278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_04481 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009976  P9211_04481  putative multidrug efflux ABC transporter  100 
 
 
284 aa  552  1e-156  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.86864  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1750  putative multidrug efflux ABC transporter  77.15 
 
 
277 aa  408  1e-113  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0190039  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0612  putative multidrug efflux ABC transporter  75.27 
 
 
284 aa  385  1e-106  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06471  putative multidrug efflux ABC transporter  74.56 
 
 
284 aa  376  1e-103  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.620136 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05121  putative multidrug efflux ABC transporter  68.38 
 
 
274 aa  361  8e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0449  putative multidrug efflux ABC transporter  69.35 
 
 
274 aa  361  9e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.603097  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05051  putative multidrug efflux ABC transporter  67.41 
 
 
274 aa  358  5e-98  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.507008  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05041  putative multidrug efflux ABC transporter  70.67 
 
 
284 aa  358  5e-98  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.112221 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1781  putative multidrug efflux ABC transporter  70.67 
 
 
284 aa  358  6e-98  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04741  putative multidrug efflux ABC transporter  67.41 
 
 
274 aa  357  9e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1079  ABC-2 type transporter  59.57 
 
 
296 aa  316  4e-85  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2588  ABC-2 type transporter  58.89 
 
 
298 aa  309  2.9999999999999997e-83  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3518  ABC-2 type transporter  58.89 
 
 
298 aa  309  4e-83  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4873  ABC-2 type transporter  59.21 
 
 
298 aa  308  5e-83  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0192  hypothetical protein  59.57 
 
 
295 aa  308  9e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.144906 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2149  ABC-2 type transport system permease protein  61.27 
 
 
286 aa  300  1e-80  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.157353 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3861  ABC-2 type transporter  59.93 
 
 
291 aa  299  3e-80  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.92497  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1358  ABC-2 type transporter  61.89 
 
 
294 aa  295  6e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.624692  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1123  ABC-2 type transporter  31.25 
 
 
257 aa  105  7e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2157  ABC transporter protein  30.23 
 
 
284 aa  104  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0966  ABC-2 type transporter  35.68 
 
 
259 aa  103  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1380  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  31.25 
 
 
256 aa  103  4e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000932687  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1426  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  31.25 
 
 
256 aa  102  1e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0562869  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0785  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  32.26 
 
 
253 aa  99.8  5e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1593  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  29.63 
 
 
255 aa  99.8  5e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.327285  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1478  ABC-2 type transporter  31.13 
 
 
254 aa  99.4  6e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1510  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  32.72 
 
 
253 aa  98.6  1e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.525568  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2407  ABC-2 type transporter  31.6 
 
 
288 aa  97.8  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000146811  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1165  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  33.64 
 
 
253 aa  95.9  7e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1766  multidrug ABC transporter, permease protein  28.69 
 
 
242 aa  95.1  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0062  ABC-2 type transporter  29.63 
 
 
260 aa  95.1  1e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000566487  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0223  hypothetical protein  30.62 
 
 
251 aa  95.1  1e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.587044  normal  0.793487 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0363  ABC-2 type transporter  28.93 
 
 
289 aa  92.4  7e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0476  ABC transporter  28.57 
 
 
261 aa  92  1e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0918062 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1170  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  29.82 
 
 
253 aa  89.7  5e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.780816  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2056  ABC-2 type transporter  29.44 
 
 
241 aa  89.4  6e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.794734  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0014  ABC-2 type transporter  28.52 
 
 
304 aa  87  3e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0176  hypothetical protein  30.94 
 
 
241 aa  86.3  5e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.67071  normal  0.0449558 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5103  ABC-2 type transporter  27.47 
 
 
281 aa  85.9  6e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00233057  normal  0.427918 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4106  ABC-2 type transporter  27.34 
 
 
293 aa  85.5  9e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0685  ABC transporter, permease protein  30.8 
 
 
277 aa  85.1  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.537478  normal  0.14182 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2864  ABC-2 type transporter  27.16 
 
 
290 aa  84.7  0.000000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1123  ABC-2 type transporter  30.45 
 
 
275 aa  84  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1203  ABC-2 type transporter  29.38 
 
 
251 aa  83.6  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0595438 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0287  hypothetical protein  29.82 
 
 
241 aa  83.6  0.000000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.301015  normal  0.184502 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0427  ABC-2 type transporter  28.27 
 
 
278 aa  82.4  0.000000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.469533  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0010  ABC-2 type transporter  28.35 
 
 
280 aa  82  0.000000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0242  ABC-2 type transporter  27.92 
 
 
278 aa  81.6  0.00000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3245  multidrug ABC transporter, permease protein  29.41 
 
 
250 aa  81.3  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.234725  normal  0.0779856 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4150  hypothetical protein  25.79 
 
 
261 aa  81.3  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000233601  normal  0.0693377 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0786  ABC-2 type transporter  26.46 
 
 
254 aa  80.9  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.585621  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0380  ABC-2 type transporter  30.17 
 
 
280 aa  80.9  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3574  ABC transporter, permease protein  30 
 
 
254 aa  80.1  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.426841  normal  0.115682 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23570  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  28.63 
 
 
267 aa  79.7  0.00000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.24456  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2250  ABC-2 type transporter  26.48 
 
 
256 aa  79  0.00000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.239998  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2515  ABC transporter, permease protein  29.55 
 
 
278 aa  78.2  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.551545 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4739  ABC-2 type transporter  29.55 
 
 
285 aa  78.6  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2561  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  29.91 
 
 
249 aa  78.2  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.760407 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1126  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  26.17 
 
 
254 aa  77.8  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.339371  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2794  hypothetical protein  30.97 
 
 
276 aa  77.8  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0995371 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0906  ABC-2 type transporter  28.22 
 
 
253 aa  76.3  0.0000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000570099 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0613  ABC-2 type transporter  32.53 
 
 
369 aa  76.3  0.0000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2171  ABC-2 type transporter  28.7 
 
 
256 aa  75.9  0.0000000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1448  putative ABC transporter transmembrane protein  28.06 
 
 
252 aa  75.9  0.0000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3547  ABC-2 type transporter  30.53 
 
 
259 aa  75.5  0.0000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.369986 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3882  ABC-2 type transporter  27.66 
 
 
278 aa  75.5  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0251  ABC-2 type transporter  29.88 
 
 
255 aa  75.1  0.000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.452318 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2298  daunorubicin resistance ABC transporter membrane protein  27.66 
 
 
264 aa  74.3  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.207913  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0010  ABC-2 type transporter  28.31 
 
 
277 aa  74.7  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0265688  normal  0.974707 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1020  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  26.46 
 
 
249 aa  74.7  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0552463  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0497  ABC-2 type transporter  27.55 
 
 
286 aa  73.6  0.000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.779296  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1561  ABC-2 type transporter  28.24 
 
 
252 aa  73.2  0.000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.403911  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0230  ABC-2 type transporter  29.41 
 
 
256 aa  72.8  0.000000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.214662 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0426  ABC-2 type transporter  30.56 
 
 
256 aa  72.4  0.000000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6126  ABC-2 type transporter  31 
 
 
275 aa  72  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0365687  normal  0.579785 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3408  ABC-2 type transporter, permease protein  28.33 
 
 
243 aa  71.6  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.184246  normal  0.618546 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18340  ABC-type multidrug transport system, permease component  31.44 
 
 
282 aa  71.6  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.823039 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2667  ABC transporter  29.46 
 
 
263 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0137793  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0300  ABC-2 type transporter  26.72 
 
 
270 aa  70.9  0.00000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1528  hypothetical protein  27.16 
 
 
249 aa  71.2  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.102699 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5948  ABC transporter permease  26.85 
 
 
284 aa  71.2  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0673459  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1851  ABC-2 type transporter  27.93 
 
 
297 aa  70.5  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.894723 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5259  ABC-2 type transporter  28.31 
 
 
277 aa  70.5  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2186  ABC-2 type transporter  27.93 
 
 
297 aa  70.5  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.189047 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0918  ABC-2 type transporter  30.18 
 
 
254 aa  70.1  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1802  ABC-2 type transporter  27.48 
 
 
293 aa  70.1  0.00000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.217297  normal  0.454939 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4551  ABC-2 type transporter  28.05 
 
 
264 aa  70.1  0.00000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.442888  normal  0.0220595 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4031  ABC-2 type transporter  26.96 
 
 
289 aa  70.1  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.246164  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1459  ABC-2 type transporter  27.75 
 
 
249 aa  69.7  0.00000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0723  ABC-2 type transporter  29.02 
 
 
272 aa  69.7  0.00000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0756908 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0327  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  26.45 
 
 
249 aa  69.7  0.00000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.315936  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1697  ABC-2 type transporter  25.78 
 
 
271 aa  69.7  0.00000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2221  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  29.05 
 
 
273 aa  69.3  0.00000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000454003  normal  0.343798 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3132  ABC-2 type transporter  30.57 
 
 
248 aa  69.3  0.00000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.571081  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3096  ABC-2 type transporter  29.46 
 
 
263 aa  69.3  0.00000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3136  ABC-2 type transporter  29.6 
 
 
263 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2499  ABC-2 transporter component  30.81 
 
 
276 aa  67.4  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0388  ABC efflux pump, inner membrane subunit  26.17 
 
 
249 aa  67.4  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.169706  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4992  ABC-2 type transporter  24.35 
 
 
270 aa  67.4  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.402209  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2261  ABC-2 type transporter  25.22 
 
 
260 aa  67  0.0000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.121091  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>