More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0251 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0251  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 255 aa  504  9.999999999999999e-143  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.452318 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0230  ABC-2 type transporter  50 
 
 		 256 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.214662 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2171  ABC-2 type transporter  54.46 
 
 		 256 aa  257  1e-67  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_2013  ABC-2 type transporter  52.73 
 
 		 256 aa  244  9e-64  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.0000119274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1034  ABC-2 type transporter  52.34 
 
 		 256 aa  242  3.9999999999999997e-63  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.150436 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0363  ABC-2 type transporter  34.4 
 
 		 289 aa  154  9e-37  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2864  ABC-2 type transporter  33.33 
 
 		 290 aa  149  4e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3245  multidrug ABC transporter, permease protein  32.95 
 
 		 250 aa  124  1e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.234725  normal  0.0779856 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2298  daunorubicin resistance ABC transporter membrane protein  34.69 
 
 		 264 aa  121  9.999999999999999e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.207913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0223  hypothetical protein  34.26 
 
 		 251 aa  120  3e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.587044  normal  0.793487 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0388  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.62 
 
 		 249 aa  116  3e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.169706  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0037  ABC-2 type transporter  31.22 
 
 		 255 aa  115  5e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1020  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  32.16 
 
 		 249 aa  114  1.0000000000000001e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0552463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1766  multidrug ABC transporter, permease protein  31.02 
 
 		 242 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0906  ABC-2 type transporter  30.3 
 
 		 253 aa  112  4.0000000000000004e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000570099 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1126  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  31.48 
 
 		 254 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.339371  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2250  ABC-2 type transporter  31.93 
 
 		 256 aa  112  8.000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.239998  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1459  ABC-2 type transporter  34.7 
 
 		 249 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2056  ABC-2 type transporter  31.33 
 
 		 241 aa  110  3e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.794734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0426  ABC-2 type transporter  32.88 
 
 		 256 aa  109  4.0000000000000004e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1528  hypothetical protein  32.41 
 
 		 249 aa  107  1e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.102699 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0327  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  29.63 
 
 		 249 aa  106  3e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.315936  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4150  hypothetical protein  33.33 
 
 		 261 aa  106  4e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000233601  normal  0.0693377 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1203  ABC-2 type transporter  31.56 
 
 		 251 aa  105  5e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0595438 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2561  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  31.76 
 
 		 249 aa  105  6e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.760407 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1125  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  28.75 
 
 		 260 aa  102  4e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.742933  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0300  ABC-2 type transporter  29.17 
 
 		 270 aa  101  1e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3861  ABC-2 type transporter  33.33 
 
 		 291 aa  100  3e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.92497  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0785  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  29.73 
 
 		 253 aa  99  6e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2221  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  31.91 
 
 		 273 aa  98.6  9e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000454003  normal  0.343798 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2893  ABC-2 type transporter  30.34 
 
 		 270 aa  98.6  9e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0559  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  33.07 
 
 		 264 aa  97.4  2e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1079  ABC-2 type transporter  32.33 
 
 		 296 aa  97.1  3e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0476  ABC transporter  28.46 
 
 		 261 aa  96.3  4e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0918062 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1426  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  31.34 
 
 		 256 aa  96.3  4e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0562869  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1380  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  31.16 
 
 		 256 aa  96.3  4e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000932687  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3574  ABC transporter, permease protein  30.74 
 
 		 254 aa  95.9  5e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.426841  normal  0.115682 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1561  ABC-2 type transporter  32.37 
 
 		 252 aa  95.9  5e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.403911  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5103  ABC-2 type transporter  30.84 
 
 		 281 aa  95.1  9e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00233057  normal  0.427918 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1510  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  29.73 
 
 		 253 aa  95.1  9e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.525568  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4873  ABC-2 type transporter  33.19 
 
 		 298 aa  94  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0192  hypothetical protein  29.06 
 
 		 295 aa  93.6  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.144906 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1165  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  30.18 
 
 		 253 aa  93.6  3e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1123  ABC-2 type transporter  29.46 
 
 		 257 aa  92.4  6e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0497  ABC-2 type transporter  27.49 
 
 		 286 aa  92.4  6e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.779296  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0242  ABC-2 type transporter  29.55 
 
 		 278 aa  92  7e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1478  ABC-2 type transporter  28.84 
 
 		 254 aa  91.3  1e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1170  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  30.41 
 
 		 253 aa  90.1  3e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.780816  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2515  ABC transporter, permease protein  29.77 
 
 		 278 aa  89.4  6e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.551545 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0176  hypothetical protein  30.24 
 
 		 241 aa  88.6  9e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.67071  normal  0.0449558 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0062  ABC-2 type transporter  25.73 
 
 		 260 aa  88.2  1e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000566487  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1593  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  26.89 
 
 		 255 aa  88.2  1e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.327285  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0685  ABC transporter, permease protein  29.74 
 
 		 277 aa  87.4  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.537478  normal  0.14182 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0014  ABC-2 type transporter  28.84 
 
 		 304 aa  87  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2157  ABC transporter protein  26.57 
 
 		 284 aa  87.4  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1358  ABC-2 type transporter  33.48 
 
 		 294 aa  85.5  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.624692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0287  hypothetical protein  29.9 
 
 		 241 aa  85.5  9e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.301015  normal  0.184502 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3518  ABC-2 type transporter  32.82 
 
 		 298 aa  84.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2407  ABC-2 type transporter  27.83 
 
 		 288 aa  84  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000146811  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2588  ABC-2 type transporter  32.82 
 
 		 298 aa  84.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3547  ABC-2 type transporter  26.91 
 
 		 259 aa  83.6  0.000000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.369986 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0427  ABC-2 type transporter  27.27 
 
 		 278 aa  83.6  0.000000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.469533  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4106  ABC-2 type transporter  25.47 
 
 		 293 aa  83.6  0.000000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5948  ABC transporter permease  28.29 
 
 		 284 aa  83.2  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0673459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2794  hypothetical protein  27.19 
 
 		 276 aa  82.8  0.000000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0995371 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0010  ABC-2 type transporter  28.04 
 
 		 280 aa  82.8  0.000000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3931  ABC-2 type transporter  28.11 
 
 		 263 aa  82  0.000000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.284935  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0215  ABC-2 type transporter  29.43 
 
 		 275 aa  80.5  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.716105  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2499  ABC-2 transporter component  31.98 
 
 		 276 aa  79.7  0.00000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2149  ABC-2 type transport system permease protein  30.96 
 
 		 286 aa  78.6  0.0000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.157353 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0786  ABC-2 type transporter  27.48 
 
 		 254 aa  77.4  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.585621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0249  hypothetical protein  27.19 
 
 		 281 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.112673 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2328  transporter, putative  28.57 
 
 		 246 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.117528  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4031  ABC-2 type transporter  28.17 
 
 		 289 aa  76.6  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.246164  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0449  putative multidrug efflux ABC transporter  32.67 
 
 		 274 aa  75.1  0.0000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.603097  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1796  ABC-2 type transporter  24.69 
 
 		 280 aa  74.3  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000116393 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05051  putative multidrug efflux ABC transporter  33.85 
 
 		 274 aa  74.3  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.507008  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04741  putative multidrug efflux ABC transporter  33.33 
 
 		 274 aa  73.6  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6126  ABC-2 type transporter  27.83 
 
 		 275 aa  73.2  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0365687  normal  0.579785 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1851  ABC-2 type transporter  29.22 
 
 		 297 aa  73.2  0.000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.894723 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2186  ABC-2 type transporter  29.22 
 
 		 297 aa  73.2  0.000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.189047 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0030  ABC-2 type transporter  26.15 
 
 		 272 aa  72.8  0.000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2613  ABC-2 type transporter  27.8 
 
 		 270 aa  72.8  0.000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.937981  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0966  ABC-2 type transporter  25.44 
 
 		 259 aa  72.4  0.000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1245  ABC-2 type transporter  28.5 
 
 		 292 aa  72  0.000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0464218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1802  ABC-2 type transporter  28.44 
 
 		 293 aa  72  0.000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.217297  normal  0.454939 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2587  ABC multidrug efflux transporter, inner membrane subunit  28.5 
 
 		 286 aa  71.6  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04481  putative multidrug efflux ABC transporter  27.92 
 
 		 284 aa  71.6  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.86864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1936  ABC-2 type transporter  29.11 
 
 		 286 aa  70.9  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0721  ABC-2 type transporter  30.46 
 
 		 360 aa  70.9  0.00000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00179914  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1533  ABC-2 type transporter  24.29 
 
 		 274 aa  69.7  0.00000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05121  putative multidrug efflux ABC transporter  30.69 
 
 		 274 aa  70.1  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0795  ABC transporter, permease protein  29.89 
 
 		 339 aa  69.3  0.00000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0125503  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1448  putative ABC transporter transmembrane protein  25.52 
 
 		 252 aa  69.3  0.00000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2043  ABC-2 type transporter  30.09 
 
 		 279 aa  69.3  0.00000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.167343  hitchhiker  0.00685853 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4183  ABC-2 type transporter  28.33 
 
 		 269 aa  68.6  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.013923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2668  putative ABC-2 type transporter  25.75 
 
 		 263 aa  68.6  0.00000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.149875  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_701  ABC transporter, permease protein  29.31 
 
 		 360 aa  68.2  0.0000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.222918  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0010  ABC-2 type transporter  31.36 
 
 		 277 aa  67.8  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0265688  normal  0.974707 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2261  ABC-2 type transporter  27.52 
 
 		 260 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.121091  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>