 
 
 		 253 aa  65.5  0.0000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.780816  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35420  ABC-type multidrug transport system, permease component  26.94 
 
 		 257 aa  65.1  0.0000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2157  ABC transporter protein  24.69 
 
 		 284 aa  65.5  0.0000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4031  ABC-2 type transporter  26.24 
 
 		 289 aa  65.1  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.246164  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0612  putative multidrug efflux ABC transporter  30.09 
 
 		 284 aa  65.1  0.000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1802  ABC-2 type transporter  23.62 
 
 		 293 aa  64.7  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.217297  normal  0.454939 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4230  ABC-2 type transporter  31.18 
 
 		 375 aa  64.7  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2186  ABC-2 type transporter  23.62 
 
 		 297 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.189047 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1125  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  32.52 
 
 		 260 aa  64.3  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.742933  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1683  ABC-2 type transporter  27.03 
 
 		 274 aa  64.3  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000181652  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1165  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  26.84 
 
 		 253 aa  63.9  0.000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04481  putative multidrug efflux ABC transporter  25.88 
 
 		 284 aa  64.3  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.86864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1826  ABC-2 type transporter  29.91 
 
 		 233 aa  64.3  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.805602  normal  0.102256 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0251  ABC-2 type transporter  25.25 
 
 		 255 aa  63.5  0.000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.452318 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0025  ABC-2 type transporter  26.24 
 
 		 290 aa  63.5  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1851  ABC-2 type transporter  23.62 
 
 		 297 aa  63.9  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.894723 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1839  ABC-2 type transporter  26.36 
 
 		 266 aa  63.5  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>